Die Autographiviridae (veraltet auch Autographivirinae , T7-Supergruppe , englisch T7 supergroup genannt) sind eine Familie von Viren in der Ordnung Caudovirales – sie wurden dort früher als Unterfamilie Autographivirinae in der früheren Familie Podoviridae geführt. Ihre natürlichen Wirte sind Bakterien . Es gibt derzeit 40 Arten (Spezies ) in dieser Gruppe, die meisten davon sind einer von ca. sieben Gattungen zugewiesen.[ 3] [ 4]
Forschungsgeschichte
Seit den 1990er Jahren hat sich der Begriff T7-Supergruppe für die wachsende Gruppe der mit dem Coliphagen T7 verwandten Bakteriophagen vom Morphotyp der Podoviren etabliert. Salmonella virus SP6 (alias Enterobacteriaceae-Phage SP6 ) und Escherichia virus K1-5 (alias Enterobacteriaceae-Phage K1-5 ) wurden als erste als eine weitläufig verwandte Untergruppe (die heutige Gattung Zindervirus ) dieser ‚T7-Supergruppe‘ betrachtet.[ 5] Das Pseudomonas-Virus phiKMV (alias Bakteriophage phiKMV ) zeigte auf der Ebene der Genomorganisation ebenfalls Gemeinsamkeiten. Basierend auf den verfügbaren morphologischen und proteomischen Daten wurde diese Virusklade zunächst als eine Unterfamilie in der damaligen Familie Podoviridae etabliert. Nachdem Genom-Untersuchungen gezeigt hatten. dass diese Familie nicht monophyletisch ist, wurde sie seitens des ICTV im März/April 2022 aufgelöst; die frühere Unterfamilie Aurographivirinae war schon vorher zur Familie Autographiviridae hochgestuft worden.
Etymologie
Der Name der Familie Autographiviridae kommt von griechisch αὐτο-γράφειν (aúto-gráphein, selbst-schreibend) und bezieht darauf, dass diese Phagen ihre eigene RNA-Polymerase kodieren , also selbst-transkribierend sind; dies ist ein gemeinsames Merkmal all ihrer Mitglieder.
Aufbau
Beschriftete Schemazeichnung eines Virusteilchens von Enterobacteria-Phage T7 , Spezies Teseptimavirus T7 (Querschnitt und Seitenansicht)
Die Virusteilchen (Virionen) der Autographiviridae sind nicht umhüllt mit ikosaedrischem Kopf-Schwanz-Aufbau und eine Symmetrie (Triangulationszahl ) T=7 . Der Durchmesser beträgt ca. 60 nm. Das Genom ist linear und hat eine Länge von ca. 40–42 kb .[ 3]
Vermehrungszyklus
Die Virusreplikation geschieht im Zytoplasma . Das Virus tritt durch Lyse (Auflösung) der Wirtszelle vermöge Holin -, Endolysin - bzw. Spanin -Proteinen aus dieser aus. Die Übertragung geschieht durch passive Diffusion .[ 3]
Systematik
Die folgende Liste führt die Spezies in der Familie Autographiviridae auf gemäß der ICTV :[ 6] [ 7]
Familie Autographiviridae (veraltet: Autographivirinae , T7-Supergruppe ). Morphotyp : Podoviren
00 Unterfamilie
Beijerinckvirinae
TEM -Aufnahem eines Virions des Acinetobacter-Phagen SH-Ab 15519[ 8]
Gattung Daemvirus (21 Spezies)
Spezies Daemvirus acibel007 (Acinetobacter-Virus Acibel007), mit Acinetobacter-Phage vB_AbaP_Acibel007
Gattung Friunavirus (veraltet Fri1virus )
Spezies Friunavirus AB1 , mit Acinetobacter-Phage phiAB1
Spezies Friunavirus AB3 , mit Acinetobacter-Phage AB3
Spezies Friunavirus AB6 , mit Acinetobacter-Phage phiAb6
Spezies Friunavirus AbKT21III , mit Acinetobacter-Phage_AbKT21phiIII
Spezies Friunavirus Abp1 , mit Acinetobacter-Phage Abp1
Spezies Friunavirus Aci07 , mit Acinetobacter-Phage_vB_AbaP_46-62_Aci07
Spezies Friunavirus Aci08 , mit Acinetobacter-Phage_vB_AbaP_B09_Aci08
Spezies Friunavirus AS11 , mit Acinetobacter-Phage vB_AbaP_AS11
Spezies Friunavirus AS12 , mit Acinetobacter-Phage vB_AbaP_AS12
Spezies Friunavirus B1 , mit Acinetobacter-Phage vB_AbaP_B1
Spezies Friunavirus B3 , mit Acinetobacter-Phage vB_AbaP_B3
Spezies Friunavirus B5 , mit Acinetobacter-Phage vB_AbaP_B5
Spezies Friunavirus D2 , mit Acinetobacter-Phage vB_AbaP_D2
Spezies Friunavirus Fri1 , mit Acinetobacter-Phage Fri1
Spezies Friunavirus fv15519 , mit Acinetobacter-Phage SH-Ab 15519 und Acinetobacter-Phage Ab124[ 8] [ 9]
