KPNA2

KPNA2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1EFX, 1QGK, 1QGR, 3FEX, 3FEY, 3WPT, 4E4V, 4WV6
Ідентифікатори
Символи	KPNA2, IPOA1, QIP2, RCH1, SRP1alpha, Karyopherin alpha 2, SRP1-alpha, karyopherin subunit alpha 2, PTAC58
Зовнішні ІД	OMIM: 600685 MGI: 103561 HomoloGene: 1708 GeneCards: KPNA2
Онтологія гена Молекулярна функція • histone deacetylase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclear localization sequence binding • RNA binding • nuclear import signal receptor activity Клітинна компонента • мембрана • ядерна пора • нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • host cell • extrinsic component of postsynaptic specialization membrane • glutamatergic synapse Біологічний процес • regulation of DNA recombination • protein import into nucleus • DNA metabolic process • protein transport • GO:0022415 viral process • NLS-bearing protein import into nucleus • modulation by virus of host cellular process • GO:0046795 intracellular transport of virus • GO:0015915 транспорт • postsynapse to nucleus signaling pathway • entry of viral genome into host nucleus through nuclear pore complex via importin • positive regulation of viral life cycle Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3838	16647
Ensembl	ENSG00000182481	ENSMUSG00000018362
UniProt	P52292	P52293
RefSeq (мРНК)	NM_002266 NM_001320611	NM_010655
RefSeq (білок)	NP_001307540 NP_002257	NP_034785
Локус (UCSC)	Хр. 17: 68.04 – 68.05 Mb	Хр. 11: 106.88 – 106.89 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

KPNA2 (англ. Karyopherin subunit alpha 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 529 амінокислот, а молекулярна маса — 57 862[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSTNENANTP		AARLHRFKNK		GKDSTEMRRR		RIEVNVELRK		AKKDDQMLKR
RNVSSFPDDA		TSPLQENRNN		QGTVNWSVDD		IVKGINSSNV		ENQLQATQAA
RKLLSREKQP		PIDNIIRAGL		IPKFVSFLGR		TDCSPIQFES		AWALTNIASG
TSEQTKAVVD		GGAIPAFISL		LASPHAHISE		QAVWALGNIA		GDGSVFRDLV
IKYGAVDPLL		ALLAVPDMSS		LACGYLRNLT		WTLSNLCRNK		NPAPPIDAVE
QILPTLVRLL		HHDDPEVLAD		TCWAISYLTD		GPNERIGMVV		KTGVVPQLVK
LLGASELPIV		TPALRAIGNI		VTGTDEQTQV		VIDAGALAVF		PSLLTNPKTN
IQKEATWTMS		NITAGRQDQI		QQVVNHGLVP		FLVSVLSKAD		FKTQKEAVWA
VTNYTSGGTV		EQIVYLVHCG		IIEPLMNLLT		AKDTKIILVI		LDAISNIFQA
AEKLGETEKL		SIMIEECGGL		DKIEALQNHE		NESVYKASLS		LIEKYFSVEE
EEDQNVVPET		TSEGYTFQVQ		DGAPGTFNF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Weis K., Mattaj I.W., Lamond A.I. (1995). Identification of hSRP1 alpha as a functional receptor for nuclear localization sequences. Science. 268: 1049—1053. PMID 7754385 DOI:10.1126/science.7754385
• Doerr S., Schlicker M., Hansmann I. (2001). Genomic structure of karyopherin alpha2 (KPNA2) within a low-copy repeat on chromosome 17q23-q24 and mutation analysis in patients with Russell-Silver syndrome. Hum. Genet. 109: 479—486. PMID 11735022 DOI:10.1007/s004390100605
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cuomo C.A., Kirch S.A., Gyuris J., Brent R., Oettinger M.A. (1994). Rch1, a protein that specifically interacts with the RAG-1 recombination-activating protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 6156—6160. PMID 8016130 DOI:10.1073/pnas.91.13.6156
• Moroianu J., Hijikata M., Blobel G., Radu A. (1995). Mammalian karyopherin alpha 1 beta and alpha 2 beta heterodimers: alpha 1 or alpha 2 subunit binds nuclear localization signal and beta subunit interacts with peptide repeat-containing nucleoporins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 6532—6536. PMID 7604027 DOI:10.1073/pnas.92.14.6532
• Kutay U., Bischoff F.R., Kostka S., Kraft R., Goerlich D. (1997). Export of importin-alpha from the nucleus is mediated by a specific nuclear transport factor. Cell. 90: 1061—1071. PMID 9323134 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80372-4

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6395 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-15 у Wayback Machine.]
4. UniProt, P52292 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 17

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»