PRKRA

PRKRA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DIX
Ідентифікатори
Символи	PRKRA, DYT16, PACT, RAX, HSD14, protein activator of interferon induced protein kinase EIF2AK2
Зовнішні ІД	OMIM: 603424 MGI: 1344375 HomoloGene: 2738 GeneCards: PRKRA
Пов'язані генетичні захворювання
dystonia 16[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • enzyme binding • double-stranded RNA binding • GO:0010577 enzyme activator activity • RNA binding • pre-miRNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • внутрішньоклітинний • нуклеоплазма • perinuclear region of cytoplasm • гіалоплазма • RISC-loading complex Біологічний процес • skeletal system morphogenesis • response to virus • outer ear morphogenesis • pre-miRNA processing • protein phosphorylation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • middle ear morphogenesis • cellular response to oxidative stress • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway • negative regulation of cell population proliferation • production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity • protein stabilization • GO:0061715 miRNA metabolic process • GO:0070919 production of siRNA involved in RNA interference • Сайленсинг генів • GO:0022415 viral process • ear development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8575	23992
Ensembl	ENSG00000180228	ENSMUSG00000002731
UniProt	O75569	Q9WTX2
RefSeq (мРНК)	NM_001139517 NM_001139518 NM_001316362 NM_003690	NM_011871
RefSeq (білок)	NP_001132989 NP_001132990 NP_001303291 NP_003681	NP_036001
Локус (UCSC)	Хр. 2: 178.43 – 178.45 Mb	Хр. 2: 76.46 – 76.48 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PRKRA (англ. Protein activator of interferon induced protein kinase EIF2AK2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 313 амінокислот, а молекулярна маса — 34 404[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSQSRHRAEA		PPLEREDSGT		FSLGKMITAK		PGKTPIQVLH		EYGMKTKNIP
VYECERSDVQ		IHVPTFTFRV		TVGDITCTGE		GTSKKLAKHR		AAEAAINILK
ANASICFAVP		DPLMPDPSKQ		PKNQLNPIGS		LQELAIHHGW		RLPEYTLSQE
GGPAHKREYT		TICRLESFME		TGKGASKKQA		KRNAAEKFLA		KFSNISPENH
ISLTNVVGHS		LGCTWHSLRN		SPGEKINLLK		RSLLSIPNTD		YIQLLSEIAK
EQGFNITYLD		IDELSANGQY		QCLAELSTSP		ITVCHGSGIS		CGNAQSDAAH
NALQYLKIIA		ERK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Patel R.C., Sen G.C. (1998). PACT, a protein activator of the interferon-induced protein kinase, PKR. EMBO J. 17: 4379—4390. PMID 9687506 DOI:10.1093/emboj/17.15.4379
• Ito T., Yang M., May W.S. (1999). RAX, a cellular activator for double-stranded RNA-dependent protein kinase during stress signaling. J. Biol. Chem. 274: 15427—15432. PMID 10336432 DOI:10.1074/jbc.274.22.15427
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Peters G.A., Hartmann R., Qin J., Sen G.C. (2001). Modular structure of PACT: distinct domains for binding and activating PKR. Mol. Cell. Biol. 21: 1908—1920. PMID 11238927 DOI:10.1128/MCB.21.6.1908-1920.2001
• Peters G.A., Li S., Sen G.C. (2006). Phosphorylation of specific serine residues in the PKR activation domain of PACT is essential for its ability to mediate apoptosis. J. Biol. Chem. 281: 35129—35136. PMID 16982605 DOI:10.1074/jbc.M607714200
• Kok K.H., Ng M.-H., Ching Y.-P., Jin D.-Y. (2007). Human TRBP and PACT directly interact with each other and associate with dicer to facilitate the production of small interfering RNA. J. Biol. Chem. 282: 17649—17657. PMID 17452327 DOI:10.1074/jbc.M611768200

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з PRKRA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9438 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
5. UniProt, O75569 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 2

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»