Er entsteht in Freistett aus einer Abzweigung des Mühlbachs, der durch fast ganz Rheinau fließt. Bei Helmlingen unterquert der Rheinniederungskanal die Rench und trifft kurz danach auf die Holzlach, die ihn mit mehr Wasser versorgt. Bei Greffern unterquert er dann die Acher und ein Stück weiter münden der Acherner Mühlbach als Schwarzbach und der Scheidgraben in ihn ein. Bei Söllingen wird der Kanal vom Mühlbach, dem Unterlauf des Sasbachs, unterquert. Auf der Höhe des Baden-Airparks fließt der Kanal durch einen Altrhein, welchen er jedoch nach kurzer Zeit wieder verlässt.
Bei Iffezheim unterquert der Rheinniederungskanal den Sandbach (Unterlauf der Bühlot), welcher kurz danach in den Rhein mündet. Auf einen weiteren Altrhein trifft der Rheinniederungskanal bei Wintersdorf, wo er schlussendlich auch in den Rhein mündet.
Wasserbauliche Bedeutung
Der Rheinniederungskanal wurde 1960 im Rahmen der Acher-Rench-Korrektion fertiggestellt und dient überwiegend der Entwässerung.[2] Einzelne Abschnitte bei Freistett führen nur bei Hochwasser des Mühlbachs Wasser; bei anderen Teilen ist die Sohle und der untere Böschungsteil mit einer Steinpflasterung gesichert, um Sohlenerosion zu verhindern.[3]