Il devient professeur titulaire en physique - géophysique externe à l'École normale supérieure de l'université de Koudougou le [4]. Il est directeur de laboratoire de recherche en énergétique et météorologie de l'espace et est également vice-président chargé des enseignements et des innovations pédagogiques de l'UNZ[5].
[Sanga 2018] Boureima Sanga, « Q&R : Frédéric Ouattara, meilleur physicien africain de l'espace », SciDev.Net, (lire en ligne).
[Sidwaya 2020] BM. Sidwaya, « Pr Frédéric Ouattara, concepteur de Burkina Sat-1 : « le contrôle de l’espace va résoudre les problèmes fondamentaux des Burkinabè » », Sidwaya, (lire en ligne)
↑Ouattara, F., Contribution à l’étude des relations entre les deux composantes du champ magnétique solaire et l’ionosphère équatoriale, Université Cheikh Anta Diop, Dakar, le 3 octobre 2009
↑Nikiema 2015, I.4 : « Le sixième décret nomme Monsieur Frédéric OUATTARA, Mle 58 532 V, Professeur titulaire en Physique : Géophysique externe à l’Ecole normale supérieure (ENS) de l’Université de Koudougou, pour compter du 22 juillet 2014. ».
↑Laurentine Bayala, « Science: le Pr Frédéric Ouattara, honoré d’un prix aux Etats-Unis pour son excellence dans la recherche en sciences physiques et spatiales », Radiodiffusion-Télévision du Burkina, (lire en ligne, consulté le )
↑Sophie Douce, « Frédéric Ouattara, l’astrophysicien qui veut mettre le Burkina Faso en orbite », Le Monde, (lire en ligne, consulté le )