En 1955, il fonde le Monteverdi-Chor de Hambourg avec qui il a enregistré pour Archiv Produktion, mettant en avant les œuvres de Claudio Monteverdi. Il donne avec l'ensemble des concerts tant en Europe qu'aux États-Unis[2].
Plus tard, le chœur participe à une partie du projet d'intégrale pour Telefunken/Teldec des cantates de Bach avec le Leonhardt-Consort.
Anton Bruckner, Musique de la période de St Florian, Jürgen Jürgens, Monteverdi-Chor de Hambourg, orchestre de chambre d'Israël – LP : Jérusalem Records ATD 8503, 1984 (Bruckner Archive Production), transféré sur CD : BSVD-0109, 2011
Anton Bruckner, Musique de la période de St Florian (II), Jürgen Jürgens, Monteverdi-Chor et Camerata Academica de Hambourg, 1985 – originellement non édité, CD : BSVD-0111 (Bruckner Archive Production), 2012
Alain Pâris (dir.), Dictionnaire des interprètes et de l'interprétation musicale au XXe siècle, Paris, Laffont, coll. « Bouquins », (réimpr. 1985, 1989, 1995, 2004), 5e éd. (1re éd. 1982), 1278 p. (ISBN2-221-08064-5, OCLC901287624, lire en ligne), p. 440–441.