Kanwisher ist vor allem für ihre Arbeiten zur funktionellen Organisation des Gehirns bekannt, insbesondere zu den Strukturen, die an der Erkennung von Gesichtern (Fusiform Face Area, FFA), geschriebenen Wörtern, Orten, Musik und Emotionen beteiligt sind. Weitere Arbeiten befassen sich mit Aufmerksamkeit und Awareness. Sie benutzt für ihre Forschungen insbesondere funktionelle Magnetresonanztomographie (fMRI).
Nancy Kanwisher hat laut Google Scholar einen h-Index von 116,[1] laut Datenbank Scopus einen von 97[2] (jeweils Stand September 2024).
N. Kanwisher, J. McDermott, M. M. Chun: The fusiform face area: a module in human extrastriate cortex specialized for face perception. In: J Neurosci. Band 17, Nr. 11, 1. Jun 1997, S. 4302–4311. doi:10.1523/JNEUROSCI.17-11-04302.1997.
R. Saxe, N. Kanwisher: People thinking about thinking people. The role of the temporo-parietal junction in "theory of mind". In: Neuroimage. Band 19, Nr. 4, Aug 2003, S. 1835–1842. doi:10.1016/s1053-8119(03)00230-1.
R. Saxe, S. Carey , N. Kanwisher: Understanding other minds: linking developmental psychology and functional neuroimaging. In: Annu Rev Psychol. Band 55, 2004, S. 87–124. doi:10.1146/annurev.psych.55.090902.142044.
N. Kanwisher, G. Yovel: The fusiform face area: a cortical region specialized for the perception of faces. In: Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. Band 361, Nr. 1476, 29. Dec 2006, S. 2109–2128. doi:10.1098/rstb.2006.1934.
N. Kanwisher, M. Khosla, K. Dobs: Using artificial neural networks to ask 'why' questions of minds and brains. In: Trends Neurosci. Band 46, Nr. 3, Mar 2023, S. 240–254. doi:10.1016/j.tins.2022.12.008.