La saison 2006-2007 de Pro B est la soixante-huitième édition du deuxième plus haut niveau du championnat de France de basket-ball, la quatorzième sous l'appellation « Pro B ». Les meilleures équipes de la division accèdent à la Pro A la saison suivante.
Vichy, premier de la saison régulière, remporte la finale du championnat contre Quimper, troisième, et est couronné champion de France de Pro B pour la troisième fois. Les auvergnats sont promus en Pro A pour la saison 2007-2008.
Formule
Dix-huit clubs professionnels s'affrontent lors de la saison régulière qui se déroule du 22 septembre2006 au 9 mai2007. Chaque équipe dispute trente-quatre matchs, dont dix-sept à domicile et dix-sept à l'extérieur, soit deux rencontres contre chaque adversaire de la division. À l'issue de la saison, le premier du classement est directement promu en Pro A pour la saison 2007-2008. Les équipes classées 17e et 18e sont reléguées en NM1.
Les huit meilleures équipes de la saison régulière sont qualifiées pour les playoffs et s'affrontent sous forme d'un tournoi qui se tient du 15 mai au 2 juin2007. Les quarts de finale opposent le premier de la saison régulière au huitième, le second au septième, le troisième au sixième et le quatrième au cinquième, et se disputent au meilleur des 3 manches, au même titre que les demi-finales. La finale se tient à la Bercy Arena le 2 juin sur un match sec. L'équipe vainqueur de ce match est couronnée championne de France de Pro B et accède à la Pro A. Si l'équipe championne est également l'équipe ayant remporté la saison régulière, alors l'équipe classée deuxième de la saison est promue en Pro A.
Cette réduction du nombre d'équipe entraîne la relégation en Pro B de trois clubs évoluant en Pro A lors de la saison 2006-2007, au lieu de deux. Les organisateurs sont donc contraints de rendre la 16e place du championnat de Pro B relégable pour conserver un championnat à 18 équipes. Ainsi, Antibes (16e), Mulhouse (17e) et Angers (18e) sont relégués en NM1.
Cette division a été appelée Honneur entre 1932 et 1949, Excellence entre 1949 et 1963, Nationale 2 entre 1963 et 1987, Nationale 1B entre 1987 et 1992, Nationale A2 entre 1992 et 1993 et enfin Pro B depuis 1993. En gris, les saisons où le championnat n'a pas eu lieu.