Bar-Yosef grub an vielen Fundorten in der Levante, darunter der Kebara-Höhle, dem frühneolithischen Dorf Netiv HaGdud (2004–2005), in der Türkei (Öküzini-Höhle) und in Tschechien, aber auch in der chinesischen Provinz Hunan (Yuchanyan-Höhle) und in Georgien. Er konnte an der Grabungsstätte ʻUbeidiya im Jordantal (Grabungskampagnen 1960 bis 1974) eine 1,5 Millionen Jahre zurückreichende Nutzung nachweisen. Zudem belegte er in den Höhlen von Kebara, Qafzeh und Hayonim die Anwesenheit früher Vertreter des anatomisch modernen Menschen (Homo sapiens) in der Levante, ebenso wie später von Neandertalern in Kebara.
Veröffentlichungen (Auswahl)
mit François R. Valla (Hrsg.): The Natufian Culture in the Levant (= International Monographs in Prehistory. Archaeological Series, 1), International Monographs in Prehistory, Ann Arbor 1991. ISBN 1-879621-01-0.
mit Renee S. Kra (Hrsg.): Late Quaternary Chronology and Paleoclimates of the Eastern Mediterranean, University of Arizona Press, 1994. ISBN 0-9638314-1-0.
mit Harold L. Dibble (Hrsg.): The definition and interpretation of Levallois technology (= Monographs in World Archaeology, 23), Prehistory Press, Madison 1995. ISBN 1-88109-412-X.
mit Thomas R. Rocek (Hrsg.): Seasonality and Sedentism. Archaeological Perspectives from Old and New World Sites (= Peabody Museum. Bulletin, 6), Peabody Museum of Archaeology and Ethnology – Harvard University, Cambridge 1998. ISBN 0-87365-956-2.
mit Takeru Akazawa, Kenichi Aoki (Hrsg.): Neandertals and Modern Humans in Western Asia, Plenum Press, New York 1998. ISBN 0-306-45924-8.
Eat what is there: hunting and gathering in the world of Neanderthals and their neighbours, in: International Journal of Osteoarchaeology 14 (2004), S. 333–342. doi:10.1002/oa.765, Volltext (PDF)
mit Liliane Meignen (Hrsg.): Kebara Cave, Mt. Carmel, Israel. The Middle and Upper Paleolithic Archaeology (= American School of Prehistoric Research. Bulletin, 49), Band 1, Peabody Museum of Archaeology and Ethnology – Harvard University, Cambridge 2007. ISBN 978-0-87365-553-8.
mit Katherine V. Boyle, Clive Gamble (Hrsg.): The Upper Palaeolithic Revolution in Global Perspective. Papers in Honour of Sir Paul Mellars, McDonald Institute for Archaeological Research, Cambridge 2010. ISBN 978-1-902937-53-3.
mit François R. Valla (Hrsg.): Natufian Foragers in the Levant. Terminal Pleistocene Social Changes in Western Asia (= International Monographs in Prehistory. Archeological Series, 19), International Monographs in Prehistory, Ann Arbor 2013. ISBN 978-1-879621-45-9.
mit Royal E. Taylor: Radiocarbon Dating. An Archaeological Perspective, 2. Aufl., Left Coast Press, Walnut Creek 2014. ISBN 978-1-59874-590-0
Bar-Yosef, Ofer, in: Bernard Wood (Hrsg.): Wiley-Blackwell Encyclopedia of Human Evolution, Band 1, Wiley-Blackwell, Chichester 2011, ISBN 978-1-4051-5510-6.
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