父親费利佩五世患有躁狂抑鬱症及而他的憂鬱症越來越深。因為他的性格被動,所以他完全受制第二任妻子來自埃麗莎貝塔·法爾內塞。埃麗莎貝塔身為费迪南多六世的繼母,只寵愛自己所生的孩子,所以她視费迪南多六世為她的孩子的絆腳石。费迪南多六世早年亦因此被繼母阻撓不得參與政事。费迪南多六世為人憂鬱、害羞和對自己的能力沒有自信。雖然费迪南多六世從來都避免作出決定,而且做事不夠堅定,但是他在1754年粉碎首相恩塞納達侯爵(英语:Zenón de Somodevilla y Bengoechea, Marquis of Ensenada)的謀反事件中,顯得決斷,费迪南多六世即時解除他一切職務及將他囚禁。