Partai tersebut memiliki 592 anggota pada 25 Agustus 2007, ketika partai tersebut disebut Partai Jepang Hijau (みどりのテーブルcode: ja is deprecated , Midori no Tēburu, "meja hijau"). Setelah keberhasilan elektoral dari aktivis Hijau Ryuhei Kawada dalam pemilihan Dewan Penasihat 2007, jaringan politik hijau lokal Pelangi dan Hijau dikabarkan membubarkan diri sendiri dan bergabung dengan Partai Hijau Jepang pada Desember 2007. Dua organisasi preseden tersebut membubarkan diri mereka sendiri dan membuat peluncuran ulang sebagai Partai Hijau Jepang, sebuah organisasi politik pada akhir 2008, dengan bekas nama Jepang-nya, Midori no Mirai (みどりの未来 - "masa depan hijau").
Pada 28 Juli 2012, partai tersebut secara resmi didirikan ulang dengan nama barunya oleh para anggota majelis lokal dan sekelompok masyarakat untuk maju dalam pemilihan Majelis Tinggi untuk mengurangi dan akhirnya mengakhiri pembangkit listrik tenaga nuklir di Jepang dan menentang keterlibatan negara tersebut dalam Kemitraan Trans-Pasifik, yang keduanya dilakukan oleh Perdana MenteriYoshihiko Noda dari Partai Demokratik Jepang.