Spezies Friunavirus IME200 , mit Acinetobacter-Phage IME-200
Spezies Friunavirus P1 , mit Acinetobacter-Phage vB_ApiP_P1
Spezies Friunavirus P2 , mit Acinetobacter-Phage vB_ApiP_P2
Spezies Friunavirus PD6A3 , mit Acinetobacter-Phage vB_AbaP_PD-6A3
Spezies Friunavirus PDAB9 , mit Acinetobacter-Phage vB_AbaP_PD-AB9
Spezies Friunavirus SWHAb1 , mit Acinetobacter-Phage SWH-Ab-1
Spezies Friunavirus SWHAb3 , mit Acinetobacter-Phage SWH-Ab-3
Spezies Friunavirus WCHABP5 , mit Acinetobacter-Phage WCHABP5
Gattung Pettyvirus
Spezies Pettyvirus petty , mit Acinetobacter-Phage Petty
00 Unterfamilie
Colwellvirinae
Gattung Gutovirus
Spezies Gutovirus Vc1 , mit Vibrio-Phage Vc1
Gattung Kaohsiungvirus (3 Spezies)
Spezies Kaohsiungvirus A318 , mit Vibrio-Phage phi-A318
Spezies Kaohsiungvirus AS51 , mit Vibrio-Phage AS51
Spezies Kaohsiungvirus Vp670 , mit Vibrio-Phage Vp670
Gattung Murciavirus (2 Spezies)
Spezies Murciavirus CB5A , mit Marinomonas-Phage CB5A
Spezies Murciavirus CPP1m , mit Marinomonas-Phage CPP1m
Gattung Trungvirus
Spezies Trungvirus VEN , mit Vibrio-Phage VEN
Gattung Uliginvirus (5 Spezies)
Spezies Uliginvirus achelous , mit Pseudomonas-Phage Achelous
Spezies Uliginvirus alpheus , mit Pseudomonas-Phage Alpheus
Spezies Uliginvirus nerthus , mit Pseudomonas-Phage Nerthus
Spezies Uliginvirus njord , mit Pseudomonas-Phage Njord
Spezies Uliginvirus uligo , mit Pseudomonas-Phage uligo
00 Unterfamilie
Corkvirinae
Gattung Kantovirus
Spezies Kantovirus C171 (früher Pseudomonas-Virus C171), mit Pseudomonas-Phage YMC11/06/C171_PPU_BP
…
Gattung Kotilavirus (3 Spezies)
Spezies Kotilavirus PP16 , mit Pectobacterium-Phage PP16
…
Gattung Phimunavirus (12 Spezies)
Spezies Phimunavirus fM1 , mit Pectobacterium-Phage fM1
…
Gattung Stompvirus
Spezies Stompvirus BF2512 (früher Dickeya-Virus BF25-12), mit Dickeya-Phage BF25/12
00 Unterfamilie
Krylovirinae
Gattung Kirikabuvirus
Kirikabuvirus NV3 , mit Pseudomonas-Phage phiNV3
Gattung Phikmvvirus (veraltet Phikmvlikevirus , PhiKMV-like viruses , PhiKMV-ähnliche Viren ; 16 Spezies)[ 10]
Spezies Phikmvvirus 15pyo , mit Pseudomonas-Phage vB_PaeP_PAO1_1-15pyo
Spezies Phikmvvirus Ab05 , mit Pseudomonas-Phage vB_PaeP_PAO1_Ab05
Spezies Phikmvvirus ABTNL , mit Pseudomonas-Phage vB_PaeP_PPA-ABTNL
Spezies Phikmvvirus DL62 , mit Pseudomonas-Phage DL62
Spezies Phikmvvirus kF77 , mit Pseudomonas-Phage phikF77
Spezies Phikmvvirus LKD16 , mit Pseudomonas-Phage LKD16
Spezies Phikmvvirus LUZ19 , mit Pseudomonas-Phage LUZ19
Spezies Phikmvvirus MPK6 , mit Pseudomonas-Phage MPK6
Spezies Phikmvvirus MPK7 , mit Pseudomonas-Phage MPK7
Spezies Phikmvvirus NFS , mit Pseudomonas-Phage phiNFS
Spezies Phikmvvirus PAXYB1 , mit Pseudomonas-Phage PAXYB1
Spezies Phikmvvirus phiKMV , mit Pseudomonas-Phage phiKMV
Spezies Phikmvvirus PT2 , mit Pseudomonas-Phage PT2
Spezies Phikmvvirus PT5 , mit Pseudomonas-Phage PT5
Spezies Phikmvvirus pv130113 , mit Pseudomonas-Phage vB_PaeP_130_113
Spezies Phikmvvirus RLP , mit Pseudomonas-Phage RLP
Gattung Stubburvirus
Spezies Stubburvirus LKA1 , mit Pseudomonas-Phage LKA1
Gattung Tunggulvirus (ICTV-Fehlschreibung Tunggulviirus korrigiert nach den ICTV-Regeln für Gattungsnamen)
Spezies Tunggulvirus f2 (früher Pseudomonas-Virus f2), mit Pseudomonas-Phage phi-2
00 Unterfamilie
Melnykvirinae
Gattung Aerosvirus
Spezies Aerosvirus AS7 , mit Aeromonas phage phiAS7[ 11]
Spezies Aerosvirus av25AhydR2PP , mit Aeromonas phage_ZPAH7
Spezies Aerosvirus ZPAH7 , mit Aeromonas phage ZPAH7B
Gattung Aghbyvirus
Spezies Aghbyvirus ISAO8 (früher Yersinia-Virus ISAO8), mit Yersinia-Phage vB_YenP_ISAO8
Gattung Ahphunavirus
Spezies Ahphunavirus Ahp1 , mit Aeromonas-Phage Ahp1
Spezies Ahphunavirus CF7 , mit Aeromonas-Phage CF7
Gattung Cronosvirus
Spezies Cronosvirus DevCD23823 , mit Cronobacter phage Dev-CD-23823
