Gemeinsam mit dem palästinensischen Arzt Antoine Dabdoub und der Schweizer Krankenschwester Hedwig Vetter gründete er 1953 das Kinderspital Bethlehem (Englisch: Caritas Baby Hospital) in Bethlehem.[3] Zur langfristigen Sicherung dieser Kinderklinik gründete er 1963 den Verein Kinderhilfe Bethlehem in Luzern.
Ein Mann ging von Jerusalem hinab nach Jericho. Text und Fotografien von Ernst Schnydrig, Kinderzeichnungen aus einem internationalen Wettbewerb der Caritas. Verlag des Borromäus-Vereins, Bonn 1962
Komm in das Land das ich dir zeigen werde. Text und Fotografien von Ernst Schnydrig. Verlag des Borromäus-Vereins, Bonn 1964
Warum, warum bist du nicht Susja gewesen? Knecht, Frankfurt am Main 1972, ISBN 3-7820-0266-0
Nacht der Hirten, Lämmer und Sterne. Knecht, Frankfurt am Main 1973, ISBN 3-7820-0291-1
Tagesrationen. Sankt-Benno-Verlag, Leipzig 1975
Lieber halber Hampelmann. Knecht, Frankfurt am Main 1975, ISBN 3-7820-0347-0
In den Ferien hinter einem grossen Stein zu lesen.... Knecht, Frankfurt am Main 1976, ISBN 3-7820-0372-1
So gute Augen für Zachäus. Knecht, Frankfurt am Main 1977, ISBN 3-7820-0395-0
Wollen wir den chinesischen Kaiser spielen? Knecht, Frankfurt am Main 1978, ISBN 3-7820-0412-4.
Drei Körner Überschuss: in den Ferien und auch sonst zu lesen. Sankt-Benno-Verlag, Leipzig 1982
Drei Lektionen über den Igel: Geschichten von Menschen und Tieren. Knecht, Frankfurt am Main 1985, ISBN 3-7820-0515-5
Literatur
Klaus Röllin: Das Herz muss Hände haben, Pater/Father Ernst Schnydrig MS 1912–1978 (deutsch, englisch); DZA, Altenburg 2012, ISBN 978-3-936300-77-2
Joseph Scheu: Schnydrig, Ernst, in: Hugo Maier (Hrsg.): Who is who der Sozialen Arbeit. Freiburg : Lambertus, 1998, ISBN 3-7841-1036-3, S. 529