Muscle Museum EP — другий мініальбом англійського альтернативного рок-гурту Muse. Обмежений наклад з 999 пронумерованих вручну копій було видано 11 січня 1999 звукозаписним лейблом «Dangerous Records». Пронумеровані диски були продані в місцевих магазинах і на концертах. Ненумеровані примірники було передано на радіостанції та журналістам[1].
Деякі CD-R були зроблені на студії звукозапису Sawmill до виходу мініальбому. Промо CD-R з кольоровою коробкою для диска також були зроблені в Motor в Німеччині, хоча сам мініальбом там не було видано[2]. Чотири з п'яти оригінальних пісень — «Muscle Museum», «Sober», «Uno» і «Unintended» — були перезаписані для дебютного повноформатного альбому Showbiz. «Instant Messenger» перевидано як бі-сайд до альбому під назвою Pink Ego Box.
Метью Белламі передав копію міні-альбому до приймальні студії BBC Radio 1, попрохавши віддати його DJСтіву Лемакку. Коли Белламі й Кріс почули, як Лемакк грає його кілька місяців по тому, це стало для них сюрпризом. Після виходу в ефір на шоу Лемакка, всі диски в магазинах були продані, а заголовний трек Muscle Museum увійшов до інді-чарту NME на 3-ю позицію, поступившись першим місцем тільки Mercury Rev і Фетбою Сліму[3][4].