Après la fondation de l'hospice des Enfants-Rouges, la rue prend le nom de ce dernier en 1536. Après la disparition de l'établissement, réuni à l'hôpital des Enfants-Trouvés de Paris, elle reprend son nom d'origine.
La largeur de la rue est fixée à 8,50 m en 1799 et 11 m en 1835[1]. L'alignement de la rue pour former un grand axe traversant le Marais est déclaré d'utilité publique le [2]. Cet alignement n'a toutefois pas été exécuté.
En 1805, elle est de nouveau dénommée « rue des Enfants-Rouges[1] ».
La rue est incorporée à la rue des Archives en 1874[3].
↑Adolphe Alphand (dir.), Adrien Deville et Émile Hochereau, Ville de Paris : recueil des lettres patentes, ordonnances royales, décrets et arrêtés préfectoraux concernant les voies publiques, Paris, Imprimerie nouvelle (association ouvrière), , « Décret du 23 mai 1863 », p. 348.