Né à Volta Redonda au Brésil, Jeffinho est formé par le Resende FC(en), où il commence sa carrière professionnelle[1],[2],[3]. Il joue son premier match avec l'équipe première du club de Resende le , entrant en jeu et marquant le deuxième but de son équipe lors d'une victoire 2-0 en Campeonato Carioca à l'extérieur contre Madureira[4].
Le 31 janvier 2023, il s’engage avec l’Olympique lyonnais jusqu’en 2027 contre une indemnité de 10 millions d’euros[9].
Le 28 février 2023, pour sa première titularisation, il marque son premier but avec l'OL lors d'un quart de finale de Coupe de France face à Grenoble[10].
Le 3 juin 2023, lors de sa neuvième apparition en Ligue 1, Jeffinho inscrit son premier but dans le championnat français face à Nice[11].
Début janvier 2024, il quitte l'OL. Il rejoint son ancien club de Botafogo au Brésil, sous la forme d'un prêt jusqu'à la fin de l'année 2024[12]. Début janvier de l'année suivante, il y est définitivement transféré pour 5,3 millions d'euros et un « intéressement de 30 % sur un éventuel futur transfert »[13].