Dihydrolipoyl déshydrogénase
Structure d'une E3 humaine (PDB 1ZY8 [ 1] )
Caractéristiques générales
Symbole
DLD
N° EC
1.8.1.4
Homo sapiens
Locus
7 q 31.1
Masse moléculaire
54 177 Da [ 2]
Nombre de résidus
509 acides aminés [ 2]
Liens accessibles depuis GeneCards et HUGO .
Entrez
1738
HUGO
2898
OMIM
238331
UniProt
P09622
RefSeq (ARNm )
NM_001289752 , NM_000108 , NM_001289750 , NM_001289751
RefSeq (protéine )
NP_000099.2 , NP_001276679.1 , NP_001276680.1 , NP_001276681.1
Ensembl
ENSG00000091140
PDB
1ZMC , 1ZMD , 1ZY8 , 2F5Z , 3RNM
GENATLAS • GeneTests • GoPubmed • HCOP • H-InvDB • Treefam • Vega
La dihydrolipoyl déshydrogénase (DLD ), également appelée dihydrolipoamide déshydrogénase , est la dernière des trois enzymes du complexe pyruvate déshydrogénase (PDC), du complexe alpha-cétoglutarate déshydrogénase et du complexe 3-méthyl-2-oxobutanoate déshydrogénase , constitués chacun d'une décarboxylase , d'une transacétylase et d'une réductase .
Le complexe pyruvate déshydrogénase
Le PDC catalyse la décarboxylation oxydative du pyruvate en acétyl-CoA , réaction qui réalise notamment la liaison entre la glycolyse et le cycle de Krebs ; les autres enzymes du complexe sont la pyruvate déshydrogénase (E1) et la dihydrolipoamide S-acétyltransférase (E2). Cette réaction s'écrit globalement :
Le mécanisme en est assez complexe, et peut être résumé par le schéma simplifié ci-dessous :
Mécanisme réactionnel du complexe pyruvate déshydrogénase (R = H sur ce schéma) : - la pyruvate déshydrogénase (E1) catalyse les étapes A et B avec la thiamine pyrophosphate (TPP), - la dihydrolipoamide S -acétyltransférase (E2) catalyse l'étape C avec le lipoamide et la coenzyme A (CoA-SH), - la dihydrolipoyl déshydrogénase (E3) catalyse les étapes D et E avec la FAD et la NAD+ .
La dihydrolipoyl déshydrogénase
La DLD est une flavoprotéine qui, outre sa participation aux trois complexes enzymatiques que sont le complexe pyruvate déshydrogénase , le complexe alpha-cétoglutarate déshydrogénase et le complexe 3-méthyl-2-oxobutanoate déshydrogénase , catalyse plus simplement la réduction du lipoamide en dihydrolipoamide .
Son confacteur est la flavine adénine dinucléotide (FAD), qui transfère au nicotinamide adénine dinucléotide (NAD+ ) les deux atomes d'hydrogène libérés par le dihydrolipoamide lors de son oxydation en lipoamide.
Notes et références
↑
(en) Ewa M. Ciszak, Anna Makal, Young S. Hong, Ananthalakshmy K. Vettaikkorumakankauv¶ Lioubov G. Korotchkina et Mulchand S. Patel , « How Dihydrolipoamide Dehydrogenase-binding Protein Binds Dihydrolipoamide Dehydrogenase in the Human Pyruvate Dehydrogenase Complex », Journal of Biochemical Chemistry , vol. 281, no 1, 6 janvier 2006 , p. 648-655 (PMID 016263718 , DOI 10.1074/jbc.M507850200 , lire en ligne )
↑ a et b Les valeurs de la masse et du nombre de résidus indiquées ici sont celles du précurseur protéique issu de la traduction du gène , avant modifications post-traductionnelles , et peuvent différer significativement des valeurs correspondantes pour la protéine fonctionnelle.