SPEN (англ. Spen family transcriptional repressor ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 664 амінокислот , а молекулярна маса — 402 248[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MVRETRHLWV GNLPENVREE KIIEHFKRYG RVESVKILPK RGSEGGVAAF
VDFVDIKSAQ KAHNSVNKMG DRDLRTDYNE PGTIPSAARG LDDTVSIASR
SREVSGFRGG GGGPAYGPPP SLHAREGRYE RRLDGASDNR ERAYEHSAYG
HHERGTGGFD RTRHYDQDYY RDPRERTLQH GLYYASRSRS PNRFDAHDPR
YEPRAREQFT LPSVVHRDIY RDDITREVRG RRPERNYQHS RSRSPHSSQS
RNQSPQRLAS QASRPTRSPS GSGSRSRSSS SDSISSSSST SSDSSDSSSS
SSDDSPARSV QSAAVPAPTS QLLSSLEKDE PRKSFGIKVQ NLPVRSTDTS
LKDGLFHEFK KFGKVTSVQI HGTSEERYGL VFFRQQEDQE KALTASKGKL
FFGMQIEVTA WIGPETESEN EFRPLDERID EFHPKATRTL FIGNLEKTTT
YHDLRNIFQR FGEIVDIDIK KVNGVPQYAF LQYCDIASVC KAIKKMDGEY
LGNNRLKLGF GKSMPTNCVW LDGLSSNVSD QYLTRHFCRY GPVVKVVFDR
LKGMALVLYN EIEYAQAAVK ETKGRKIGGN KIKVDFANRE SQLAFYHCME
KSGQDIRDFY EMLAERREER RASYDYNQDR TYYESVRTPG TYPEDSRRDY
PARGREFYSE WETYQGDYYE SRYYDDPREY RDYRNDPYEQ DIREYSYRQR
ERERERERFE SDRDRDHERR PIERSQSPVH LRRPQSPGAS PSQAERLPSD
SERRLYSRSS DRSGSCSSLS PPRYEKLDKS RLERYTKNEK TDKERTFDPE
RVERERRLIR KEKVEKDKTD KQKRKGKVHS PSSQSSETDQ ENEREQSPEK
PRSCNKLSRE KADKEGIAKN RLELMPCVVL TRVKEKEGKV IDHTPVEKLK
AKLDNDTVKS SALDQKLQVS QTEPAKSDLS KLESVRMKVP KEKGLSSHVE
VVEKEGRLKA RKHLKPEQPA DGVSAVDLEK LEARKRRFAD SNLKAEKQKP
EVKKSSPEME DARVLSKKQP DVSSREVILL REGEAERKPV RKEILKRESK
KIKLDRLNTV ASPKDCQELA SISVGSGSRP SSDLQARLGE LAGESVENQE
VQSKKPIPSK PQLKQLQVLD DQGPEREDVR KNYCSLRDET PERKSGQEKS
HSVNTEEKIG IDIDHTQSYR KQMEQSRRKQ QMEMEIAKSE KFGSPKKDVD
EYERRSLVHE VGKPPQDVTD DSPPSKKKRM DHVDFDICTK RERNYRSSRQ
ISEDSERTGG SPSVRHGSFH EDEDPIGSPR LLSVKGSPKV DEKVLPYSNI
TVREESLKFN PYDSSRREQM ADMAKIKLSV LNSEDELNRW DSQMKQDAGR
FDVSFPNSII KRDSLRKRSV RDLEPGEVPS DSDEDGEHKS HSPRASALYE
SSRLSFLLRD REDKLRERDE RLSSSLERNK FYSFALDKTI TPDTKALLER
AKSLSSSREE NWSFLDWDSR FANFRNNKDK EKVDSAPRPI PSWYMKKKKI
RTDSEGKMDD KKEDHKEEEQ ERQELFASRF LHSSIFEQDS KRLQHLERKE
EDSDFISGRI YGKQTSEGAN STTDSIQEPV VLFHSRFMEL TRMQQKEKEK
DQKPKEVEKQ EDTENHPKTP ESAPENKDSE LKTPPSVGPP SVTVVTLESA
PSALEKTTGD KTVEAPLVTE EKTVEPATVS EEAKPASEPA PAPVEQLEQV
DLPPGADPDK EAAMMPAGVE EGSSGDQPPY LDAKPPTPGA SFSQAESNVD
PEPDSTQPLS KPAQKSEEAN EPKAEKPDAT ADAEPDANQK AEAAPESQPP
ASEDLEVDPP VAAKDKKPNK SKRSKTPVQA AAVSIVEKPV TRKSERIDRE
KLKRSNSPRG EAQKLLELKM EAEKITRTAS KNSAADLEHP EPSLPLSRTR
RRNVRSVYAT MGDHENRSPV KEPVEQPRVT RKRLERELQE AAAVPTTPRR
GRPPKTRRRA DEEEENEAKE PAETLKPPEG WRSPRSQKTA AGGGPQGKKG
KNEPKVDATR PEATTEVGPQ IGVKESSMEP KAAEEEAGSE QKRDRKDAGT
DKNPPETAPV EVVEKKPAPE KNSKSKRGRS RNSRLAVDKS ASLKNVDAAV
