Mit ein Grund für die Auflösung der Myoviren als Taxon dürfte die Entdeckung von Vertretern der Caudoviricetes mit hybridem Aufbau sein. Beispielsweise zeigt der Salmonella-Phage F22 Merkmale vom Phagen P22 und dem Phagen Fels-2 (Spezies Salmonella-Virus Fels2, wiss. Felsduovirus Fels2, Familie Peduoviridae, Morphotyp Myoviren). Diese könnte auf eine basale Stellung im Stammbaum der Caudoviricetes hinweisen,[5] aber auch auf einen zurückliegenden horizontalen Gentransfer zwischen Myo- und Podoviren (siehe chimäres Virus).
Die Viruspartikel (Virionen) der Peduoviridae haben den für Mitglieder der KlasseCaudoviricetes typischen Kopf-Schwanz-Aufbau.
Der ikosaedrische Kopf misst etwa 60 nm. Das Kapsid zeigt eine T=7-Dextro-Symmetrie[6] und besteht aus 72 Kapsomeren. Der Schwanz ist kontraktil (Länge etwa 135 nm, Durchmesser 18 nm) und hat 6 kurze geknickte Schwanzfasern.[1]
Genom und Proteom
Die Peduoviridae haben ein lineares dsDNA-Genom von etwa 33 bis 34 kbp (Kilobasenpaare), das für etwa 45 Proteinekodiert. Das dsDNA-Molekül hat kohäsive Enden (sticky ends oder cos sites).[1]
Assembly: Aufbau eines leeren Prokapsids und Verpackung des Genoms.
Zusammenbau der viralen Schwanzfasern und des viralen Schwanzes.
Die reifen Virionen werden durch Lyse (mittels Holin/Endolysin/Spanin-Proteinen[7]) aus der Zelle freigesetzt.
Etymologie
Der Name der Familie Peduoviridae (bzw. ehemaligen Unterfamilie Peduoviridne) leitet sich ab von der Gattung Peduovirus (alias P2likevirus) und deren „Exemplar“ (Referenz-Virus) Escherichia-Phage P2 ab (wobei italienisch ‚duo‘ für ‚2‘ steht), versehen mit der Endung ‚-viridae‘ für Virusfamilien (bzw. ‚-virinae‘ für Virusunterfamilien).[4][3]
Arsenophonus nasoniae strain FIN plasmid pArsFIN13
Gattung Firavirus
Spezies Firavirus YenM4218, mit Yersinia-Phage vB_YenM_42.18
Gattung Gegavirus
Spezies Gegavirus ST15OXA48phi141, mit Klebsiella-Phage ST15-OXA48phi14.1
Gattung Gegevirus
Spezies Gegevirus ST437OXA245phi41, mit Klebsiella-Phage ST437-OXA245phi4.1
Gattung Gemsvirus
Spezies Gemsvirus gv5004652, mit Escherichia-Phage 500465-2
Gattung Graikaemvirus
Spezies Graikaemvirus YenM3117, mit Yersinia-Phage vB_YenM_31.17
Gattung Hpunavirus (früher Hp1virus, Hpunalikevirus, Hp1likevirus) – unterscheide: Gattung Hapunavirus, Bakteriophagen ebenfalls vom Morphotyp der Myoviren, derzeit ohne Familienzuweisung
Spezies Hpunavirus HP1 (Haemophilus-Virus HP1), mit Haemophilus-Phage HP1 und Haemophilus-Phage HP1c1
Spezies Hpunavirus HP2 (Haemophilus-Virus HP2), mit Haemophilus-Phage HP2
Gattung Irrigatiovirus
Spezies Irrigatiovirus SI7, mit Salmonella-Phage SI7
Gattung Irtavirus
Spezies Irtavirus CFP3, mit Pasteurella-Phage vB_PmuM_CFP3 (engl. Pasteurella phage vB_PmuM_CFP3)
Spezies Irtavirus F108 (Pasteurella-Virus F108), mit
Pasteurella-Phage F108 alias Bacteriophage F108[11][12]
Gattung Kapieceevirus
Spezies Kapieceevirus ST512KPC3phi132, mit Klebsiella-Phage ST512-KPC3phi13.2
Gattung Kayeltresvirus
Spezies Kayeltresvirus KL3, mit Burkholderia-Phage KL3
Spezies Kayeltresvirus menos, mit Burkholderia-Phage Menos
Spezies Kayeltresvirus milagro, mit Burkholderia-Phage Milagro
Spezies Kayeltresvirus momento, mit Burkholderia-Phage Momento
Spezies Kayeltresvirus musica, mit Burkholderia-Phage Musica
Gattung Kisquattuordecimvirus
Spezies Kisquattuordecimvirus FLC5, mit Burkholderia-Phage FLC5 DNA
Spezies Kisquattuordecimvirus FLC10, mit Burkholderia-Phage FLC10
Spezies Kisquattuordecimvirus KS14, mit Burkholderia-Phage KS14
Gattung Kisquinquevirus
Spezies Kisquinquevirus Carl1, mit Burkholderia-Phage Carl1
Spezies Kisquinquevirus KS5, mit Burkholderia-Phage KS5
Gattung Longwoodvirus
Spezies Longwoodvirus K139, mit Bacteriophage K139
↑P2 ist ein temperenter Phage. Der „Escherichia-Phage P4“ (ein Coliphage ebenfalls in der Klasse Caudoviricetes, aber bisher nicht näher klassifiziert) ist ein Satellitenvirus (d. h. Satellitenphage), das P2-ähnliche Phagen als Helfervirus benötigt. Siehe Cruz (2013)[14] und NCBI.[15]
Proposal 2: To create a new species, Escherichia virus magyaro, in the genus Peduovirus and assign Escherichia phage P2 KC618326.1.
Background/History: Isolated during a study looking at the sequence variability of P2-like prophage genomes carrying the cytolethal distending toxin V operon in Escherichia coli O157
Proposal 3: To reassign the exemplar isolate of the type species, Escherichia virus P2 of the genus Peduovirus.
Background: Bacteriophage P2 (AF063097) has always been the exemplar of the species Escherichia virus P2 and type isolate of the genus Peduovirus. Unfortunately, because of a naming duplication in public databases, the wrong accession number was used in a previous proposal and the Viral Metadata Resource (that of Escherichia phage P2, now assigned to the species Escherichia virus magyaro).
↑ abc
Nobuto Yamamoto: Genetic evolution of bacteriophage. I. Hybrids between unrelated bacteriophages P22 and Fels 2. In: PNAS, Band 62, Nr. 1, 1. Januar 1969, S. 63–69; doi:10.1073/pnas.62.1.63, PMID 4890254, PMC 285955 (freier Volltext) (englisch).
↑
J. D. Boyce, T. Seemann, B. Adler, M. Harper: Pathogenomics of Pasteurella multocida. In: Current Topics in Microbiology and Immunology, Band 361, S. 23–38, 9. März 2012; doi:10.1007/82_2012_203 (englisch).
↑
Tagide N. deCarvalho, Elia Mascolo, Steven M. Caruso, Júlia López-Pérez, Kathleen Weston-Hafer, Christopher Shaffer, Ivan Erill: Simultaneous entry as an adaptation to virulence in a novel satellite-helper system infecting Streptomyces species. In: Nature: The ISME Journal, 31. Oktober 2023; doi:10.1038/s41396-023-01548-0 (englisch). Dazu: