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Fadolivirus
Fadolivirus ist eine vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) im April 2023 bestätigte Gattung von Riesenviren in der Familie Mimiviridae, Unterfamilie Klosneuvirinae. Als bisher einzige Spezies (Art) dieser Gattung wurde Fadolivirus algeromassiliense bestätigt[1] (mit Referenzstamm Fadolivirus FV1/VV64).[1][3] Weitere vorgeschlagene Spezies sind „Fadolivirus FV2“ (Referenzstamm Fadolivirus FV2/VV64)[4][2] und „Fadolivirus sp. IHUMIVV-54“ (Referenzstamm Fadolivirus IHUMI-VV54).[5][6] Molekulargenetische Untersuchungen zeigten, dass diese Viren in die Verwandtschaft der Klosneuviren gehören, für die das ICTV im April die Unterfamilie Klosneuviridae einrichtete.[2][6][1] Bemerkenswert ist, dass sich die Viren von Fadolivirus algeromassiliense zusammen mit Amöben der Spezies Vermamoeba vermiformis als ihrem Wirt kultivieren lassen.[2][6] Die ersten Vertreter dieser Gruppe, die in Klosterneuburg gefundenen mutmaßlichen Gattungen „Klosneuvirus“, „Catovirus“, „Hokovirus“ und „Indivirus“, sind bislang nur aus Metagenomikanalysen bekannt (Stand April 2023).[7] Offenbar ist Vermamoeba vermiformis für alle Spezies der Gattung ein geeigneter Wirt (siehe Systematik). Fadolivirus algeromassilienseFadolivirus algeromassiliense ist die offizielle Bezeichnung der zuerst gefundenen Fadolivirus-Art (frühere provisorische Bezeichnung Fadolivirus FV1).[1][3][8] Der Stamm Fadolivirus FV1/VV64 stammt aus einer Abwasserprobe, die im Mai 2017 von Boudjemaa et al. in der Nähe des Bahnhofs von Sidi bel Abbès, Algerien entnommen wurde (35,2° N, 0,6414° W).[8][2] Wie von diesem Team 2020 berichtet, konnte er auf Amöben der Art Vermamoeba vermiformis kultiviert werden. Im Ultradünnschnitt zeigten sich ikosaedrische Viruspartikel (Virionen), die eine Größe von etwa 300 nm hatten und auf dem Kapsid kurze Fibrillen hatten (vgl. Wildtyp M1 von Mimivirus bradfordmassiliense). Zum Innern hin zeigte sich eine zunehmende Packungsdichte der viralen DNA, was im Elektronenmikroskop als dunkler („elektronendichter“) Kern erscheint, die schließlich mehrere Lagen aufweist, ähnlich wie beim Bodo-saltans-Virus (Theiavirus salishense, ebenfalls Unterfamilie Klosneuvirinae).[2] Das Genom des Virus besteht aus zwei Teilen (englisch scaffolds).[6] Die Genomanalyse bestätigte die Verwandtschaft mit den in Klosterneuburg gefundenen Klosneuviren mit einer Genomlänge von mehr als 1,5 Mbp (Megabasenpaaren): Eine phylogenetische Analyse auf der Grundlage der RNA-Polymerase-Untereinheit 1 zeigt eine Nähe zu diesen aus der Metagenomik rekonstruierten Viren, insbesondere zeigte die Maximum-Likelihood-Methode einen geringen Abstand dieses Fadolivirus-Stamms zu „Indivirus“ und „Klosneuvirus“.[2] „Fadolivirus FV2“In den im Mai 2017 von Boudjemaa entnommenen Abwasserproben aus der Bahnhofsumgebung von Sidi bel Abbès, Algerien, fand sich noch ein weiteres Virus, das vermutlich derselben Gattung angehört (Fadolivirus FV2/VV64). Es gibt derzeit (Stand 10, Mai 2023) noch keine offizielle Bestätigung der Spezies mit der provisorischen Bezeichnung „Fadolivirus FV2“.[4][1] „Fadolivirus sp. IHUMIVV-54“ Im September 2021 berichteten Julien Andreani et al. vom Fund und der Co-Kultivierung einer weiteren mutmaßlichen Fadolivirus-Spezies. Referenzstamm ist IHUMIVV-54 aus einer ebenfalls algerischen Probe vom September 2017.[6][5] Das Virus hat ebenfalls ein ikosaedrisches Kapsid, seine Genomgröße beträgt 1,59 Mbp (Megabasenpaare) und der GC-Gehalt liegt bei 27,10 %. Es kodiert 66 tRNAs (Transfer-RNAs), 23 Aminoacyl-tRNA-Synthetasen und besitzt 11 Kapsidproteine. Es konnte mit Vermamoeba vermiformis (Stamm CDC19) kultiviert werden. Die phylogenetischen Analysen bestätigten die Klassifizierung unter den Klosneuvirinae. Eine Bestätigung durch das ICTV steht auch hier noch aus (Stand 10. Mai 2023).[6] SystematikNach den Informationen von Andreani et al. (2021), Boudjemaa et al. (2020) und der Taxonomie des ICTV, ergänzt um die im National Center for Biotechnology Information (NCBI) dokumentierten Vorschläge und Gensequenzen, ergibt sich für die Systematik der Gattung Fadolivirus folgendes Bild: Ordnung Imitervirales, Familie: Mimiviridae
PhylogeniePhylogenie nach Boudjemaa et al. (2020):[2]
Eine neuere, ausführlichere Phylogenie nach Andreani et al. (2021), Fig. 5, zeigt eine veränderte Topologie, vereinfacht wie folgt:[6]
Literatur
Einzelnachweise
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