El número de copias de los plásmidos con el origen de replicación ColE1 se regula mediante dos transcritos de ARN: el ARN II, esencial para iniciar la replicación, y el ARN I, que actúa como su represor. La transcripción del ARN II se inicia a 555 pb aguas arriba del origen, generando un transcrito que forma un híbrido con la cadena molde de ADN. La RNasa H escinde este híbrido, dejando expuesto un grupo 3′OH que sirve como cebador para la ADN polimerasa I. Por otro lado, el ARN I—un transcrito más corto y complementario al extremo 5′ del ARN II—se une a este, alterando su plegamiento y evitando la estabilización y escisión del híbrido. La proteína rop favorece esta unión, reforzando el control sobre la replicación del plásmido.