SPRGAAAQAG ERESGVVAVS PEKSESPQKE DGLSSQLKSD PVDPDKEPEK
EDVSASGPSP EATQLAKQME LEQAVEHIAK LAEASASAAY KADAPEGLAP
EDRDKPAHQA SETELAAAIG SIINDISGEP ENFPAPPPYP GESQTDLQPP
AGAQALQPSE EGMETDEAVS GILETEAATE SSRPPVNAPD PSAGPTDTKE
ARGNSSETSH SVPEAKGSKE VEVTLVRKDK GRQKTTRSRR KRNTNKKVVA
PVESHVPESN QAQGESPAAN EGTTVQHPEA PQEEKQSEKP HSTPPQSCTS
DLSKIPSTEN SSQEISVEER TPTKASVPPD LPPPPQPAPV DEEPQARFRV
HSIIESDPVT PPSDPSIPIP TLPSVTAAKL SPPVASGGIP HQSPPTKVTE
WITRQEEPRA QSTPSPALPP DTKASDVDTS SSTLRKILMD PKYVSATSVT
STSVTTAIAE PVSAAPCLHE APPPPVDSKK PLEEKTAPPV TNNSEIQASE
VLVAADKEKV APVIAPKITS VISRMPVSID LENSQKITLA KPAPQTLTGL
VSALTGLVNV SLVPVNALKG PVKGSVTTLK SLVSTPAGPV NVLKGPVNVL
TGPVNVLTTP VNATVGTVNA APGTVNAAAS AVNATASAVT VTAGAVTAAS
GGVTATTGTV TMAGAVIAPS TKCKQRASAN ENSRFHPGSM PVIDDRPADA
GSGAGLRVNT SEGVVLLSYS GQKTEGPQRI SAKISQIPPA SAMDIEFQQS
VSKSQVKPDS VTASQPPSKG PQAPAGYANV ATHSTLVLTA QTYNASPVIS
SVKADRPSLE KPEPIHLSVS TPVTQGGTVK VLTQGINTPP VLVHNQLVLT
PSIVTTNKKL ADPVTLKIET KVLQPANLGS TLTPHHPPAL PSKLPTEVNH
VPSGPSIPAD RTVSHLAAAK LDAHSPRPSG PGPSSFPRAS HPSSTASTAL
STNATVMLAA GIPVPQFISS IHPEQSVIMP PHSITQTVSL SHLSQGEVRM
NTPTLPSITY SIRPEALHSP RAPLQPQQIE VRAPQRASTP QPAPAGVPAL
ASQHPPEEEV HYHLPVARAT APVQSEVLVM QSEYRLHPYT VPRDVRIMVH
PHVTAVSEQP RAADGVVKVP PASKAPQQPG KEAAKTPDAK AAPTPTPAPV
PVPVPLPAPA PAPHGEARIL TVTPSNQLQG LPLTPPVVVT HGVQIVHSSG
ELFQEYRYGD IRTYHPPAQL THTQFPAASS VGLPSRTKTA AQGPPPEGEP
LQPPQPVQST QPAQPAPPCP PSQLGQPGQP PSSKMPQVSQ EAKGTQTGVE
QPRLPAGPAN RPPEPHTQVQ RAQAETGPTS FPSPVSVSMK PDLPVSLPTQ
TAPKQPLFVP TTSGPSTPPG LVLPHTEFQP APKQDSSPHL TSQRPVDMVQ
LLKKYPIVWQ GLLALKNDTA AVQLHFVSGN NVLAHRSLPL SEGGPPLRIA
QRMRLEATQL EGVARRMTVE TDYCLLLALP CGRDQEDVVS QTESLKAAFI
TYLQAKQAAG IINVPNPGSN QPAYVLQIFP PCEFSESHLS RLAPDLLASI
SNISPHLMIV IASV
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус , транскрипція , регуляція транскрипції , поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК , РНК .
Локалізований у ядрі .
Література
Shi Y., Hon M., Evans R.M. (2002). The peroxisome proliferator-activated receptor delta, an integrator of transcriptional repression and nuclear receptor signaling. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A . 99 : 2613—2618. PMID 11867749 DOI :10.1073/pnas.052707099
Ariyoshi M., Schwabe J.W.R. (2003). A conserved structural motif reveals the essential transcriptional repression function of Spen proteins and their role in developmental signaling. Genes Dev . 17 : 1909—1920. PMID 12897056 DOI :10.1101/gad.266203
Примітки
Див. також