Fondée en 1887, la ville a été nommée d’après Pierre Bottineau (c. 1814 - 1895), fils de Joseph Bottineau, trappeur franco-canadien. Chasseur et explorateurmétis, grand voyageur, il accompagna les missions de reconnaissance et d'étude dans la région pour l'installation du chemin de fer. Il est mort le [1].
La localité était d’abord située à quelque 2,50 km au nord de son emplacement actuel. La ville entière a été déplacée vers le sud en 1887 là où le Great Northern Railway installait des rails[2].
Selon l’American Community Survey, pour la période 2011-2015, 97,63 % de la population âgée de plus de 5 ans déclare parler l’anglais à la maison, 0,84 % déclare parler l’espagnol, 0,51 % l’allemand et 1,02 % une autre langue[8].
L’hebdomadaire The Bottineau Courant est publié dans la ville. Il a été fondé en 1885 par William Bickman, le premier numéro a été publié le . Le journal s’est d’abord appelé The Pioneer. Il a été fondé quand Bottineau faisait partie du territoire du Dakota (quatre ans avant le territoire devienne un État). En 1895 J. C. Britton a acheté The Pioneer et a changé son nom en Bottineau Courant[10]. Le titre paraît chaque mardi.