Spezies Cronosvirus GAP227 (früher Cronobacter-Virus GAP227), mit Cronobacter phage vB_CskP_GAP227 alias Cronobacter-sakazakii-Phage vB_CsaP_GAP227[ 11]
Gattung Panjvirus
Spezies Panjvirus Spp16 (früher Salmonella-Virus Spp1), mit Salmonella-Phage vB_SpuP_Spp16
Gattung Pienvirus
Spezies Pienvirus R801 (früher Yersinia-Virus R8-01), mit Yrsinia-Phage phi80-18 alias Yersinia-Phage ϕR8-01[ 11]
Gattung Pokrovskaiavirus
Spezies Pokrovskaiavirus fHeYen301 , mit Yersinia-Phage fHe-Yen3-01
Spezies Pokrovskaiavirus pv8018 , mit Yersinia-Phage phi80-18 alias Yersinia-Phage ϕ80-18[ 11]
Gattung Wanjuvirus
Spezies Wanjuvirus arno160 , mit Pectobacterium-Phage Arno160
Spezies Wanjuvirus PP2 , mit Pectobacterium-Phage PP2
00 Unterfamilie
Molineuxvirinae
Gattung Acadevirus (4 Spezies, infizieren das Bakterium Proteus )
Spezies Acadevirus PM85 (früher Proteus-Virus PM85), mit Proteus-Phage PM 85
Spezies Acadevirus PM93 , mit Proteus-Phage PM 93
Spezies Acadevirus PM116 , mit Proteus-Phage PM 116
Spezies Acadevirus Pm5460 , mit Proteus-Phage vB_PmiP_Pm5460
Gattung Axomammavirus
Spezies Axomammavirus PP1 , mit Pectobacterium-Phage PP1
Gattung Eracentumvirus (2 Spezies)
Spezies Eracentumvirus era103 , mit Erwinia-Phage Era103 alias Erwinia-amylovora-Phage Era103
Gattung Tuodvirus
Spezies Tuodvirus phD2B , mit Lelliottia-Phage phD2B
Gattung Vectrevirus (11 Spezies)
Spezies Vectrevirus VEc3 , mit Escherichia-Phage VEc3
Spezies Vectrevirus K15 , mit Escherichia-Phage K1-5 alias Enterobacteria-Phage K1-5
Spezies Vectrevirus K1E , mit Escherichia-Phage K1E alias Enterobacteria-Phage K1E
…
Gattung Zindervirus (veraltet Sp6virus , Sp6likevirus , SP6-ähnliche Viren )[ 12]
Spezies Zindervirus BP12B , mit Salmonella-Phage BP12B
Spezies Zindervirus SP6 , mit Salmonella-Phage SP6 oder Enterobacteria-Phage SP6
Spezies Zindervirus UAB78 , mit Salmonella-Phage UAB_phi78
Spezies „Escherichia virus K5 “ („Escherichia-Virus K5“, vom ICTV ausgelistet wg. unzulänglichen Genom-Daten)
00 Unterfamilie
Okabevirinae
Gattung Ampunavirus
Spezies Ampunavirus BpAMP1 , mit Burkholderia-Phage Bp-AMP1
Spezies Ampunavirus RSPI1 , mit Ralstonia-Phage RS-PI-1
Gattung Higashivirus
Spezies Higashivirus RSB1 , mit Ralstonia-Phage RSB1
Spezies Higashivirus RsoP1IDN , mit Ralstonia-Phage RsoP1IDN
Gattung Mguuvirus
Spezies Mguuvirus JG068 , mit Burkholderia-Phage JG068
Gattung Risjevirus
Spezies Risjevirus RSJ2 , mit Ralstonia-Phage RSJ2
Spezies Risjevirus RSJ5 , mit Ralstonia-Phage RSJ5
Gattung Sukuvirus
Spezies Sukuvirus RSPII1 (früher Ralstonia-Virus RSPII1), mit Ralstonia-Phage RS-PII-1
00 Unterfamilie
Slopekvirinae
Gattung Bucovirus
Spezies Bucovirus buco , mit Shigella-Phage Buco (engl. Shigella phage_Buco )
Gattung Drulisvirus (veraltet Kp34virus , 18 Spezies)
Spezies Drulisvirus F19 , mit Klebsiella-Phage F19
Spezies Drulisvirus K244 (früher Klebsiella-Virus K244), mit Klebsiella-Phage NTUH-K2044-K1-1
Spezies Drulisvirus Kp2 , mit Klebsiella-Phage Kp2
Spezies Drulisvirus KP34 , mit Klebsiella-Phage KP34
Spezies Drulisvirus KpV41 , mit Klebsiella-Phage KpV41
Spezies Drulisvirus KpV71 , mit Klebsiella-Phage KpV71
Spezies Drulisvirus KpV475 , mit Klebsiella-Phage KpV475
Spezies Drulisvirus SU503 (früher Klebsiella-Virus SU503), mit Klebsiella-Phage vB_KpnP_SU503
Spezies Drulisvirus SU552A (früher Klebsiella-Virus SU552A), mit Klebsiella-Phage vB_KpnP_SU552A
…
Gattung Koutsourovirus
Spezies Koutsourovirus KDA1 , mit Enterobacter-Phage phiKDA1
Gattung Novosibovirus
Spezies Novosibovirus PM16 , mit Proteus-Phage PM16
Spezies Novosibovirus PM75 , mit Proteus-Phage PM 75
00 Unterfamilie
Studiervirinae
Gattung Aarhusvirus
Spezies Aarhusvirus dagda , mit Dickeya-Phage Dagda
Spezies Aarhusvirus katbat , mit Dickeya-Phage Katbat (engl. Dickeya phage_Katbat )
Spezies Aarhusvirus luksen , mit Dickeya-Phage Luksen (engl. Dickeya phage_Luksen )
