Carlos Pérez Merinero nació en Écija (Sevilla) en 1950 pero, con dos años, la profesión de su padre le llevó a Torre Mornau (Gerona), posteriormente a Cordovilla la Real (Palencia) y Jerez (Cádiz). En esta última ciudad vivió diez años en la Barriada de la Asunción y cursó el bachillerato en el Colegio La Salle de la Alameda Cristina. El 18 de julio de 1966 llegó a Madrid, ciudad en la que residió el resto de su vida y de la que prácticamente no volvió a salir.
Mientras realizaba estudios de Ciencias Económicas participó activamente en la vida cineclubista, fue unos de los fundadores del cineclub ACOP y de la revista Peeping-Tom. Publicó dos poemarios: Prohibido tomar el sol a los lagartos (1972), con el que obtuvo el Premio Calasanz con un jurado formado por José Manuel Caballero Bonald, Ángel García López, Manuel Ríos Ruiz y Eladio Cabañero, y Sol de atardecer que por el río te vas (1972).
Antes de licenciarse en Ciencias Económicas por la Universidad Complutense de Madrid escribió, junto a su hermano David, varios libros sobre cine; algunos de ellos se firmaron bajo el seudónimo de Marta Hernández (colectivo de críticos al que perteneció).
En 1973 comenzó a escribir guiones en solitario, uno de ellos (Juego de niños) interesó al director José Ramón Larraz aunque no llegó a realizarse por su fuerte carga erótica, o en colaboración con Manuel Vidal Estévez. Dirigidos por este último se realizaron Crónica exterior (1976) y Estación de Chamartín (1980).
Durante un breve periodo de tiempo trabajó como profesor en el Real Centro Universitario María Cristina de El Escorial impartiendo la asignatura de Hacienda Pública.
De 1981 a 2011 publicó doce novelas, la mayoría de ellas del género negro. Tras la publicación de Días de guardar en la mítica Colección Negra de la Editorial Bruguera, el productor Pedro Costa entró en contacto con él y requirió su colaboración para distintos proyectos cinematográficos y televisivos.
Participó en los guiones de más de una docena de películas y en los de algunas series para televisión.
En 1997 dirigió, con guion propio, el largometraje protagonizado por Juan Diego, Paulina Gálvez y Aitor Merino Rincones del Paraíso; entre 2001 y 2003 la trilogía rodada en betacam Franco ha muerto. En 2011 realizó en digital Otro cuento de Navidad que no fue montada hasta después de su muerte.
En enero de 2013 con la publicación del guion cinematográfico El grito enterrado de los muertos su hermano David inicia la Colección Carlos Pérez Merinero que reúne, en ediciones no venales, la ingente obra (poemarios, novelas, guiones cinematográficos, obras dramáticas) que dejó inédita.
Con posterioridad a su muerte se han reeditado Días de guardar[4] (Ediciones Reino de Cordelia), Las reglas del juego[5] (El Garaje Ediciones), El ángel triste (Ediciones Vernacci) y La mano armada[6] (Grupo Tierra Trivium), se han publicado Cuentos completos[7] (El Garaje Ediciones) con ilustraciones de Ion Arretxe y las novelas La estrella de la fortuna[8] (Prokomun libros), La santa hermandad[9] (El Garaje Ediciones), Tres corazones[10] (Mandala Ediciones) y ¡Bang! ¡Bang! (Ediciones Mayi).
A finales de 2017 se ha publicado bajo el título Carlos Pérez Merinero: Obra póstuma[11] (Editorial Amarante) un volumen póstumo que recoge sus novelas Salido de madre y La casa de todos.
Sus cenizas descansan en el cementerio de Écija, ciudad en la que nació.
Obra de Carlos Pérez Merinero
Libros sobre cine
Cine español: algunos materiales por derribo (1973)
En pos del cinema (1974)
Cine y control (1974)
Del cinema como arma de clase (1975)
Cine español: ida y vuelta (1976)
Cine español: una reinterpretación (1976)
Colectivo Marta Hernández:
El aparato cinematográfico español (1976)
Treinta años de cine al alcance de todos los españoles (1976)
Novelas
Días de guardar (1981)
Las reglas del juego (1982)
El ángel triste (1983)
La mano armada (1986)
El papel de víctima (1988)
Llamando a las puertas del infierno (Premio Alfa 7 de novela policíaca, 1988)
Las noches contadas (1990)
Desgracias personales (1993)
Razones para ser feliz (1995)
Caras conocidas (2003)
Sangre nuestra (2005)
La niña que hacía llorar a la gente (2010)
La estrella de la fortuna (2016)
La santa hermandad (2017)
Carlos Pérez Merinero: Obra póstuma (2018). Incluye las novelas Salido de madre y La casa de todos.