Fondé en 1970 sous le nom de Matsuyama Soccer Club. En 2001, le nom de l'équipe a été changé en Ehime FC, et en 2006, il rejoint la J.League avec la J.League 2. En 2021 après 15 ans en deuxième division le club finit 20e et est relégué pour la première fois en J.League 3[1]. C'est après deux saisons en J.League 3 (avec une septième place en 2022) que c'est lors de la saison 2023 que le club gagne son premier titre en remportant la J.League 3.
L'emblème incorpore les montagnes Ishizuchi, qui est le symbole d'Ehime, dans le cadre du bouclier, et le rouge-gorge, un oiseau préfectoral, tient fermement le ballon au centre. En arrière-plan, une vague rappelant la mer intérieure de Seto est également représentée[1].
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