Alphacoronavirus 1

Alphacoronavirus suis

Alphacoronavirus 1

Classification

Domaine	Riboviria
Règne	Orthornavirae
Embranchement	Pisuviricota
Classe	Pisoniviricetes
Ordre	Nidovirales
Sous-ordre	Cornidovirineae
Genre	Alphacoronavirus
Sous-genre	Tegacovirus

forme

Alphacoronavirus suis
ICTV[1]

Alphacoronavirus suis, aussi appelé alphacoronavirus 1, est une espèce de coronavirus qui infecte les chats, les chiens et les porcs. Il comprend des espèces précédemment décrites comme le coronavirus félin, le coronavirus canin et le coronavirus de la gastro-entérite transmissible porcine[2]. Il s'agit d'un virus à ARN monocaténaire enveloppé à polarité positive, capable de pénétrer dans sa cellule hôte en se liant au récepteur APN[3].

Il a été reconnu pour la première fois comme un virus causant une gastro-entérite transmissible chez les porcs en 1965. Il s'appelait à l'origine virus de la gastro-entérite transmissible porcine en 1976. Après la découverte ultérieure du coronavirus canin chez le chien et du coronavirus félin chez le chat, les trois virus ont été fusionnés en une seule espèce en 2009.

Découverte

Au milieu des années 1940, une épidémie de maladie porcine a éclaté aux États-Unis, appelée gastro-entérite transmissible, et caractérisée principalement par des diarrhées et des vomissements. Il était soupçonné d'être une infection virale et était extrêmement mortelle chez les jeunes porcs. Leo P. Doyle et LM Hutchings ont rapporté les cas dans le Journal de l'American Veterinary Medical Association en 1946[4]. Le virus a été identifié et isolé par AW McClurkin en 1965[5]. Le Comité international pour la nomenclature des virus (ICNV, rebaptisé plus tard Comité international de taxonomie des virus, ICTV, en 1975) a utilisé le terme virus de la gastro-entérite transmissible du porc dans son premier rapport en 1971, mais l'a renommé Virus de la gastroentérite transmissible porcine (PTGV) dans son deuxième rapport en 1976[2].

Il y a eu un autre cas d'infection à coronavirus chez le chat en 1966. Le virus a provoqué une inflammation de l'abdomen (péritonite) et a été extrêmement mortel[6]. Le virus a été identifié en 1968[7], et a été nommé virus de la péritonite infectieuse féline par ICTV en 1991. Il a de nouveau été renommé coronavirus félin en 1999[8]. En 1974, une épidémie d'infection virale s'est déclarée chez les chiens militaires américains[9]. Le virus a été identifié comme un coronavirus et le nom officiel de coronavirus canin a été adopté par l'ICTV en 1991. Comme la relation moléculaire et antigénique des trois virus a été établie plus tard à la fin des années 1980[10],[11], l'ICTV les a fusionnés en une seule espèce nommée Alphacoronavirus 1 en 2009[2].

Références

1. (en) « Virus Taxonomy: 2023 Release », ICTV, août 2024 (consulté le 16 août 2024).
2. (en) « ICTV Taxonomy history: Alphacoronavirus 1 », International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (consulté le 19 août 2020)
3. « Coronaviruses: an overview of their replication and pathogenesis », Methods in Molecular Biology, Springer, vol. 1282,‎ 2015, p. 1–23 (ISBN 978-1-4939-2438-7, PMID 25720466, PMCID 4369385, DOI 10.1007/978-1-4939-2438-7_1) :

   « See Table 1. »

4. Doyle et Hutchings, « A transmissible gastroenteritis in pigs », Journal of the American Veterinary Medical Association, vol. 108,‎ 1946, p. 257–259 (PMID 21020443, lire en ligne)
5. Mcclurkin, « Studies on transmissible gastroenteritis of swine I. The isolation and identification of a cytopathogenic virus of transmissible gastroenteritis in primary swine kidney cell cultures », Canadian Journal of Comparative Medicine and Veterinary Science, vol. 29,‎ 1965, p. 46–53 (PMID 14290945, PMCID 1494364, lire en ligne)
6. (en) Wolfe et Griesemer, « Feline infectious peritonitis », Pathologia Veterinaria, vol. 3, n^o 3,‎ 1966, p. 255–270 (DOI 10.1177/030098586600300309, lire en ligne)
7. (en) Zook, King, Robison et McCombs, « Ultrastructural evidence for the viral etiology of feline infectious peritonitis », Pathologia veterinaria, vol. 5, n^o 1,‎ 1968, p. 91–95 (DOI 10.1177/030098586800500112, lire en ligne)
8. (en) « ICTV Taxonomy history: Feline infectious peritonitis virus », International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (consulté le 18 août 2020)
9. Binn, Lazar, Keenan et Huxsoll, « Recovery and characterization of a coronavirus from military dogs with diarrhea », Proceedings, Annual Meeting of the United States Animal Health Association, n^o 78,‎ 1974, p. 359–366 (PMID 4377955, lire en ligne)
10. Jacobs, de Groot, van der Zeijst et Horzinek, « The nucleotide sequence of the peplomer gene of porcine transmissible gastroenteritis virus (TGEV): comparison with the sequence of the peplomer protein of feline infectious peritonitis virus (FIPV) », Virus Research, vol. 8, n^o 4,‎ 1987, p. 363–371 (PMID 2829461, PMCID 7134191, DOI 10.1016/0168-1702(87)90008-6, lire en ligne)
11. Hohdatsu, Okada et Koyama, « Characterization of monoclonal antibodies against feline infectious peritonitis virus type II and antigenic relationship between feline, porcine, and canine coronaviruses », Archives of Virology, vol. 117, n^os 1-2,‎ 1991, p. 85–95 (PMID 1706593, PMCID 7086586, DOI 10.1007/BF01310494, lire en ligne)