Né en 1883 à Paris, Pola Gauguin est le plus jeune des cinq fils de Paul Gauguin et de sa femme Mette Sophie Gad (1850-1920). Il est le cadet d'Émile Gauguin (1874–1955), Aline Gauguin (1877–1897) , Clovis Gauguin (1879–1900) et Jean-René Gauguin (1881–1961). En 1884, alors qu'il n'a qu'un an, sa famille déménage au Danemark. L'année suivante, son père retourne sans eux à Paris et ils sont éduqués par leur mère et ses parents. Il n'a plus aucun contact avec son père après 1890.
Il fonde à Oslo une école d'art qu'il gère jusqu'en 1924, mais traversant une crise artistique durant les années 1920, il devient journaliste et collabore aux journaux Dagbladet, Tidens Tegn, Verdens Gang et Ekstra Bladet.
Il épouse Ingrid Blehr (1881-1959) en 1910 et est le père du peintre et sculpteur Paul René Gauguin (1911-1976).