- Anisochaetodon Klunzinger, 1884
- Apporetochaetodon Maugé & Bauchot, 1984
- Arambourgchaetodon Carnevale, 2006
- Aspilurochaetodon Maugé & Bauchot, 1984
- Burgessius Maugé & Bauchot, 1984
- Byssochaetodon Maugé & Bauchot, 1984
- Cahetodon
- Chaethodon 1758
- Chaetodonton
- Chaetodontops Bleeker, 1876
- Chetodon
- Choetodon Müller, 1774
- Citharoedus Kaup, 1860
- Corallochaetodon Burgess, 1978
- Discochaetodon Nalbant, 1971
- Eteira Kaup, 1860
- Exornator Nalbant, 1971
- Gonochaetodon Bleeker, 1876
- Hemichaetodon Bleeker, 1876
- Heminigellus Nalbant, 1984
- Heterochaetodon Maugé & Bauchot, 1984
- Lepidochaetodon Bleeker, 1876
- Linophora Kaup, 1860
- Loa Jordan, 1921
- Megapotodon
- Megaprotodon Guichenot, 1848
- Mesochaetodon Maugé & Bauchot, 1984
- Nalbanthius Maugé & Bauchot, 1984
- Nalbantius Maugé & Bauchot, 1984
- Nesochaetodon Maugé & Bauchot, 1984
- Osteochromis Franz, 1910
- Oxychaetodon Bleeker, 1876
- Paracanthochaetodon Schmidt & Lindberg, 1930
- Rabdophorus Swainson, 1839
- Rhabdophorus Agassiz, 1846
- Rhombochaetodon Burgess, 1978
- Roaops Maugé & Bauchot, 1984
- Sarothrodus Gill, 1861
- Strongylochaetodon Maugé & Bauchot, 1984
- Tetrachaetodon Weber & de Beaufort, 1936
- Tetragonopterus Bleeker, 1863
- Tetragonoptrus Walbaum
- Tholichthys Günther, 1868
- Tifia Jordan, 1922
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