Spezies Aarhusvirus mysterion , mit Dickeya-Phage Mysterion (engl. Dickeya phage_Mysterion )
Gattung Apdecimavirus
Spezies Apdecimavirus AP10 (früher Yersinia-Virus AP10), mit Yersinia-Phage vB_YenP_AP10
Gattung Berlinvirus (15 Spezies)
Spezies Berlinvirus Kvp1 , mit Kluyvera-Phage Kvp1
Spezies Berlinvirus berlin , mit Yersinia-Phage Berlin (wiss. )
…
Gattung Caroctavirus
Spezies Caroctavirus CR8 , mit Citrobacter-Phage CR8
Gattung Chatterjeevirus
Spezies Chatterjeevirus ICP3 , mit Vibrio-Phage ICP3
Spezies Chatterjeevirus N4 , mit Vibrio-Phage N4
Spezies Chatterjeevirus VP4 , mit Vibrio-Phage VP4
Gattung Eapunavirus
Spezies Eapunavirus Eap1 (früher Enterobacter-Virus Eap1), mit Enterobacter-Ohage phiEap-1
Gattung Elunavirus
Spezies Elunavirus L1 (früher Erwinia-Virus L1), mit Erwinia-Phage vB_EamP-L1[ 13]
Spezies „Pantoea agglomerans phage vB_PagP-SK1 “ („Pantoea-Phage vB_PagP-SK1“, „vB_PagP-SK1“)[ 13]
Gattung Foetvirus
Spezies Foetvirus SRT7 , mit Escherichia-Phage SRT7
TEM -Aufnahme von Virionen der Spezies Pseudomonas-Virus gh1
Gattung Ghunavirus (11 Spezies)
Spezies Ghunavirus gh1 (früher Pseudomonas-Virus gh1), mit Pseudomonas-Phage gh-1
…
Gattung Helsettvirus
Spezies Helsettvirus fPS9 , mit Yersinia phage fPS-9
Spezies Helsettvirus fPS53 , mit Yersinia phage fPS-53
Spezies Helsettvirus fPS59 , mit Yersinia phage fPS-59
Spezies Helsettvirus fPS54ocr , mit Yersinia phage fPS-54-ocr
Gattung Jarilovirus
Spezies Jarilovirus jarilo , mit Pectobacterium-Phage Jarilo
Gattung Kayfunavirus (19 Spezies)
Spezies Kayfunavirus K1F , mit Escherichia-Phage K1F
…
Gattung Minipunavirus
Spezies Minipunavirus MmP1 , mit Morganella-Phage MmP1
Spezies Minipunavirus MP2 , mit Morganella-Phage vB_MmoP_MP2
Gattung Ningirsuvirus
Spezies Ningirsuvirus JA10 , mit Dickeya-Phage vB_DsoP_JA10, engl. Dickeya phage_vB_DsoP_JA10
Spezies Ningirsuvirus ninurta , mit Dickeya-Phage Ninurta
Gattung Pektosvirus
Spezies Pektosvirus PP47 , mit Pectobacterium-Phage PP47
Spezies Pektosvirus PP81 , mit Pectobacterium-Phage PP81
Spezies Pektosvirus PPWS4 , mit Pectobacterium-Phage PPWS4 DNA
Gattung Phutvirus
Spezies Phutvirus PPpW4 (früher Pseudomonas-Virus PPpW4), mit Pseudomonas-Phage PPpW-4
Gattung Pifdecavirus (7 Spezies)
Spezies Pifdecavirus Pf10 , mit Pseudomonas-Phage Pf-10
…
Gattung Pijolavirus
Spezies Pijolavirus PspYZU08 , mit Pseudomonas-Phage PspYZU08
Gattung Przondovirus (veraltet Kp32virus , 34 Spezies)
Spezies Przondovirus amrap , mit Klebsiella-Phage Amrap
Spezies Przondovirus BIS33 , mit Klebsiella-Phage vB_KpnP_BIS33
Spezies Przondovirus emom , mit Klebsiella-Phage Emom
Spezies Przondovirus henu1 , mit Klebsiella-Phage Henu1
Spezies Przondovirus K5 Klebsiella-Phage K5
Spezies Przondovirus K11 Klebsiella-Phage K11
Spezies Przondovirus K30 Escherichia-Phage K30
Spezies Przondovirus K52 Escherichia-Phage K5-2
Spezies Przondovirus K54 Escherichia-Phage K5-4
Spezies Przondovirus Kp1 Klebsiella-Phage vB_Kp1
Spezies Przondovirus KP32 Klebsiella-Phage KP32
Spezies Przondovirus KP32i192 , mit Klebsiella-Phage KP32_isolate 192
Spezies Przondovirus kpssk3 , mit Klebsiella-Phage kpssk3
Spezies Przondovirus KpV289 Klebsiella-Phage vB_KpnP_KpV289
Spezies Przondovirus oda , mit Klebsiella-Phage Oda
Spezies Przondovirus pharr , mit Klebsiella-Phage Pharr
Spezies Przondovirus saitama , mit Klebsiella-Phage Saitama
Spezies Przondovirus whistle , mit Klebsiella-Phage Whistle
…
Gattung Teetrevirus (19 Spezies)
Spezies Teetrevirus T3 , mit Enterobacteria-Phage T3 (Zugriffsnummern: KC960671, NC_047864)
Spezies Teetrevirus T3Luria , mit Bacteriophage T3 (Zugriffsnummern: AJ318471, NC_003298)
Spezies Teetrevirus T7M , mit Enterobacteria-Phage T7M
…
TEM -Aufnahme eines Virions der Gattung Teseptimavirus
Gattung Teseptimavirus (veraltet T7virus , T7likevirus , T7-ähnliche Viren , 17 bestätigte Spezies plus Kandidaten-Vorschläge nach NCBI, wo nicht anders vermerkt[ 14] )[ 15]
