Sipayung adalah salah satu margaBatak yang terdapat dalam masyarakat Batak Simalungun dan Batak Toba. Leluhur marga Sipayung adalah Raja Silahi Sabungan yang berasal dari Silalahi Nabolak karena merupakan turunan dari Situngkir. Awalnya, marga Sipayung berasal dari keturunan Paung Raja dari Silalahi Nabolak. Keturunannya kemudian menyebar ke Samosir dan Simalungun. Bersama keturunan Situngkir, kelompok marga Sipayung juga bermukim di Lumban Sipayung, Parbaba dan di sekitar Pangururan, Samosir. Marga Sipayung memiliki saudara seayah seibu, yaitu marga Sipangkar.
Dalam masyarakat Batak Simalungun, marga Sipayung mengikat padan (hubungan perjanjian) dengan marga Sinaga. Di Simalungun Kahean, dahulu sering kali didapati penamaan Sipayung Sinaga, yang menyatakan sebenarnya bahwa marga mereka adalah Sipayung.[butuh rujukan]
Menurut cerita, keberadaan Sipayung di Simalungun berasal dari daerah Soping dan menyebar ke kerajaan Purba, Silimakuta, dan Dolog Silou. Dari Kerajaan Dolog Silou (sekitar Dolog Marawa/Marubun), barulah marga Sipayung kemudian menyebar ke daerah Simalungun hilir lainnya. Pada zaman kolonial Belanda, Kerajaan Dolog Silou terbagi dalam distrik Dolog Silou dan Silou Kahean.