Die Liga wurde im Jahr 1949 unter dem Namen Taiheiyō Yakyū Renmei (太平洋野球連盟, „Pazifischer Baseballverband“) mit sieben Teams gegründet. Erster Präsident war Nagata Masaichi (1906–1985). Im Jahr 1980 erhielt die Liga ihren gegenwärtigen Namen.
Von 1954 bis 1956 bestand die Liga aus acht Mannschaften, seit 1958 sind es durchgehend sechs. Zwischen 1973 und 1982 und ab 2004 wurde die Teilnahme an der Nippon Series anders als in der Central League in Playoffs ausgetragen. Seit 2007 entscheidet in beiden Ligen die Climax Series über die Teilnahme.
Modus
Trotz des Namens, der eine geografische Aufteilung vermuten lässt, kommen die Mannschaften aus allen Landesteilen. Die sechs Teams spielen von April bis September in (derzeit) 140 Spielen einen Meister aus. Die drei Erstplatzierten spielen in der Climax Series, deren Sieger in der Nihon Series (Japan Series) gegen den Vertreter der Central League in sieben Spielen um die japanische Meisterschaft antreten darf.