Sein Forschungsschwerpunkt ist die Verfassungs-, Sozial- und Wirtschaftsgeschichte des mitteldeutschen Raumes vom Spätmittelalter bis in die frühe Neuzeit. In seiner Dissertation befasste er sich mit den demographischen, wirtschaftlichen und sozialen Verhältnissen im Amt Grimma von 1485 bis 1548.[1] Er unternimmt den „Versuch [...], die ländliche Gesellschaft“ des Amtes Grimma „in ihrer Totalität zu erfassen“.[2] Schirmer behandelt in seiner Dissertation in vier großen Kapiteln Bevölkerungsentwicklung und Sozialstruktur, Agrargeschichte, Alltags- und Sozialgeschichte, Handelsgeschichte sowie in zwei kleineren Abschnitten Brauwesen, Preis- und Lohnanalyse.
Das Amt Grimma 1485 bis 1548. Demographische, wirtschaftliche und soziale Verhältnisse in einem kursächsischen Amt am Ende des Mittelalters und zu Beginn der Neuzeit (= Schriften der Rudolf-Kötzschke-Gesellschaft. Band 2). Sax, Beucha 1996, ISBN 3-930076-22-5.
Kursächsische Staatsfinanzen (1456–1656). Strukturen – Verfassung – Funktionseliten (= Quellen und Forschungen zur sächsischen Geschichte. Band 28). Steiner, Stuttgart 2006, ISBN 3-515-08955-1.
Der Finanz- und Messeplatz Leipzig vom 13. bis zur Mitte des 17. Jahrhunderts. Geldwesen – Waren- und Zahlungsverkehr – Rentengeschäfte (= Abhandlungen der Sächsischen Akademie der Wissenschaften zu Leipzig, Philologisch-historische Klasse. Band 85, Heft 2). Sächsische Akademie der Wissenschaften zu Leipzig, Leipzig 2021, ISBN 978-3-7776-3025-0.
Landstände im thüringisch-obersächsischen Raum (1231–1498). Ein Beitrag zur Geschichte des mitteldeutschen Hoch- und Niederadels (= Jenaer Mediävistische Vorträge. Band 8). Steiner, Stuttgart 2021, ISBN 978-3-515-12955-8.
Herausgeberschaften
Sachsen 1763 bis 1832. Zwischen Rétablissement und bürgerlichen Reformen (= Schriften der Rudolf-Kötzschke-Gesellschaft. Band 3). Sax, Beucha 1996, ISBN 3-930076-23-3.
Sachsen im 17. Jahrhundert. Krise, Krieg und Neubeginn (= Schriften der Rudolf-Kötzschke-Gesellschaft. Band 5). Sax, Beucha 1998, ISBN 3-930076-67-5.
mit André Thieme: Beiträge zur Verfassungs- und Verwaltungsgeschichte Sachsens. Ausgewählte Aufsätze von Karlheinz Blaschke herausgegeben aus Anlaß seines 75. Geburtstages (= Schriften zur sächsischen Geschichte und Volkskunde. Band 5). Leipziger Universitätsverlag, Leipzig 2002, ISBN 3-935693-82-6.
mit Jörg Rogge: Hochadlige Herrschaft im mitteldeutschen Raum (1200 bis 1600). Formen – Legitimation – Repräsentation (= Quellen und Forschungen zur Sächsischen Geschichte. Band 23). Verlag der Sächsischen Akademie der Wissenschaften, Stuttgart 2003, ISBN 3-515-08245-X.
mit Joachim Emig, André Thieme, Guntram Martin: Der Altenburger Prinzenraub 1455. Strukturen und Mentalitäten eines spätmittelalterlichen Konflikts (= Saxonia. Band 9). 2., korrigierte und ergänzte Auflage. Sax, Beucha 2008, ISBN 978-3-86729-021-0.
mit Joachim Emig, Volker Leppin: Vor- und Frühreformation in thüringischen Städten (1470–1525/30) (= Quellen und Forschungen zu Thüringen im Zeitalter der Reformation. Band 1). Böhlau, Köln u. a. 2013, ISBN 978-3-412-20921-6.
mit Armin Kohnle, Christina Meckelnborg: Georg Spalatin. Steuermann der Reformation, Begleitband zur Ausstellung „Georg Spalatin – Steuermann der Reformation“ in Altenburg vom 18. Mai bis 2. Nov. 2014. Mitteldeutscher Verlag, Halle (Saale) 2014, ISBN 978-3-936300-98-7.
mit Armin Kohnle: Kurfürst Friedrich der Weise von Sachsen. Politik, Kultur und Reformation (= Quellen und Forschungen zur sächsischen Geschichte. Band 40). Steiner, Stuttgart 2015, ISBN 3-515-11282-0.
mit Werner Greiling, Ronny Schwalbe: Der Altar von Lucas Cranach dem Älteren in Neustadt an der Orla und die Kirchenverhältnisse im Zeitalter der Reformation (= Quellen und Forschungen zu Thüringen im Zeitalter der Reformation. Band 3). Böhlau, Köln u. a. 2014, ISBN 978-3-412-22341-0.
mit Enno Bünz, Werner Greiling: Thüringische Klöster und Stifte in vor- und frühreformatorischer Zeit (= Quellen und Forschungen zu Thüringen im Zeitalter der Reformation. Band 6). Böhlau Verlag, Köln u. a. 2017, ISBN 978-3-412-50807-4.
mit Werner Greiling, Thomas T. Müller: Reformation und Bauernkrieg (= Quellen und Forschungen zu Thüringen im Zeitalter der Reformation. Band 12). Böhlau, Köln u. a. 2019, ISBN 978-3-412-51167-8.
mit Leonhard Helten, Anke Neugebauer: Niederadlige Herrschaftskulturen. Legitimationen – Repräsentationen – Strategien (= Junges Forum Leucorea. Band 4). Mitteldeutscher Verlag, Halle (Saale) 2021, ISBN 978-3-96311-532-5.
↑Uwe Schirmer: Das Amt Grimma 1485 bis 1548. Demographische, wirtschaftliche und soziale Verhältnisse in einem kursächsischen Amt am Ende des Mittelalters und zu Beginn der Neuzeit. Beucha 1996, S. 9.