Demerecviridae Familie von Viren mit sog. Kopf-Schwanz-Aufbau (Klasse Caudoviricetes Bakterien und Archaeen verschiedener Arten (Spezies) infizieren (solche bakteriellen Viren werden auch Bakteriophagen genannt).[ 4] Coliphage T5 .
Die Familie enthält (mit Stand Mai 2024) offiziell bestätigt drei Unterfamilien (Markadamsvirinae Mccorquodalevirinae Ermolyevavirinae [ 5]
Etymologie
Die Familie wurde benannt zu Ehren von Milislav Demerec (1895–1966), einem kroatisch-amerikanischen Genetiker, der Pionierarbeit auf dem Gebiet der Bakteriophagen leistete, indem er zusammen mit dem italienisch-amerikanischen Physiker Ugo Fano (1912–2001) 1945 erstmals den Coliphagen T5 aus einer Mischung isolierte, die ihnen von Tony L. Rakieten [ 6] [ 4]
Beschreibung
Mitglieder dieser Familie sind Caudoviren (Viren mit Kopf-Schwanz-Struktur) vom Morphotyp der Siphoviren (ehemalige Familie Siphoviridae , von der die Familie durch das ICTV ausgegliedert wurde).
Ihre natürlichen Wirte sind Bakterien aus einer Reihe von Gattungen: Aeromonas Escherichia Klebsiella Pectobacterium Proteus Providencia Salmonella Shigella Vibrio Yersinia [ 4] Gammaproteobacteria ); sowie eventuell noch einige andere der Proteobacteria (siehe §Systematik , Vorschläge).
Das dsDNA -Genom von Coliphage T5 (AY543070.1) ist 121,75 kbp (Kilobasenpaare) lang, hat einen GC-Gehalt von 39,3 mol % und kodiert 162 Proteine und 24 tRNAs (Transfer-RNAs).
Es zeichnet sich durch lange (etwa 10,219 kbp oder mehr) direkte terminale Wiederholungen (englisch direct terminal repeats ) aus.[ 4]
In der gesamten Familie reicht die Genomlänge von etwa 106,2 bis 122,8 kbp,
und der GC-Gehalt variiert von 39,1 bis 45,2 mol%.[ 4]
Systematik
Gemäß International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) gliedert sich die Familie Demerecviridae mit Stand Mai 2024 wie folgt in Unterfamilien, Gattungen und Arten (von letzteren ist hier nur eine Auswahl wiedergegeben),[ 5] [ 7] [ 4] [ 3] [ 8]
Familie Demerecviridae
Unterfamilie Ermolyevavirinae Gattung Cetovirus Vibrionen , d. h. Vibriophagen)
Spezies Cetovirus ceto (Vibrio-Virus Ceto, ehem. Typus) mit Vibrio phage Ceto
Gattung Jesfedecavirus Spezies Jesfedecavirus JSF10 (Vibrio-Virus JSF10, ehem. Typus) mit VVibrio phage JSF10
Spezies Jesfedecavirus JSF12 (Vibrio-Virus JSF12) mit Vibrio phage JSF12
Spezies Jesfedecavirus phi3 (Vibrio-Virus phi3) mit Vibrio phage phi 3
Gattung Thalassavirus Cetovirus ; Wirte: Vibrionen)
Spezies Thalassavirus achelous mit Vibrio phage Achelous
Spezies Thalassavirus AG74 mit Vibrio phage AG74
Spezies Thalassavirus athena mit Vibrio phage Athena
Spezies Thalassavirus bennett mit Vibrio phage Bennett
Spezies Thalassavirus brizo mit Vibrio phage Brizo
Spezies Thalassavirus chester mit Vibrio phage Chester
Spezies Thalassavirus cody mit Vibrio phage Cody
Spezies Thalassavirus gary mit Vibrio phage Gary
Spezies Thalassavirus pontus mit Vibrio phage Pontus