Spezies Teseptimavirus 13a , mit Escherichia-Phage 13a
Spezies Teseptimavirus C5 , mit Escherichia-Phage C5
Spezies Teseptimavirus CICC80001 , mit Escherichia-Phage CICC 80001
Spezies Teseptimavirus ebrios , mit Escherichia-Phage Ebrios
Spezies Teseptimavirus EG1 , mit Escherichia-Phage EG1
Spezies Teseptimavirus HZ2R8 , mit Escherichia-Phage HZ2R8
Spezies Teseptimavirus HZP2 , mit Escherichia-Phage HZP2
Spezies Teseptimavirus IME15 , mit Stenotrophomonas-Phage IME15 und Aeromonas-Phage PZL-Ah1
Spezies Teseptimavirus IME390 (früher Enterobacteria-Virus IME390), mit Enterobacteria-Phage vB_EcoP_IME390 und Escherichia-Phage vB_EcoP_PHB20
Spezies Teseptimavirus N30 , mit Escherichia-Phage N30
Spezies Teseptimavirus NCA , mit Escherichia-Phage NC-A
Spezies Teseptimavirus T7 (früher Escherichia-Virus T7), mit Escherichia-Phage T7 alias Enterobacteria-Phage T7
Spezies Teseptimavirus tv3A8767 (früher Salmonella-Virus 3A8767), mit Salmonella-Phage 3A_8767
Spezies Teseptimavirus tv64795ec1 (früher Escherichia-Virus 64795ec1), mit Escherichia-Phage 64795_ec1
Spezies Teseptimavirus Vi06 , mit Salmonella-Phage Vi06
Spezies Teseptimavirus YpPY , mit Yersinia-Phage YpP-Y
Spezies Teseptimavirus YpsPG , mit Yersinia-Phage YpsP-G
Spezies „Teseptimavirus S2B “
Spezies „Enterobacteria-Phage W31“ (en. „Phage W31 “)
Spezies „Enterococcus-Phage EFA-2“ (en. „Enterococcus phage EFA-2 “)
Spezies „Escherichia-Phage JB01“ (en. „Escherichia phage JB01 “)
Spezies „Escherichia-Phage N13“ (en. „Escherichia phage N13 “)
Spezies „Bacteriophage PhiI“ (alias „Phage PhiI“)[ 16]
Spezies „Prochlorococcus-Virus 4f“ (en. „Prochlorococcus virus 4f “)
Spezies „Prochlorococcus-Virus 5e“ (en. „Prochlorococcus virus 5e “)
Spezies „Prochlorococcus-Virus 5f“ (en. „Prochlorococcus virus 5f “)
Spezies „Prochlorococcus-Virus 6b“ (en. „Prochlorococcus virus 6b “)
Spezies „Prochlorococcus-Virus 6ed6p“ (en. „Prochlorococcus virus 6ed6p “)
Spezies „Prochlorococcus-Virus 7g“ (en. „Prochlorococcus virus 7g “)
Spezies „Prochlorococcus-Virus d67f2“ (en. „Prochlorococcus virus d67f2 “)
Spezies „Pseudomonas-Phage phiPLS27“ (en. „Pseudomonas phage phiPLS27 “)
Spezies „Pseudomonas-Virus Pf1 ERZ-2017“ (en. „Pseudomonas virus Pf1 ERZ-2017 “)
Spezies „Salmonella-Phage C2“ (en. „Salmonella phage C2 “)
Spezies „Serratia-Phage Pila“ (en. „Serratia phage Pila “)[ 17]
Spezies „Synechococcus-Virus 11bc6“ (en. „Synechococcus virus 11bc6 “)
Spezies „Synechococcus-Virus 11ec6“ (en. „Synechococcus virus 11ec6 “)
Spezies „Synechococcus-Virus 2fc6“ (en. „Synechococcus virus 2fc6 “)
Spezies „Synechococcus-Virus 4dc“ (en. „Synechococcus virus 4dc “)
Spezies „Synechococcus-Virus 5gcp“ (en. „Synechococcus virus 5gcp “)
Spezies „Synechococcus-Virus 6bc6“ (en. „Synechococcus virus 6bc6 “)
Spezies „Synechococcus-Virus 7dc6“ (en. „Synechococcus virus 7dc6 “)
Spezies „Synechococcus-Virus 9ec6“ (en. „Synechococcus virus 9ec6 “)
Spezies „Synechococcus-Virus 9ecp“ (en. „Synechococcus virus 9ecp “)
Spezies „Synechococcus-Virus c7e4“ (en. „Synechococcus virus c7e4 “)
Spezies „T7-like bacteriophage Eptesicus fuscus/P1/IT/USA/2009 “
Spezies „Yersinia-Phage phiA1122“ (en. „Yersinia phage phiA1122 “! „Yersinia pestis bacteriophage phiA1122 “)
Spezies „Yersinia-Phage phiR3“ (en. „Yersinia phage phiR3 “, „Yersinia enterocolitica bacteriophage phiR3 “)
Spezies „Yersinia-Phage R“ (en. „Yersinia phage R “, „Yersinia pestis phage R “)
Spezies „Yersinia-Phage Y“ (en. „Yersinia phage Y “, „Yersinia pestis bacteriophage Y “)
Spezies „Yersinia-Phage YpP-R“ (en. „Yersinia phage YpP-R “)
Gattung Troedvirus
Spezies Troedvirus Phi15 , mit Pseudomonas-Phage Phi15
Gattung Unyawovirus
Spezies Unyawovirus DUPPII , mit Pectobacterium-Phage DUPPII
Gattung Warsawvirus
Spezies Warsawvirus 3MF5 , mit Pseudomonas-Phage vB_PsyP_3MF5
