Les Derniers Seigneurs, le premier tome de la série Bushido, paru aux éditions Pointe Noire en 2002, est sa première publication en album. Cet éditeur ayant par la suite déposé le bilan, le deuxième tome de la série, intitulé Gaïjin-San, est publié en 2003 par les éditions Paquet et c'est le début d'une fructueuse collaboration entre l'éditeur suisse et Michel Koeniguer[3].
Après la trilogie Bushido (2002-2004) parait la trilogie Brooklyn 62nd, de 2005 à 2007. Toujours chez le même éditeur, Michel Koeniguer va alors se spécialiser dans le domaine des récits de guerre : d'une part, la guerre d'Irak avec The Bridge (2008) et d'autre part, la guerre du Viêt Nam avec la trilogie Bomb road[4] puis également avec la trilogie Misty Mission, à partir de 2016[5]. Entretemps, l'auteur a scénarisé la série policière Eightball hunter, avec Callixte au dessin (deux albums publiés en 2010 puis en 2013).
En 2018, il s'intéresse à la période de la Seconde Guerre mondiale et commence son travail pour le lancement de Berlin sera notre tombeau, série en trois tomes qui relate la fin des SS français[6], toujours chez le même éditeur, les éditions Paquet. Le premier tome est publié en 2019 et le deuxième en 2020.
Alors qu'il travaillait encore sur le troisième tome de Berlin sera notre tombeau, Michel Koeniguer meurt le 6 avril 2021 des suites d'une longue maladie après des semaines d'hospitalisation[2],[7].
Michel Koeniguer ayant laissé de son vivant les 20 premières planches de Les Derniers Païens (troisième et dernier tome de Berlin sera notre tombeau), mais aussi le scénario ainsi que les storyboards au complet, c'est le dessinateur Vincenzo Giordano qui termine les planches 21 à 48 de l'album. Ce troisième et dernier tome est finalement publié à titre posthume en avril 2022.