Spezies Thalassavirus quinn mit Vibrio phage Quinn
Spezies Thalassavirus river4 mit Vibrio phage River4
Spezies Thalassavirus thalassa (Vibrio-Virus Thalassa) mit Vibrio phage Thalassa
Gattung Vipunavirus Spezies Vipunavirus pVp1 (Vibrio-Virus pVp1) mit Vibrio phage pVP-1 Unterfamilie Markadamsvirinae Gattung Epseptimavirus Haartmanvirus ; Wirte: Escherichien , Salmonellen , Yersinien )
Spezies Epseptimavirus 100268sal2 mit Salmonella phage 100268_sal2
Spezies Epseptimavirus 118970sal2 mit Salmonella phage 118970_sal2
Spezies Epseptimavirus 150049 mit Klebsiella phage 150049
Spezies Epseptimavirus ace mit Escherichia phage vB_EcoS_Ace
Spezies Epseptimavirus atrejo mit Salmonella phage atrejo
Spezies Epseptimavirus bastian mit Salmonella phage bastian
Spezies Epseptimavirus BD13 mit Salmonella phage BD13
Spezies Epseptimavirus beppo mit Salmonella phage beppo
Spezies Epseptimavirus bobsandoy mit Salmonella phage bobsandoy
Spezies Epseptimavirus bombadil mit Salmonella phage bombadil
Spezies Epseptimavirus bux mit Salmonella phage bux
Spezies Epseptimavirus ende mit Salmonella phage ende
Spezies Epseptimavirus EPS7 (Escherichia-Virus EPS7, ehem. Typus) mit Escherichia phage EPS7
Spezies Epseptimavirus EscoHU1 mit Escherichia phage EscoHU1
Spezies Epseptimavirus ev23 mit Salmonella phage 2-3
Spezies Epseptimavirus ev119 mit Salmonella phage 1-19
Spezies Epseptimavirus ev123 (Salmonella-Virus 123) mit Salmonella phage 1-23
Spezies Epseptimavirus ev129 mit Salmonella phage 1-29
Spezies Epseptimavirus ev329 mit Salmonella phage 3-29
Spezies Epseptimavirus ev26175I mit Escherichia phage vB_EcoS-26175I
Spezies Epseptimavirus faergetype mit Salmonella phage faergetype
Spezies Epseptimavirus falkor mit Salmonella phage falkor
Spezies Epseptimavirus fuchur mit Salmonella phage fuchur
Spezies Epseptimavirus gretekellenberger mit Escherichia phage GreteKellenberger
Spezies Epseptimavirus GRNsp8 mit Salmonella phage GRNsp8
Spezies Epseptimavirus GSP001 mit Salmonella phage GSP001
Spezies Epseptimavirus GSW6 mit Salmonella phage GSW6
Spezies Epseptimavirus irmatschudi mit Escherichia phage IrmaTschudi
Spezies Epseptimavirus JNS202001 mit Salmonella phage JN-S202001
Spezies Epseptimavirus JNwz02 mit Salmonella phage JNwz02
Spezies Epseptimavirus KKP mit Salmonella phage KKP
Spezies Epseptimavirus LVR16A mit Salmonella phage LVR16A
Spezies Epseptimavirus mar003J3 mit Escherichia phage vB_Eco_mar003J3
Spezies Epseptimavirus METP1137112 mit Salmonella phage MET_P1_137_112
Spezies Epseptimavirus misterkot mit Salmonella phage misterkot
Spezies Epseptimavirus N3 mit Salmonella phage GEC_vB_N3
Spezies Epseptimavirus N7 mit Salmonella phage GEC_vB_N7
Spezies Epseptimavirus oselot mit Salmonella phage oselot
Spezies Epseptimavirus OSYSTA mit Salmonella phage OSY-STA
Spezies Epseptimavirus phagemcphageface mit Salmonella phage phagemcphageface
Spezies Epseptimavirus polluks mit Salmonella phage polluks