00 Unterfamilie nicht bestimmt:
Gattung Aegirvirus
Spezies Aegirvirus SCBP42 (früher Synechococcus-Virus SCBP42), mit Synechococcus-Phage S-CBP42
Gattung Anchaingvirus
Spezies Anchaingvirus anchaing , mit Ralstonia-Phage Anchaing
Gattung Aqualcavirus
Spezies Aqualcavirus P14 , mit Aquamicrobium-Phage P14
Gattung Ashivirus
Spezies Ashivirus S45C4 , mit Phage MedDCM-OCT-S45-C4, engl. Uncultured phage_MedDCM-OCT-S45-C4
Spezies „Synechococcus-Phage S-SBP1“ (alias „Cyanopodovirus S-SBP1“, Wirt Synechococcus -Stamm WH7803)[ 18] [ 19]
Gattung Atuphduovirus
Spezies Atuphduovirus atuph02 , mit Agrobacterium-Phage Atu_ph02
Spezies Atuphduovirus atuph03 , mit Agrobacterium-Phage Atu_ph03
Gattung Ayakvirus
Spezies Ayakvirus Ap1 , mit Ralstonia-Phage phiAp1
Gattung Ayaqvirus
Spezies Ayaqvirus S45C18 , mit Phage MedDCM-OCT-S45-C18, engl. Uncultured phage_MedDCM-OCT-S45-C18
Gattung Banchanvirus
Spezies Banchanvirus SS1201 , mit Prochlorococcus-Virus SS120-1 alias Cyanophage SS120-1
Gattung Bifseptvirus
Spezies Bifseptvirus andromeda , mit Pseudomonas-Phage Andromeda
Spezies Bifseptvirus Bf7 , mit Pseudomonas-Phage Bf7
Gattung Bonnellvirus
Spezies Bonnellvirus J865 , mit Escherichia-Phage J8-65
Spezies Bonnellvirus lidtsur , mit Escherichia-Phage Lidtsur
Gattung Cheungvirus
Spezies Cheungvirus NATL1A7 , mit Prochlorococcus-Phage NATL1A-7 alias Cyanophage NATL1A-7
Gattung Chosvirus
Spezies Chosvirus KM23C739 , mit Phage Deep1-GF2-KM23-C739, engl. Uncultured phage_Deep1-GF2-KM23-C739
Gattung Cuernavacavirus
Spezies Cuernavacavirus RHEph02 , mit Rhizobium-Phage RHEph02
Spezies Cuernavacavirus RHEph08 , mit Rhizobium-Phage RHEph08
Spezies Cuernavacavirus RHEph09 , mit Rhizobium-Phage RHEph09
Gattung Cyclitvirus
Spezies Cyclitvirus cyclit (früher Vibrio-Virus Cyclit), mit Vibrio-Phage 1.204.O._10N.222.46.F12
Gattung Ermolevavirus
Spezies Ermolevavirus PGT2 , mit Escherichia-Phage PGT2
Spezies Ermolevavirus PhiKT , mit Escherichia-Phage phiKT
Gattung Foturvirus
Spezies Foturvirus H44 (früher Alteromonas-Virus vB_AspP-H4/4), mit Alteromonas-Phage vB_AspP-H4/4
Gattung Foussvirus
Spezies Foussvirus S46C10 , mit Phage MedDCM-OCT-S46-C10, engl. Uncultured phage MedDCM-OCT-S46-C10
Gattung Fussvirus
Spezies Fussvirus S30C28 , mit Phage MedDCM-OCT-S30-C28, engl. Uncultured phage_MedDCM-OCT-S30-C28
Gattung Gajwadongvirus
Spezies Gajwadongvirus ECBP5 , mit Escherichia-Phage ECBP5
Spezies Gajwadongvirus PP99 , mit Pectobacterium-Pphage PP99
Gattung Gyeongsanvirus
Spezies Gyeongsanvirus DURPI , mit Ralstonia-Virus DURP
Spezies Gyeongsanvirus RsoP1EGY , mit Ralstonia-Virus RsoP1EGY
Gattung Igirivirus
Spezies Igirivirus STIP37 , mit Synechococcus-Phage STIP37, engl. Synechococcus T7-like phage S-TIP37
Gattung Jalkavirus
Spezies Jalkavirus S08C159 , mit Phage MedDCM-OCT-S08-C159, engl. Uncultured phage_MedDCM-OCT-S08-C159
Gattung Jiaoyazivirus
Spezies Jiaoyazivirus RSB3 , mit Ralstonia-Phage RSB3
Gattung Kafavirus (früher Kawavirus )
Spezies Kafavirus SWcelC56 (früher Kawavirus SWcelC56 ), mit Phage MedPE-SWcel-C56
Gattung Kajamvirus
Spezies Kajamvirus SRIP1 , mit Synechococcus-Phage SRIP1 alias Cyanophage S-RIP1
Gattung Kakivirus
Spezies Kakivirus PS3 (früher Providencia-Virus PS3), mit Providencia-Phage vB_PstP_PS3
Gattung Kalppathivirus
Spezies Kalppathivirus P26059B , mit Curvibacter-Phage P26059B
Gattung Kelmasvirus
Spezies Kelmasvirus RSB2 , mit Ralstonia-Phage RSB2
Gattung Kembevirus
Spezies Kembevirus SCBP2 , mit Synechococcus-Phage S-CBP2 alias Cyanophage S-CBP2[ 20]
Gattung Krakvirus
Spezies Krakvirus S39C11 , mit Phage MedDCM-OCT-S39-C11, engl. Uncultured phage_MedDCM-OCT-S39-C11
Gattung Lauvirus
Spezies Lauvirus lau218 (früher Podovirus Lau218 ), mit Podophage Lau218
Gattung Limelightvirus
Spezies Limelightvirus limelight , mit Pantoea-Phage LIMElight
Gattung Lingvirus
