Pierre Estève, Nouvelle découverte du principe de l’harmonie, avec un examen de ce que M. Rameau a publié sous le titre de Démonstration de ce principe (1752), édition, introduction et notes par André Charrak, Presses de l’ENS de Fontenay / Saint-Cloud, coll. « Theoria », 1997.
Musique et philosophie à l’âge classique, Paris, PUF, coll. « Philosophies », 1998.
Raison et perception, fonder l'harmonie au XVIIIe siècle, Paris, Vrin, « Mathesis »,
Ouvrage issu de la thèse de doctorat en philosophie (Raison et perception : le problème de la résonance du corps sonore au dix-huitième siècle et ses implications philosophiques) qu'il a soutenue à l'Université de Paris-Sorbonne en 1999 devant Catherine Kintzler, Frédéric de Buzon, Hugues Dufourt, Jean-Luc Marion et Pierre-François Moreau.
Le Vocabulaire de Rousseau, Paris, Ellipses, 2002.
Empirisme et métaphysique. L’Essai sur l’origine des connaissances humaines de Condillac, Paris, Vrin, « Bibliothèque d’histoire de la philosophie », 2003.
Contingence et nécessité des lois de la nature au XVIIIe siècle. La philosophie seconde des Lumières, Paris, Vrin, « Bibliothèque d’histoire de la philosophie », 2006.
Empirisme et théorie de la connaissance. Réflexion et fondement des sciences au XVIIIe siècle, Paris, Vrin, « Bibliothèque d’histoire de la philosophie », 2009.
Rousseau, Emile, ou de l’éducation, introduction et annotation conceptuelle par André Charrak, Paris, Flammarion, coll. « GF », 2009.
Rousseau. De l'empirisme à l'expérience, Paris, Vrin, « Bibliothèque d’histoire de la philosophie », 2013.