TERF2
Наявні структури
PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
1H6P , 1VF9 , 1VFC , 1W0U , 1XG1 , 3BU8 , 3BUA , 3K6G , 3SJM , 4M7C , 4RQI
Ідентифікатори
Символи
TERF2 , TRBF2, TRF2, telomeric repeat binding factor 2
Зовнішні ІД
OMIM : 602027 MGI: 1195972 HomoloGene: 4133 GeneCards: TERF2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • double-stranded telomeric DNA binding • protein homodimerization activity • telomeric DNA binding • telomerase activity • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • G-rich strand telomeric DNA binding • enzyme binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• nuclear telomere cap complex • хромосома • теломера • Mre11 complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця • shelterin complex • axon cytoplasm
Біологічний процес
• negative regulation of telomere single strand break repair • regulation of telomere maintenance • negative regulation of telomere maintenance via semi-conservative replication • negative regulation of gene expression • negative regulation of beta-galactosidase activity • protein localization to chromosome, telomeric region • клітинне старіння • negative regulation of telomere capping • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of nitric-oxide synthase activity • negative regulation of t-circle formation • клітинний цикл • telomeric loop formation • negative regulation of cellular senescence • telomere capping • negative regulation of telomere maintenance via telomere lengthening • negative regulation of exonuclease activity • telomeric D-loop disassembly • negative regulation of telomeric D-loop disassembly • negative regulation of telomere maintenance via recombination • telomere maintenance • RNA-dependent DNA biosynthetic process • negative regulation of telomere maintenance • regulation of telomere maintenance via telomerase • negative regulation of telomere maintenance via telomerase • protection from non-homologous end joining at telomere • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • anterograde axonal transport of messenger ribonucleoprotein complex
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 16: 69.36 – 69.41 Mb
Хр. 8: 107.07 – 107.1 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
TERF2 (англ. Telomeric repeat binding factor 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 542 амінокислот , а молекулярна маса — 59 594[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAAGAGTAGP ASGPGVVRDP AASQPRKRPG REGGEGARRS DTMAGGGGSS
DGSGRAAGRR ASRSSGRARR GRHEPGLGGP AERGAGEARL EEAVNRWVLK
FYFHEALRAF RGSRYGDFRQ IRDIMQALLV RPLGKEHTVS RLLRVMQCLS
RIEEGENLDC SFDMEAELTP LESAINVLEM IKTEFTLTEA VVESSRKLVK
EAAVIICIKN KEFEKASKIL KKHMSKDPTT QKLRNDLLNI IREKNLAHPV
IQNFSYETFQ QKMLRFLESH LDDAEPYLLT MAKKALKSES AASSTGKEDK
QPAPGPVEKP PREPARQLRN PPTTIGMMTL KAAFKTLSGA QDSEAAFAKL
DQKDLVLPTQ ALPASPALKN KRPRKDENES SAPADGEGGS ELQPKNKRMT
ISRLVLEEDS QSTEPSAGLN SSQEAASAPP SKPTVLNQPL PGEKNPKVPK
GKWNSSNGVE EKETWVEEDE LFQVQAAPDE DSTTNITKKQ KWTVEESEWV
KAGVQKYGEG NWAAISKNYP FVNRTAVMIK DRWRTMKRLG MN
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі , хромосомах .
Література
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Broccoli D., Smogorzewska A., Chong L., de Lange T. (1997). Human telomeres contain two distinct Myb-related proteins, TRF1 and TRF2. Nat. Genet . 17 : 231—235. PMID 9326950 DOI :10.1038/ng1097-231
van Steensel B., Smogorzewska A., de Lange T. (1998). TRF2 protects human telomeres from end-to-end fusions. Cell . 92 : 401—413. PMID 9476899 DOI :10.1016/S0092-8674(00)80932-0
Zhu X.-D., Kuester B., Mann M., Petrini J.H.J., de Lange T. (2000). Cell-cycle-regulated association of RAD50/MRE11/NBS1 with TRF2 and human telomeres. Nat. Genet . 25 : 347—352. PMID 10888888 DOI :10.1038/77139
Liu D., O'Connor M.S., Qin J., Songyang Z. (2004). Telosome, a mammalian telomere-associated complex formed by multiple telomeric proteins. J. Biol. Chem . 279 : 51338—51342. PMID 15383534 DOI :10.1074/jbc.M409293200
de Lange T. (2005). Shelterin: the protein complex that shapes and safeguards human telomeres. Genes Dev . 19 : 2100—2110. PMID 16166375 DOI :10.1101/gad.1346005
Примітки
Див. також