Spezies Epseptimavirus PRFSP13 mit Salmonella phage PRF-SP13
Spezies Epseptimavirus R201 ('Yersinia virus phiR201) mit Yersinia phage phiR2-01
Spezies Epseptimavirus RN29 mit Salmonella phage vB_STy-RN29
Spezies Epseptimavirus rokbiter mit Salmonella phage rokbiter
Spezies Epseptimavirus rutana mit Salmonella phage rutana
Spezies Epseptimavirus S113 mit Salmonella phage S113
Spezies Epseptimavirus S114 mit Salmonella phage S114
Spezies Epseptimavirus S116 mit Salmonella phage S116
Spezies Epseptimavirus S124 mit Salmonella phage S124
Spezies Epseptimavirus S126 mit Salmonella phage S126
Spezies Epseptimavirus S132 mit Salmonella phage S132
Spezies Epseptimavirus S133 mit Salmonella phage S133
Spezies Epseptimavirus S147 mit Salmonella phage S147
Spezies Epseptimavirus saus132 mit Escherichia phage saus132
Spezies Epseptimavirus SB9 mit Salmonella phage vB_SenS_SB9
Spezies Epseptimavirus SB10 mit Salmonella phage vB_SenS_SB10
Spezies Epseptimavirus SB13 mit Salmonella phage vB_SenS_SB13
Spezies Epseptimavirus Sds2 mit Phage vB_SabS_Sds2 (früher zu Epseptimavirus sepoy )
Spezies Epseptimavirus SE3 mit Salmonella phage SE3
Spezies Epseptimavirus SE24 mit Salmonella phage SE24
Spezies Epseptimavirus seafire mit Salmonella phage Seafire
Spezies Epseptimavirus sepoy mit Salmonella phage Sepoy
Spezies Epseptimavirus SH9 mit Salmonella phage SH9
Spezies Epseptimavirus smaug mit Salmonella phage smaug
Spezies Epseptimavirus SP76 mit Salmonella phage SP76
Spezies Epseptimavirus STG2 mit Salmonella phage STG2
Spezies Epseptimavirus stitch mit Salmonella phage Stitch
Spezies Epseptimavirus STWB21 mit Salmonella phage STWB21
Spezies Epseptimavirus STyj51 mit Salmonella phage vB_STyj5-1
Spezies Epseptimavirus supergirl mit Escherichia phage SuperGirl
Spezies Epseptimavirus Sw2 mit Salmonella phage Sw2
Spezies Epseptimavirus thor mit Salmonella phage SP_Thor
Spezies Epseptimavirus trudigerster mit Escherichia phage TrudiGerster
Spezies Epseptimavirus trudiroth mit Escherichia phage TrudiRoth
Spezies Epseptimavirus UTK0009 mit Salmonella phage vB_SenS_UTK0009
Spezies Epseptimavirus UTK0010 mit Salmonella phage vB_SenS_UTK0010
Spezies Epseptimavirus vaffelhjerte mit Salmonella phage vaffelhjerte
EM -Aufnahme einesVirions von Escherichia-Virus T5 .Modell von Lactococcus-Phage TP901-1. Basisplatte aktiv, Bindung an Polysaccharide . Tequintavirus T5likevirus , T5virus , Wirte: Escherichien, Salmonellen, Shigellen , evtl. Epsilonproteobacteria : Campylobacter [ 9] Spezies Tequintavirus ABTNLsp4 mit Salmonella phage vB_SalS_ABTNLsp4
Spezies Tequintavirus ABTNLsp9 mit Salmonella phage vB_SalS_ABTNLsp9
Spezies Tequintavirus AKFV33 (Escherichia-Virus AKFV33) mit Escherichia phage vB_EcoS_AKFV33
Spezies Tequintavirus APCEc03 (Escherichia-Virus phiAPCEc03) mit Escherichia phage phiAPCEc03
Spezies Tequintavirus BB1 mit Escherichia phage BB1
Spezies Tequintavirus BF23 (Escherichia-Virus BF23) mit 'Escherichia phage BF23