Spezies Lingvirus PGSP1 , mit Prochlorococcus-Phage P-GSP1 alias Cyanophage P-GSP1
Gattung Lirvirus
Spezies Lirvirus SCBP3 , mit Synechococcus-Phage S-CBP3 alias Cyanophage S-CBP3
Gattung Lullwatervirus
Spezies Lullwatervirus lullwater , mit Caulobacter-Phage Lullwater
Gattung Maculvirus
Spezies Maculvirus KF1 (früher Vibrio-Virus KF1), mit Vibrio-Phage vB_VpaP_KF1
Spezies Maculvirus KF2 (früher Vibrio-Virus KF2), mit Vibrio-Phage vB_VpaP_KF2
Spezies Maculvirus OWB (früher Vibrio-Virus OWB), mit Vibrio-Phage_vB_VpaS_OWB
Spezies Maculvirus VP93 , mit Vibrio-Phage VP93
Gattung Napahaivirus
Spezies Napahaivirus VSW3 , mit Pseudomonas-Phage VSW-3
Gattung Nohivirus
Spezies Nohivirus S31C1 , mit Phage MedDCM-OCT-S31-C1, engl. Uncultured phage_MedDCM-OCT-S31-C1
Gattung Oinezvirus
Spezies Oinezvirus S37C6 , mit Phage MedDCM-OCT-S37-C6. engl. Uncultured phage_MedDCM-OCT-S37-C6
Gattung Paadamvirus
Spezies Paadamvirus RHEph01 mit Rhizobium-Phage RHEph01
Gattung Pagavirus
Spezies Pagavirus S05C849 , mit Phage MedDCM-OCT-S05-C849, engl. Uncultured phage_MedDCM-OCT-S05-C849
Gattung Pairvirus
Spezies Pairvirus Lo5R7ANS (früher Mesorhizobium-Virus Lo5R7ANS), mit Mesorhizobium-Phage vB_MloP_Lo5R7ANS
Gattung Pedosvirus
Spezies Pedosvirus S28C3 , mit Phage MedDCM-OCT-S28-C3, engl. Uncultured phage_MedDCM-OCT-S28-C3
Gattung Pekhitvirus
Spezies Pekhitvirus S04C24 , mit Phage MedDCM-OCT-S04-C24, engl. Uncultured phage_MedDCM-OCT-S04-C24
Gattung Pelagivirus
Spezies Pelagivirus HTVC019P , mit Pelagibacter-Phage HTVC019P
Spezies Pelagivirus S35C6 , mit Phage MedDCM-OCT-S35-C6, engl. Uncultured phage_MedDCM-OCT-S35-C6
Gattung Percyvirus
Spezies Percyvirus percy , mit Caulobacter-Phage Percy
Gattung Piedvirus
Spezies Piedvirus IMEDE1 , mit Delftia-Phage IME-DE1
Gattung Podivirus
Spezies Podivirus S05C243 , mit Phage MedDCM-OCT-S05-C243, engl. Uncultured phage_MedDCM-OCT-S05-C243
Gattung Pollyceevirus
Spezies Pollyceevirus pollyC , mit Pseudomonas-Phage PollyC
Gattung Poseidonvirus
Spezies Poseidonvirus SCBP4 , mit Synechococcus-Phage S-CBP4 alias Cyanophage S-CBP4
Gattung Powvirus
Spezies Powvirus S08C41 , mit Phage MedDCM-OCT-S08-C41, engl. Uncultured phage MedDCM-OCT-S08-C41
Gattung Pradovirus
Spezies Pradovirus f20 , mit Xanthomonas-Phage f20-Xaj
Spezies Pradovirus f30 , mit Xanthomonas-Phage f30-Xaj
Spezies Pradovirus prado , mit Xylella-Phage Prado
Spezies Pradovirus XAJ24 , mit Xanthomonas-Phage XAJ24
Spezies Pradovirus Xc10 , mit Xanthomonas-Phage phi Xc10
Gattung Qadamvirus
Spezies Qadamvirus SB28 , mit Synechococcus-Phage S-B28
Gattung Scottvirus
Spezies Scottvirus scott , mit Sphingomonas-Phage Scott
Gattung Sednavirus
Spezies Sednavirus SRIP2 (früher Synechococcus-Virus SRIP2, veraltet Cyanopodovirus S-RIP2 ), mit Synechococcus-Phage S-RIP2 alias Cyanophage S-RIP2, und Cyanophage KBS-P-1A[ 18] [ 21]
Gattung Serkorvirus
Spezies Serkorvirus ITL1 , mit Ralstonia-Phage phiITL-1
Gattung Sieqvirus
Spezies Sieqvirus S42C7 , mit Phage MedDCM-OCT-S42-C7, engl. Uncultured phage_MedDCM-OCT-S42-C7
Gattung Stompelvirus
Spezies Stompelvirus RPSC1 , mit Ralstonia-Phage RPSC1
Gattung Stopalavirus
Spezies Stopalavirus S38C3 , mit Phage MedDCM-OCT-S38-C3, engl. Uncultured phage_MedDCM-OCT-S38-C3
Gattung Stopavirus
Spezies Stopavirus HTVC011P , mit Pelagibacter-Phage HTVC011P
Gattung Stupnyavirus
Spezies Stupnyavirus KM16C193 , mit Phage Deep-GF0-KM16-C193, engl. Uncultured phage_Deep-GF0-KM16-C193
Gattung Tangaroavirus
Spezies Tangaroavirus NATL2A133 , mit Prochlorococcus-Phage NATL2A-133 alias Cyanophage NATL2A-133
Spezies Tangaroavirus PSSP10 , mit Prochlorococcus-Phage P-SSP10
Spezies Tangaroavirus tv951510a , mit Cyanophage 9515-10a und Prochlorococcus-Phage P-SSP6
Gattung Tawavirus
Spezies Tawavirus JSF7 , mit Vibrio-Phage JSF7
Adsorption von P-SSP7-Phagen an Prochlorococcus marinus MED4, visualisiert durch Kryo-ET .
