Darwinismus und Botanik: Rezeption, Kritik und theoretische Alternativen im Deutschland des 19. Jahrhunderts. Stuttgart: Deutscher Apotheker-Verlag, 1989 (Dissertation, Universität Marburg, 1989); 2., korrigierte und ergänzte Auflage: Der Darwinismus-Streit in der deutschen Botanik: Evolution, Wissenschaftstheorie und Weltanschauung im 19. Jahrhundert. Norderstedt: Books on Demand, 2011, ISBN 978-3-8423-1321-7.
mit Marsha Richmond: Charles Darwins Briefwechsel mit deutschen Naturforschern: Ein Kalendarium mit Inhaltsangaben, biographischem Register und Bibliographie (= Acta biohistorica. Bd. 1). Marburg: Basilisken-Presse, 1996, ISBN 3-925347-39-9.
mit Uwe Hoßfeld: Die Entdeckung der Evolution: Eine revolutionäre Theorie und ihre Geschichte. Darmstadt: Wissenschaftliche Buchgesellschaft, 2001, ISBN 3-534-14208-X; 2., durchgesehene und korrigierte Auflage 2009, ISBN 978-3-534-22394-7.
Die zweite Darwinsche Revolution: Geschichte des synthetischen Darwinismus in Deutschland 1924 bis 1950 (= Acta biohistorica. Bd. 8). Marburg: Basilisken-Presse, 2004, ISBN 3-925347-67-4 (Habilitationsschrift, Universität Tübingen, 2001).
Kreationisten erklären die Evolution: Das „kritische Lehrbuch“ von R. Junker und S. Scherer. In: Martin Neukamm (Hrsg.): Evolution im Fadenkreuz des Kreationismus. Darwins religiöse Gegner und ihre Argumentation (= Religion, Theologie und Naturwissenschaft. Bd. 19). Göttingen: Vandenhoeck & Ruprecht, 2009, ISBN 978-3-525-56941-2, S. 321–338.