Spezies Tequintavirus chee24 (Escherichia-Virus chee24) mit Escherichia phage chee24
Spezies Tequintavirus DaisyDussoix mit Escherichia phage DaisyDussoix
Spezies Tequintavirus DT5712 (Escherichia-Virus DT5712) mit Escherichia phage DT571/2
Spezies Tequintavirus DT57C (Escherichia-Virus DT57C) mit Escherichia phage DT57C
Spezies Tequintavirus E22 mit Salmonella phage vB_Sen-E22
Spezies Tequintavirus EC100 mit Escherichia phage EC100
Spezies Tequintavirus EC148 mit Escherichia phage EC148
Spezies Tequintavirus ECOP18 mit Escherichia phage ECOP18
Spezies Tequintavirus ESCO30 mit Escherichia phage vB_EcoS_ESCO30
Spezies Tequintavirus ESCO40 mit Escherichia phage vB_EcoS_ESCO40
Spezies Tequintavirus ev219 mit Escherichia phage T5_ev219
Spezies Tequintavirus FFH1 (Escherichia-Virus FFH1) mit Escherichia phage vB_EcoS_FFH_1
Spezies Tequintavirus fp01 mit Escherichia phage fp01
Spezies Tequintavirus gostya9 (Escherichia-Virus Gostya9) mit Escherichia phage Gostya9
Spezies Tequintavirus GSP044 mit Salmonella phage GSP044
Spezies Tequintavirus H8 (Escherichia-Virus H8) mit Escherichia phage H8
Spezies Tequintavirus HASG4 mit Escherichia phage vB_EcoS_HASG4
Spezies Tequintavirus HdH2 mit Escherichia phage vB_EcoS_HdH2
Spezies Tequintavirus hildybeyeler mit Escherichia phage HildyBeyeler
Spezies Tequintavirus IME178 mit Escherichia phage IME178
Spezies Tequintavirus irisvonroten mit Escherichia phage IrisVonRoten
Spezies Tequintavirus JLBYU40 mit Escherichia phage JLBYU40
Spezies Tequintavirus JLBYU43 mit Escherichia phage JLBYU43
Spezies Tequintavirus KPP2018 mit Klebsiella phage KPP2018
Spezies Tequintavirus L6jm mit Salmonella phage L6jm
Spezies Tequintavirus lindwurm mit Escherichia phage Lindwurm
Spezies Tequintavirus LLS (Escherichia-Virus phiLLS) mit Escherichia phage phiLLS
Spezies Tequintavirus LmqsSP1 mit Salmonella phage vB_StyS-LmqsSP1
Spezies Tequintavirus mar004NP2 (Escherichia-Virus mar004NP2) mit Escherichia phage vB_Eco_mar004NP2
Spezies Tequintavirus N5 mit Salmonella phage GEC_vB_N5
Spezies Tequintavirus NBEco001 mit Phage NBEco001
Spezies Tequintavirus NBEco002 mit Phage NBEco002
Spezies Tequintavirus NBSal003 mit Phage NBSal003
Spezies Tequintavirus NBSal005 mit Phage NBSal005
Spezies Tequintavirus NR01 (Salmonella-Virus NR01) mit Salmonella phage NR01
Spezies Tequintavirus oldekolle mit Salmonella phage oldekolle
Spezies Tequintavirus OSYSP (Escherichia-Virus OSYSP) mit Escherichia phage OSYSP
Spezies Tequintavirus P1100107 mit Salmonella phage MET_P1_100_107
Spezies Tequintavirus phA11 mit Salmonella phage phA11
Spezies Tequintavirus phB7 mit Salmonella phage phB7
Spezies Tequintavirus phC17 mit Salmonella phage phC17
Spezies Tequintavirus PNJ1902 mit Escherichia phage PNJ1902
Spezies Tequintavirus S124 mit Salmonella phage vB_SenS_S124
Spezies Tequintavirus S131 (Salmonella-Virus S131) mit Salmonella phage S131
