Poliadenilasi

Poliadenilasi adalah modifikasi pasca transkripsional dari Ribonucleic Acid (RNA) yang ditemukan di semua sel dan di dalam organel.^[1] Poliadenilasi dari ujung 3 terjadi sebelum messenger-RNA (mRNA) meninggalkan nukleus. Ekor polyadenylate ini, panjangnya sekitar 100-200 nukleotida, yang melindungi mRNA dari aksi degradasi fosfatase dan nuklease.^[2] Nantinya pre-mRNA dibelah pada situs poliadenilasi (A) dan ditambahkan ekor poliadenilasi (A), yang merupakan proses yang diperlukan untuk pembentukan mRNA normal. Gen dengan beberapa situs poli (A) dapat menjalani alternative polyadenylation (APA), menghasilkan isoform mRNA yang berbeda dengan 3 ′ daerah yang tidak diterjemahkan (3 ′ UTR) dan juga dalam beberapa kasus wilayah pengkodean berbeda. Dua pertiga dari semua gen manusia menjalani APA.^[3]

Ekor poliadenilasi (A) ditemukan pada ujung RNA 3 dari hampir setiap mRNA eukariotik yang telah diproses sepenuhnya dan telah disarankan untuk mempengaruhi hampir semua aspek metabolisme mRNA.^[4]

Ekor poliadenilasi -A adalah rantai panjang nukleotida adenin yang ditambahkan ke molekul mRNA selama pemrosesan RNA untuk meningkatkan stabilitas molekul. Segera setelah gen dalam sel eukariotik ditranskrip, molekul RNA baru mengalami beberapa modifikasi yang dikenal sebagai pemrosesan RNA. Modifikasi ini mengubah kedua ujung transkrip RNA primer untuk menghasilkan molekul mRNA yang matang. Pemrosesan pada ujung RNA 3' menambahkan ekor poli-A ke molekul RNA. Pertama, ujung transkrip 3 'dibelah untuk membebaskan hidroksil 3'. Kemudian enzim yang disebut poly-A polimerase menambahkan rantai nukleotida adenin ke RNA. Proses inilah yang disebut sebagai poliadenilasi, yaitu proses menambahkan ekor poli-A yang panjangnya antara 100 dan 250 residu.^[5]

Proses yang diperlukan untuk sintesis mRNA, yaitu melalui pembelahan RNA endonucleolityc yang digabungkan dengan sintesis polyadenosine monophosphate (adenine base), pada ujung RNA 3' yang baru dibentuk. Elemen urutan untuk poliadenilasi adalah sinyal poliadenilasi (POLYA_SIGNAL) dan situs poliadenilasi (POLYA_SITE). Dalam mRNA atau complementary DNA (cDNA), peregangan tambahan dari polyadenosine monophosphate adalah ekor poliadenilasi (POLYA_TAIL).^[6]

Ada beberapa fungsi poliadenilasi, diantaranya:

• Mendestabilisasi molekul copA dan sok terpotong yang dihasilkan oleh RNase E, Seperti dalam kasus RNA I.

RNA I adalah molekul antisense 108 nukleotida yang membentuk dupleks dengan primer DNA dan RNA II . Penghambatan replikasi DNA pBR322 dengan tidak adanya PAP Iditunjukkan sebagai hasil dari akumulasi produk pembelahan RNase E dari RNA I, yang tidak memiliki lima 5 'nukleotida dari transkrip primer, yang harus dipoladenilasi agar terdegradasi.^[1]

• Berkontribusi terhadap degradasi fragmen cepat yang dihasilkan oleh pencernaan mRNA endonukleolitik

Pemetaan persimpangan mRNA-poliadenilasi(A) di beberapa lokasi dalam beberapa transkrip memperkuat gagasan bahwa poliadenilasi (A) polimerase I dapat melakukan polyadenylate dan mendestabilisasi banyak fragmen RNA yang berbeda dengan berbagai ekstremitas 3 'yang diperkirakan dihasilkan oleh endo dan pembelahan exoribonucleolytic.^[1]

• Memungkinkan penyelamatan bakteriofag MS2 mutan yang genomnya terdegradasi oleh RNase III.

Dalam hal ini, penambahan residu A oleh PAP I pada ujung 3 'genom RNA yang terfragmentasi (atau untaian komplementer terfragmentasi yang digunakan sebagai templat selama replikasi) memungkinkan pemilihan gen resisten RNase III yang mengandung insersi peregangan As atau Us.^[1]

1. ^ ^{a b c d} Régnier, Philippe; Marujo, Paulo E. (2013). Polyadenylation and Degradation of RNA in Prokaryotes (dalam bahasa Inggris). Landes Bioscience. 
2. ^ "Polyadenylation - an overview | ScienceDirect Topics". www.sciencedirect.com. Diakses tanggal 2020-02-03. 
3. ^ Rehfeld, Anders; Plass, Mireya; Krogh, Anders; Friis-Hansen, Lennart (2013). "Alterations in Polyadenylation and Its Implications for Endocrine Disease". Frontiers in Endocrinology (dalam bahasa English). 4. doi:10.3389/fendo.2013.00053. ISSN 1664-2392. Pemeliharaan CS1: Bahasa yang tidak diketahui (link)
4. ^ Colgan, Diana F.; Manley, James L. (1997-11-01). "Mechanism and regulation of mRNA polyadenylation". Genes & Development (dalam bahasa Inggris). 11 (21): 2755–2766. doi:10.1101/gad.11.21.2755. ISSN 0890-9369. PMID 9353246. 
5. ^ "poly-A tail | Learn Science at Scitable". www.nature.com. Diakses tanggal 2020-02-03. 
6. ^ "IMGT Education". www.imgt.org (dalam bahasa Inggris). Diakses tanggal 2020-02-03.