Le 6 juillet 2018, il est échangé avec les Lakers de Los Angeles contre un second tour de la draft 2019 et de l'argent[7]. Dans la foulée de l'échange, il signe un contrat rookie avec la franchise californienne[8]. Durant sa saison rookie, il fait des aller-retour en G-League au sein de l'équipe des Lakers de South Bay[9].
À l'issue de la saison 2020-2021 où il a été en moyenne utilisé que 10,8 minutes par match pour une moyenne finale de 2 points par match et 1,7 rebonds en 40 matches joués, il n'est pas prolongé par les Wizards et se retrouve donc agent libre à partir du 1er août 2021[11].
Raptors de Toronto (2021-2022)
Agent libre, il s'engage le 11 août 2021 avec les Raptors de Toronto[12]. Le 9 novembre 2021, il est assigné en G League chez les Raptors 905[13]. Après un retour en NBA, il retourne en G league le 2 décembre 2021[14]. Le 9 janvier 2022, il inscrit 22 points et prend 17 rebonds faisant ainsi un double-double face aux Mad Ants de Fort Wayne[15]. Le 13 janvier 2022, il se blesse au coude face au Go-Go de Capital City et va manquer quelques jours[16]. Il revient le 23 janvier 2022 pour une victoire face au Charge de Cleveland[17] et le même jour, il est rappelé par les Raptors pour disputer le match face au Trail Blazers de Portland[18]. Le 27 janvier 2022, il inscrit 22 points, prend 6 rebonds et donne 6 passes décisives lors de la victoire des Raptors 905 face aux Cruise de Motor City[19].
À l'issue de la saison 2021-2022, il n'est pas prolongé par la franchise canadienne et devient agent libre[20].
Bayern Munich (2022-2024)
Bonga revient en Allemagne et s'engage pour deux saisons avec le Bayern Munich, club qui participe à l'EuroLigue[21]. Il dispute son premier match avec le Bayern le 28 octobre 2022 en Euroligue face au KK Crvena Zvezda Beograd en jouant 18 minutes pour seulement 3 rebonds[22]. Deux jours plus tard, il débute en tant que titulaire en Bundesliga face au Crailsheim Merlins en jouant 24 minutes pour 6 points et 8 rebonds[23]. Le 3 novembre 2022, il inscrit 12 points et prend 8 rebonds en 27 minutes de jeu lors de la 6e journée d'Euroligue face à l'Anadolu Efes, aidant le Bayern a remporté sa première victoire de la saison en 6 matchs d'Euroligue[24]. Le 27 novembre 2022, il réalise son premier double-double de la saison face au Wurtzbourg Baskets avec 18 points et 10 rebonds[25]. Il réalise son record de points de la saison le 5 février 2023 avec 28 points lors de la défaite des siens face au Telekom Baskets Bonn[26]. Isaac Bonga conclue sa saison avec 30 matchs d'Euroligue pour des moyennes par match de 6,4 points, 3,9 rebonds et 1,1 passe décisive en environ 20 minutes de jeu avec un record de 16 points face à l'Olympiakós, ainsi que 35 matchs de Bundesliga pour des moyennes par match de 8,8 points, 5,1 rebonds et 1,7 passe décisive en 22 minutes de jeu[27].
Il fête sa première sélection à l'âge de 18 ans le 23 février 2018 face à la Serbie et devient le plus jeune joueur de la sélection de l'histoire[31].
Il participe avec la sélection allemande aux Jeux olympiques de Tokyo 2020[32]. Les allemands sont éliminés en quart de finale par la Slovénie sur le score de 94 à 70[33].
En juin 2023, il est pré-sélectionné avec l'Allemagne pour préparer la Coupe du Monde 2023[34].
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