Spezies Tequintavirus SA001 mit Salmonella phage vB_SalS_SA001
Spezies Tequintavirus SE11 mit Salmonella phage SE11
Spezies Tequintavirus selmaratti mit Escherichia phage SelmaRatti
Spezies Tequintavirus shivani (Salmonella-Virus Shivani) mit Salmonella phage Shivani
Spezies Tequintavirus SHSML45 (Shigella-Virus SHSML45) mit Shigella phage SHSML-45
Spezies Tequintavirus slur09 (Escherichia-Virus slur09) mit Escherichia phage slur09
Spezies Tequintavirus SP01 (Salmonella-Virus SP01) mit Salmonella phage SP01
Spezies Tequintavirus SP3 (Salmonella-Virus SP3) mit Salmonella phage SP3
Spezies Tequintavirus SP15 mit Escherichia phage SP15
Spezies Tequintavirus SPC35 (Salmonella-Virus SPC35) mit Salmonella phage SPC35
Spezies Tequintavirus SSP1 (Shigella-Virus SSP1) mit Shigella phage SSP1
Spezies Tequintavirus T5 Escherichia phage T5
Spezies Tequintavirus Th1 mit Salmonella phage Th1
Spezies Tequintavirus tv179112 mit Salmonella phage MET_P1_179_112
Spezies Tequintavirus tv3sent1 mit Salmonella phage 3sent1
Spezies Tequintavirus tv8sent1748 mit Salmonella phage 8sent1748
Spezies Tequintavirus tvI1 mit Salmonella phage vB_Sen_I1
Spezies Tequintavirus VEc33 mit Escherichia phage VEc33
Spezies Tequintavirus VSe12 mit Salmonella phage VSe12
Spezies Tequintavirus vVAH1 mit Escherichia phage vB_EcoS_VAH1
Spezies „Campylobacter phage C8
Spezies „Campylobacter phage C13
Spezies „Salmonella phage 5
Spezies „Salmonella phage vB_SalS_SA001 ohne zugewiesene Gattung
Spezies „Bacteriophage Eos “
Spezies „Pantoea phage vB_PagS_AAS21 Pantoea
Spezies „Vibrio phage 149 (Typ IV)T5virus alias T5likevirus , vom ICTV 2015 aus dieser Gattung genommen, da zu wenig Datenmaterial für die Zuordnung vorliegt)[ 10] [ 11] Unterfamilie Mccorquodalevirinae Gattung Hongcheonvirus Pectobacterien )
Spezies Hongcheonvirus DUPPV (Pectobacterium-Virus DUPPV, ehem. Typus) mit Pectobacterium phage DU_PP_V
Gattung Myunavirus Spezies Myunavirus My1 (Pectobacterium-Virus My1, ehem. Typus) mit Pectobacterium phage My1 ohne zugewiesene Unterfamilie:
Gattung: Keyvirus Erwinien , Pantoea Spezies Keyvirus AAS21 mit Pantoea phage vB_PagS_AAS21
Spezies Keyvirus key mit Erwinia phage Key
Gattung Novosibvirus Proteus Spezies Novosibvirus PM135 (Proteus-Virus PM135, ehem. Typus) mit Proteus phage PM135
Spezies Novosibvirus stubb (Proteus-Virus Stubb) mit Proteus phage Stubb
Spezies „Proteus phage 1
Spezies „Proteus phage 2
Spezies „Proteus phage M4H10_20
Gattung Pogseptimavirus Spezies Pogseptimavirus PG07 (Vibrio-Virus PG07, ehem. Typus) mit Vibrio phage vB_VpS_PG07
Spezies Pogseptimavirus VspSw1 (Vibrio-Virus VspSw1) mit Vibrio phage VspSw_1 alias Vibrio phage vspsw1 , Vibrio phage ValDsh2 , Vibrio phage valsw3 und Vibrio phage vB_ValS_X1
Gattung Priunavirus Providencia )
Spezies Priunavirus PR1 (Providencia-Virus PR1) mit Providencia phage vB_PreS_PR1
Gattung Shenzhenvirus Aeromonas Spezies Shenzhenvirus AhSzq1 (Aeromonas-Virus AhSzq1) mit Aeromonas phage AhSzq-1
