uk PCSK9

PCSK9
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2P4E, 2PMW, 2QTW, 2W2M, 2W2N, 2W2O, 2W2P, 2W2Q, 2XTJ, 3BPS, 3GCW, 3GCX, 3H42, 3M0C, 3P5B, 3P5C, 3SQO, 4K8R, 4NE9, 4NMX, 4OV6
Ідентифікатори
Символи	PCSK9, proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, FH3, HCHOLA3, LDLCQ1, NARC-1, NARC1, PC9, FHCL3
Зовнішні ІД	OMIM: 607786 MGI: 2140260 HomoloGene: 17790 GeneCards: PCSK9
Пов'язані генетичні захворювання
	hypercholesterolemia, autosomal dominant, 3, сімейна гіперхолестеринемія
Реагує на сполуку
	evolocumab, Bococizumab
Онтологія гена
Молекулярна функція	• apolipoprotein binding; • apolipoprotein receptor binding; • very-low-density lipoprotein particle binding; • low-density lipoprotein particle binding; • protein self-association; • sodium channel inhibitor activity; • low-density lipoprotein particle receptor binding; • very-low-density lipoprotein particle receptor binding; • GO:0070122 peptidase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • serine-type peptidase activity; • signaling receptor inhibitor activity; • serine-type endopeptidase activity; • hydrolase activity; • RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ендосома; • late endosome; • rough endoplasmic reticulum; • комплекс Ґольджі; • клітинна мембрана; • PCSK9-AnxA2 complex; • cell surface; • early endosome; • extrinsic component of external side of plasma membrane; • ендоплазматичний ретикулум; • perinuclear region of cytoplasm; • COPII-coated ER to Golgi transport vesicle; • лізосома; • PCSK9-LDLR complex; • extracellular region; • міжклітинний простір; • lysosomal membrane; • endolysosome membrane; • endoplasmic reticulum lumen;
Біологічний процес	• lipoprotein metabolic process; • Нейрогенез; • steroid metabolic process; • розвиток нирки; • positive regulation of receptor internalization; • lipid metabolism; • negative regulation of low-density lipoprotein particle clearance; • negative regulation of sodium ion transmembrane transporter activity; • regulation of low-density lipoprotein particle receptor catabolic process; • cellular response to starvation; • regulation of neuron apoptotic process; • protein processing; • regulation of signaling receptor activity; • cholesterol metabolic process; • protein autoprocessing; • протеоліз; • positive regulation of neuron apoptotic process; • positive regulation of low-density lipoprotein particle receptor catabolic process; • low-density lipoprotein receptor particle metabolic process; • neuron differentiation; • cellular response to insulin stimulus; • lysosomal transport; • phospholipid metabolic process; • liver development; • cholesterol homeostasis; • triglyceride metabolic process; • negative regulation of receptor recycling; • GO:0097285 апоптоз; • negative regulation of low-density lipoprotein particle receptor binding; • negative regulation of low-density lipoprotein receptor activity; • negative regulation of receptor-mediated endocytosis involved in cholesterol transport; • low-density lipoprotein particle receptor catabolic process; • low-density lipoprotein particle clearance; • посттрансляційна модифікація; • negative regulation of signaling receptor activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	255738
	100102
	ENSG00000169174
	ENSMUSG00000044254
	Q8NBP7
	Q80W65
	NM_174936
	NM_153565
	NP_777596
	NP_705793
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PCSK9 (англ. Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 692 амінокислот, а молекулярна маса — 74 286^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGTVSSRRSW	WPLPLLLLLL	LLLGPAGARA	QEDEDGDYEE	LVLALRSEED
GLAEAPEHGT	TATFHRCAKD	PWRLPGTYVV	VLKEETHLSQ	SERTARRLQA
QAARRGYLTK	ILHVFHGLLP	GFLVKMSGDL	LELALKLPHV	DYIEEDSSVF
AQSIPWNLER	ITPPRYRADE	YQPPDGGSLV	EVYLLDTSIQ	SDHREIEGRV
MVTDFENVPE	EDGTRFHRQA	SKCDSHGTHL	AGVVSGRDAG	VAKGASMRSL
RVLNCQGKGT	VSGTLIGLEF	IRKSQLVQPV	GPLVVLLPLA	GGYSRVLNAA
CQRLARAGVV	LVTAAGNFRD	DACLYSPASA	PEVITVGATN	AQDQPVTLGT
LGTNFGRCVD	LFAPGEDIIG	ASSDCSTCFV	SQSGTSQAAA	HVAGIAAMML
SAEPELTLAE	LRQRLIHFSA	KDVINEAWFP	EDQRVLTPNL	VAALPPSTHG
AGWQLFCRTV	WSAHSGPTRM	ATAVARCAPD	EELLSCSSFS	RSGKRRGERM
EAQGGKLVCR	AHNAFGGEGV	YAIARCCLLP	QANCSVHTAP	PAEASMGTRV
HCHQQGHVLT	GCSSHWEVED	LGTHKPPVLR	PRGQPNQCVG	HREASIHASC
CHAPGLECKV	KEHGIPAPQE	QVTVACEEGW	TLTGCSALPG	TSHVLGAYAV
DNTCVVRSRD	VSTTGSTSEG	AVTAVAICCR	SRHLAQASQE	LQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, метаболізм ліпідів, метаболізм холестеролу, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах. Також секретований назовні.

Література

Ding K., McDonough S.J., Kullo I.J. (2007). Evidence for positive selection in the C-terminal domain of the cholesterol metabolism gene PCSK9 based on phylogenetic analysis in 14 primate species. PLoS ONE. 2: E1098—E1098. PMID 17971861 DOI:10.1371/journal.pone.0001098
Benjannet S., Rhainds D., Hamelin J., Nassoury N., Seidah N.G. (2006). The proprotein convertase (PC) PCSK9 is inactivated by furin and/or PC5/6A: functional consequences of natural mutations and post-translational modifications. J. Biol. Chem. 281: 30561—30572. PMID 16912035 DOI:10.1074/jbc.M606495200
Jonas M.C., Costantini C., Puglielli L. (2008). PCSK9 is required for the disposal of non-acetylated intermediates of the nascent membrane protein BACE1. EMBO Rep. 9: 916—922. PMID 18660751 DOI:10.1038/embor.2008.132
Mayer G., Poirier S., Seidah N.G. (2008). Annexin A2 is a C-terminal PCSK9-binding protein that regulates endogenous low density lipoprotein receptor levels. J. Biol. Chem. 283: 31791—31801. PMID 18799458 DOI:10.1074/jbc.M805971200
Yamamoto T., Lu C., Ryan R.O. (2011). A two-step binding model of PCSK9 interaction with the low density lipoprotein receptor. J. Biol. Chem. 286: 5464—5470. PMID 21149300 DOI:10.1074/jbc.M110.199042
Lopez D. (2008). PCSK9: an enigmatic protease. Biochim. Biophys. Acta. 1781: 184—191. PMID 18280815 DOI:10.1016/j.bbalip.2008.01.003