Corresponen a l'Organisme Autònom Parcs Nacionals les següents funcions:[3]
La formulació de la política nacional en matèria de parcs nacionals, així com proposar la normativa i desenvolupar els instruments de planificació i administratius que permetin complir amb els objectius establerts per aquesta política.
El desenvolupament de les funcions i l'exercici de les competències que en matèria de parcs nacionals li atribueix la normativa estatal, en particular la Llei 30/2014, de 3 de desembre, de Parcs Nacionals, i les seves normes de desenvolupament.
La planificació i gestió dels espais naturals de competència estatal adscrits o de la seva titularitat.
La gestió de les muntanyes, finques i altres béns patrimonials adscrits o de la seva titularitat.
El suport, com a mitjà instrumental per al desenvolupament d'accions concretes, al desenvolupament de les polítiques del departament en matèria de biodiversitat, conservació i ús sostenible dels recursos naturals, conservació de fauna, flora, hàbitat i ecosistemes naturals en el medi terrestre i marí.
Prestació al públic de serveis d'informació i documentació especialitzats en matèria d'espais protegits, conservació de la naturalesa, divulgació, comunicació i educació ambiental.
Organització, suport i desenvolupament d'actuacions d'educació, formació, informació, intercanvi d'idees i debat, sensibilització i comunicació per al desenvolupament de les funcions anteriors.
El suport, com a mitjà instrumental per al desenvolupament d'accions concretes, al desenvolupament de les polítiques del Departament en matèria d'educació, informació, sensibilització, formació i participació pública sobre temes mediambientals a través del Centre Nacional d'Educació Ambiental, (CENEAM), que depèn funcionalment de la Subsecretaria.
Cooperació amb entitats públiques i privades, tant d'àmbit nacional (estatal, autonòmic i local) com a internacional, per al desenvolupament de les funcions anteriors.