Plazi是一家以支持和促进数字生物分类学文献的长期、公开访问为目的的国际非营利性组织,总部位于瑞士。Plazi是生物多样性文献库(Biodiversity Literature Repository)的共同创立者。该组织使用TreatmentBank服务,将分类学出版物的数据转化为XML格式的FAIR数据,并在Zenodo上建立并维护可供公开访问的生物多样性文献库(Biodiversity Literature Repository)。[1][2]Plazi致力于宣传科学讨论和科学数据的开放获取的重要意义,它是生物多样性信息学领域中快速发展的在线分类学的贡献者。[3]
该方式最初由美国国家科学基金会、德国科学基金会、美國自然史博物館和卡尔斯鲁厄理工学院的共同合作开发的。该方式试图创建使用XML格式对生物系统文献的内容进行建模分类。旧的学术出版物则使用GoldenGATE的半自动编辑器创建的TaxonX格式。[4]
当下,Plazi依然在使用GoldenGATE作为一个复杂的标记工具,从而允许学术界参与并提高文档质量。[5][6]
Plazi开发了多种方法,可通过全球生物多样性信息设施(GBIF)收集的TAPIR服务访问当前已发布的分类学文献中的数据记录。[7]同时可通过物种页面模型(SPM)传输模式,从而获取第三方机构,如生命百科全书(EOL)的分类数据(物种和更高分类群的科学描述)。目前,达尔文核心档案(DwC-A)传输到全球生物多样性信息设施(GBIF)的数据为33,623个数量集,占GBIF中所有数据集的比重超过50%。[8]并且在可行的前提下,Plazi通过与外部数据库(如GenBank、膜翅目名称服务器或ZooBank(动物学名称注册处))的网络链接来提高文档质量。
Plazi声称其支持版权法规,辩解称生物学分类并不属于文学或艺术作品的范围。因此Plazi认为这部分作品属于公共领域,在科学实践需要的前提下可以自由使用和传播。[9][10]
參見
參考資料
- ^ TreatmentBank. plazi.org. [2020-02-09]. (原始内容存档于2021-05-29).
- ^ Catapano, Terry. Taxpub. Plazi. [2009-10-27]. (原始内容存档于2022-05-06).
- ^ Zauner, H. Evolving e-taxonomy. BMC Evolutionary Biology. 2009, 9: 141. PMC 2714837 . PMID 19555493. doi:10.1186/1471-2148-9-141.
- ^ Sautter, Guido. GoldenGATE Editor. Plazi, Technische Hochschule Karlsruhe. [2009-10-27]. (原始内容存档于2022-01-19).
- ^ Agosti, Donat; Guidoti, Marcus; Sautter, Guido. Liberating the Richness of Facts implicit in taxonomic Publication: ThePlaziWorkflow. Biodiversity Information Science and Standards. 2020, 4 (e59179). doi:10.3897/biss.4.59179 (英语).
- ^ Agosti, Donat; Egloff, Willi. Taxonomic information exchange and copyright: thePlaziapproach. BMC Research Notes. 2008, 2 (53). doi:10.1186/1756-0500-2-53 (英语).
- ^ Plazidata in GBIF. Plazi. [2009-10-27]. (原始内容存档于2016-03-03).
- ^ Plazi.org taxonomic treatments database. gbif.org. [2021-04-25]. (原始内容存档于2022-03-12).
- ^ Taxonomic information exchange and copyright: thePlaziapproach. BMC Research Notes. 2009, 2: 53. PMC 2673227 . PMID 19331688. doi:10.1186/1756-0500-2-53.
- ^ Costello M J. Motivating Online Publication of Data. BioScience. 2009, 59:5 (5): 418 [2009-10-27]. doi:10.1525/bio.2009.59.5.9. (原始内容存档于2011-08-07).
外部链接