Cronache dal Trumpistan. Diario di un teologo italiano in America [Chronicles From Trumpistan: A Diary of an Italian Theologian in America] pref. by Brunetto Salvarani (di santa ragione, 9), Di Girolamo, Trapani, 2020.
I mille volti della Maddalena. Saggi e studi (edited), Carocci Ed., Roma, 2020.
Mary Magdalene from the New Testament to the New Age and Beyond (edited and co-authored) Brill, Leiden, 2019. ISBN9789004411067
Chi ha rubato i cieli? Galileo, la Lettera a Cristina e le origini della modernità (co-edited with Paolo Ponzio), Edizioni di Pagina, Bari, 2019.
Golden Calf Traditions in Early Judaism, Christianity, and Islam (co-edited with Eric F. Mason and co-authored) (TBN, 23), Brill, Leiden/Boston, 2018. ISBN9789004386754
Where Have All the Heavens Gone? Galileo’s Letter to the Grand Duchess Christina (co-edited with John P. McCarthy), Cascade Books, Eugene (OR), 2017.
Una sposa per Gesù. Maria Maddalena tra antichità e postmoderno (edited and co-authored) (Frecce, 241), Carocci Ed., Rome, 2017 (repr. 2018, 2019).
In nome di Dio. Storie di una conquista (Biblioteca di cultura religiosa 72), Paideia, Brescia, 2014.
translated into English as In the Name of God: the making of global Christianity Transl. by Giovanna Lammers, Revised by the Author, with J. Hooten and A. Kunder, Wm. B. Eerdmans Publ. Co., Grand Rapids (MI) / Cambridge (UK), 2011.ISBN9780802840172
Giovanni e Gesù. Storia di un antagonismo (Frecce 161), Carocci, Rome, 2013. ISBN9788839404145
A Commentary to the Apocalypse of John, Transl. by Maria Poggi Johnson and Adam Kamesar, Wm. B. Eerdmans Publ. Co., Grand Rapids (MI) / Cambridge (UK), 2006. ISBN9780802860736
Identità e conquista. Esiti e conflitti di un'evangelizzazione, Edizioni Dehoniane, Bologna, 2005.
The Mandaeans: The Last Gnostics (ITSORS), W. B. Eerdmans Publ. Co., Grand Rapids (MI) / Cambridge (UK) 2002. ISBN9780802839244
L'Apocalisse di Giovanni (Scrittori Greci e Latini), Fondazione Lorenzo Valla - A. Mondadori Editore, Milano 1999, 5th reprint 2009. English edition, Wm. B. Eerdmans Publ. Co., Grand Rapids, MI (2006).
"Fra Gerusalemme e Roma," in G. Filoramo - D. Menozzi, Storia del Cristianesimo, vol. I: L'Antichità, Roma-Bari 1997, pp. 3-137. 6th reprint 2009.
Gesù Cristo e gli altri dei. Diffusione e modificazione del cristianesimo nei paesi extraeuropei (Oscar Saggi, 394), Milano, Mondadori, 1994.
I Mandei. Gli ultimi gnostici (Biblioteca di Cultura Religiosa, 61), Brescia, Paideia 1993, pp. 352. Reprint 2010. English edition: The Mandaeans: The Last Gnostics (Wm. B. Eerdmans Publ. Co., Grand Rapids, MI), 2002.
Giovanni e Gesù. Storia di un antagonismo (Uomini e Religioni, 60), Milano, Mondadori 1991.
Giovanni Battista nelle tradizioni sinottiche (Studi Biblici, 82), Brescia, Paideia 1988.
Il cielo è il mio trono. Isaia 40,12 e 66,1 nella tradizione testimoniaria (Temi e Testi, 28), Roma, Ed. di Storia e Letteratura 1980.