SPON1

SPON1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2ZOT, 2ZOU, 3COO, 3Q13
Ідентифікатори
Символи	SPON1, VSGP/F-spondin, f-spondin, Spondin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604989 MGI: 2385287 HomoloGene: 4453 GeneCards: SPON1
Пов'язані генетичні захворювання
туберкульоз[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • extracellular matrix structural constituent • LBD domain binding Клітинна компонента • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular region • endoplasmic reticulum lumen • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • адгезія клітин • protein O-linked fucosylation • positive regulation of protein processing • positive regulation of protein binding • negative regulation of amyloid-beta formation • positive regulation of amyloid precursor protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10418	233744
Ensembl	ENSG00000262655	ENSMUSG00000038156
UniProt	Q9HCB6	Q8VCC9
RefSeq (мРНК)	NM_006108	NM_145584
RefSeq (білок)	NP_006099	NP_663559
Локус (UCSC)	Хр. 11: 13.96 – 14.27 Mb	Хр. 7: 113.37 – 113.64 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SPON1 (англ. Spondin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 807 амінокислот, а молекулярна маса — 90 973[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRLSPAPLKL		SRTPALLALA		LPLAAALAFS		DETLDKVPKS		EGYCSRILRA
QGTRREGYTE		FSLRVEGDPD		FYKPGTSYRV		TLSAAPPSYF		RGFTLIALRE
NREGDKEEDH		AGTFQIIDEE		ETQFMSNCPV		AVTESTPRRR		TRIQVFWIAP
PAGTGCVILK		ASIVQKRIIY		FQDEGSLTKK		LCEQDSTFDG		VTDKPILDCC
ACGTAKYRLT		FYGNWSEKTH		PKDYPRRANH		WSAIIGGSHS		KNYVLWEYGG
YASEGVKQVA		ELGSPVKMEE		EIRQQSDEVL		TVIKAKAQWP		AWQPLNVRAA
PSAEFSVDRT		RHLMSFLTMM		GPSPDWNVGL		SAEDLCTKEC		GWVQKVVQDL
IPWDAGTDSG		VTYESPNKPT		IPQEKIRPLT		SLDHPQSPFY		DPEGGSITQV
ARVVIERIAR		KGEQCNIVPD		NVDDIVADLA		PEEKDEDDTP		ETCIYSNWSP
WSACSSSTCD		KGKRMRQRML		KAQLDLSVPC		PDTQDFQPCM		GPGCSDEDGS
TCTMSEWITW		SPCSISCGMG		MRSRERYVKQ		FPEDGSVCTL		PTEETEKCTV
NEECSPSSCL		MTEWGEWDEC		SATCGMGMKK		RHRMIKMNPA		DGSMCKAETS
QAEKCMMPEC		HTIPCLLSPW		SEWSDCSVTC		GKGMRTRQRM		LKSLAELGDC
NEDLEQVEKC		MLPECPIDCE		LTEWSQWSEC		NKSCGKGHVI		RTRMIQMEPQ
FGGAPCPETV		QRKKCRIRKC		LRNPSIQKLR		WREARESRRS		EQLKEESEGE
QFPGCRMRPW		TAWSECTKLC		GGGIQERYMT		VKKRFKSSQF		TSCKDKKEIR
ACNVHPC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tan K., Duquette M., Liu J.H., Lawler J., Wang J.H. (2008). The crystal structure of the heparin-binding reelin-N domain of f-spondin. J. Mol. Biol. 381: 1213—1223. PMID 18602404 DOI:10.1016/j.jmb.2008.06.045
• Tan K., Lawler J. (2011). The structure of the Ca+-binding, glycosylated F-spondin domain of F-spondin - A C2-domain variant in an extracellular matrix protein. BMC Struct. Biol. 11: 22—22. PMID 21569239 DOI:10.1186/1472-6807-11-22

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з SPON1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11252 (англ.) . Архів оригіналу за 6 травня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2017-05-06 у Wayback Machine.]
5. UniProt, Q9HCB6 (англ.) . Архів оригіналу за 24 лютого 2018. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 11

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»