Daisendorf terletak di pinggir utara Danau Konstanz dengan ketinggian antara 480–550 m dpl, sekitar 2 kilometer barat laut pusat kota Meersburg dan sekitar jarak yang sama di tenggara Uhldingen-Muhlhofen. Di selatan, Daisendorf berbatasan dengan Meerschburg.
Alam
Di timur kota ini terdapat kolam Neuweiher yang merupakan sumber air tersembunyi di balik hutan. Menurut dokumen terkenal Meersburger Stadtarchiv, Neuweiher dibangun pada tahun 1445; pada Abad Pertengahan biasa digunakan untuk mengaliri parit di Meersburg. Kolam itu memiliki luas 570 m² dengan kedalaman 4,1 m.[2]