Spezies Shenzhenvirus AhSzw1 (Aeromonas-Virus AhSzw1) mit Aeromonas phage AhSzw-1
Spezies „Aeromonas phage Akh-2
Gattung Sugarlandvirus Klebsiellen )
Spezies Sugarlandvirus AmPhEK80 mit Klebsiella phage AmPh_EK80
Spezies Sugarlandvirus anoxic mit Klebsiella phage vB_KppS-Anoxic
Spezies Sugarlandvirus B01 mit Klebsiella phage vB_Kpn_B01
Spezies Sugarlandvirus FZ41 mit Klebsiella phage vB_KpnS_FZ41
Spezies Sugarlandvirus GZ8 mit Klebsiella phage GZ8
Spezies Sugarlandvirus IME260 mit Klebsiella phage vB_Kpn_IME260
Spezies Sugarlandvirus JIPhKp127 mit Klebsiella phage JIPh_Kp127
Spezies Sugarlandvirus KpGranit mit Klebsiella phage KpGranit
Spezies Sugarlandvirus KPN4 mit Klebsiella phage KPN4
Spezies Sugarlandvirus PWKp9S mit Klebsiella phage PWKp9S
Spezies Sugarlandvirus ShaphcTDM11244 mit Klebsiella phage Shaphc-TDM-1124-4
Spezies Sugarlandvirus storm mit Klebsiella phage vB_KppS-Storm
Spezies Sugarlandvirus sugarland (Klebsiella-Virus Sugarland) mit Klebsiella phage Sugarland
Spezies Sugarlandvirus totoro mit Klebsiella phage vB_KppS-Totoro
Spezies Sugarlandvirus Uniso31 mit Klebsiella phage vB_KpnS_Uniso31
Spezies Sugarlandvirus VAC35 mit Klebsiella phage vB_KpnS-VAC35
Spezies Sugarlandvirus VAC51 mit Klebsiella phage vB_KpnS-VAC51
Spezies Sugarlandvirus veronica mit Klebsiella phage vB_KaS-Veronica
ohne zugewiesene Gattung
Spezies „Serratia phage Slocum Serratia
Einzelnachweise
↑ ICTV Master Species List 2021.v2. (Memento Originals Internet Archive Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1 @2 Vorlage:Webachiv/IABot/talk.ictvonline.org ↑ ICTV Master Species List 2019.v1. (Memento Originals Internet Archive Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1 @2 Vorlage:Webachiv/IABot/talk.ictvonline.org ↑ a b ICTV Master Species List 2020.v1. (Memento Originals Internet Archive Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1 @2 Vorlage:Webachiv/IABot/talk.ictvonline.org ↑ a b c d e f Evelien M. Adriaenssens, Mart Krupovic et al.: Taxonomy of prokaryotic viruses: 2018-2019 update from the ICTV Bacterial and Archaeal Viruses Subcommittee. In: Archives of Virology , 11. März 2020, 165, S. 1253–1260; doi:10.1007/s00705-020-04577-8 , uu.nl (PDF)
↑ a b ICTV : Taxonomy Browser .↑ Rakieten TL (Author). NIH PubMed .↑ ICTV : Virus Metadata Resource (VMR) .↑ Demerecviridae (family). NCBI.↑ Tequintavirus. ViralZone. SIB.↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Vibrio phage 149 (type IV) , EC 47, London, UK, July 2015; Email ratification 2016 (MSL #30)
↑ Andrew M. Kropinski et al. : To amend the description of the T5likevirus ; and, add four (4) new species @1 @2 Vorlage:Toter Link/talk.ictvonline.org (Seite nicht mehr abrufbar , festgestellt im November 2024. Suche in Webarchiven ) Info: Der Link wurde automatisch als defekt markiert. Bitte prüfe den Link gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.