Gattung Tiamatvirus
Spezies Tiamatvirus PSSP7 (früher Cyanopodovirus PSSP7 oder Cyanopodovirus P-SSP7 , früher zur informellen Gattung Cyanopodovirus ), mit Prochlorococcus-Phage P-SSP7 alias Cyanophage P-SSP7, Wirt Prochlorococcus -Stamm MED4[ 18] [ 22] [ 23] [ 24]
Gattung Tiilvirus
Spezies Tiilvirus P60 , mit Synechococcus-Phage P60 alias Cyanophage P60[ 25] [ 26] [ 27]
Gattung Tritonvirus
Tritonvirus PSSP2 , mit Synechococcus-Phage P-SSP2 alias Cyanophage P-SSP2
Tritonvirus PSSP3 , mit Prochlorococcus-Phage P-SSP3 alias Cyanophage P-SSP3
Gattung Voetvirus
Voetvirus syn5 (früher Synechococcus-Virus Syn5), mit Synechococcus-Phage syn5 alias Cyanophage Syn5[ 28] [ 29] [ 24]
Gattung Votkovvirus
Spezies Votkovvirus S28C10 , mit Phage MedDCM-OCT-S28-C10, engl. Uncultured phage_MedDCM-OCT-S28-C10
Gattung Waewaevirus
Spezies Waewaevirus limezero , mit Pantoea-Phage Limezero alias Pantoea-Phage LIMEzero
Gattung Wuhanvirus (wohl zu unterscheiden von SARS-CoV-2 , dem Erreger von COVID-19 )
Spezies Wuhanvirus PHB01 , mit Pasteurella-Phage PHB01
Spezies Wuhanvirus PHB02 , mit Pasteurella-Virus PHB02
ohne Gattungszuweisung gemäß Taxonomie des National Center for Biotechnology Information (NCBI)[ 30] (Auswahl):
Spezies „Cyanophage KBS-S-1A “
Spezies „Prochlorococcus phage P-RSP2 “ syn. „Cyanophage P-RSP2 “
Spezies „Prochlorococcus phage P-SCSP1a “
…
Spezies „Prochlorococcus phage P-SCSP2 “
Spezies „Prochlorococcus phage P-TIP1 “ syn. „Prochlorococcus T7-like virus P-TIP1 “
Spezies „Prochlorococcus phage P-TIP2 “ syn. „Prochlorococcus T7-like virus P-TIP2 “
Spezies „Prochlorococcus phage P-TIP38 “ syn. „Prochlorococcus T7-like virus P-TIP38 “
…
Spezies „Synechococcus phage DSL-LC07 “
Spezies „Synechococcus phage S-CBP1 “ syn. „Cyanophage S-CBP1 “
Spezies „Synechococcus phage S-SRP01 “
Spezies „Synechococcus phage S-SRP02 “
…
Anmerkung: Die Cyanophagen vom Morphotyp der Myoviren werden in überkommener Weise in einer informellen Gattung Cyanopodovirus zusammengefasst. Viele davon werden wegen genomischer Ähnlichkeit zu Escherichia-Virus T7 inzwischen zu den Autographiviridae , insbesondere der Unterfamilie Studiervirinae um Phage T7 gestellt.[ 31] [ 32]
Weblinks
Einzelnachweise
↑ ICTV: ICTV Master Species List 2021.v2 , New MSL including some corrections.
↑ a b c ICTV: ICTV Taxonomy history: Enterobacteria phage T4 , EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
↑ a b c Viral Zone. ExPASy, abgerufen am 29. Dezember 2018 .
↑ ICTV : Virus Taxonomy. Abgerufen am 29. Dezember 2018 .
↑ D. Scholl, J. Kieleczawa, P. Kemp, J. Rush, C. C. Richardson, C. Merril, S. Adhya, I. J. Molineux: Genomic analysis of bacteriophages SP6 and K1-5, an estranged subgroup of the T7 supergroup . In: Journal of Molecular Biology . Band 335 , Nr. 5 , 2004, S. 1151–1171 , doi :10.1016/j.jmb.2003.11.035 , PMID 14729334 .
↑ ICTV : Taxonomy Browser .
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Desislava A. Raytcheva, Cameron Haase-Pettingell, Jacqueline Piret, Jonathan A. King: Two Novel Proteins of Cyanophage Syn5 Compose Its Unusual Horn Structure . In: ASM Journal of Virology . 88. Jahrgang, Nr. 4 , 15. Februar 2014, ISSN 0022-538X , S. 2047–2055 , doi :10.1128/JVI.02479-13 , PMID 24307583 , PMC 3911526 (freier Volltext) – (englisch). Epub 31. Januar 2014. Siehe insbes. Fig. 1 (mit B: Schemazeichnung).
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Stephen T. Abedon, Richard Calendar (Hrsg.): The Bacteriophages. 2. Auflage. Oxford University Press, 2005, ISBN 0-19-803385-0 , S. 518f. (books.google.de) (englisch ).