La final de ida se jugó el 6 de diciembre del 2000 en el Estadio São Januário, en donde el Vasco da Gama le ganaría por 2 a 0 al Palmeiras. La final de vuelta se jugó el 12 de diciembre del 2000 en el Parque Antártica, en donde el Palmeiras le ganaría por 1 a 0 al Vasco da Gama. Debido a que ambos equipos habían ganado sus respectivos partidos, estaban igualados en puntos, motivo por el cual se tuvo que jugar un tercer partido para definir al campeón. El tercer partido por la final se jugó el 20 de diciembre del 2000 en el Parque Antártica en donde el Vasco da Gama le ganaría por 4 a 3 al Palmeiras —luego de ir perdiendo 3 a 0—, resultado que le permitía al Vasco da Gama consagrarse campeón de la Copa Mercosur, además de dar la vuelta olímpica —debido a que tenía más puntos—. Siendo la segunda y última vuelta olímpica de la Copa Mercosur.
Fue la tercera y última vez que dos equipos de un mismo país jugaban la final de la Copa Mercosur, motivo por el cual, todos los partidos se jugaron en Brasil.
También cabe destacar la histórica remontada del Vasco da Gama ante el Palmeiras en el partido decisivo, ya que luego de ir perdiendo por 3 a 0 en el primer tiempo, le voltearía el partido 4 a 3 en el segundo tiempo en el último minuto con gol de Romário, además de tener un hombre menos. Siendo la única remontada en una final de Copa Mercosur.
Otro dato curioso de esta final, fue que los tres partidos se jugaron a la misma hora (21:45).
Reglamento
La final se jugará en partidos de ida y vuelta.
La final se definirá por puntos, y el equipo que más puntos obtenga luego de haberse jugado los dos partidos será el campeón.
Si en caso ambos equipos terminan igualados en puntos luego de haberse jugado los dos partidos, se jugará un tercer partido, y el ganador de ese encuentro será el campeón.
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