KAT6B
Ідентифікатори
Символи
KAT6B , GTPTS, MORF, MOZ2, MYST4, ZC2HC6B, qkf, querkopf, lysine acetyltransferase 6B
Зовнішні ІД
OMIM : 605880 HomoloGene: 49310 GeneCards: KAT6B
Пов'язані генетичні захворювання
Young-Simpson syndrome , Genitopatellar syndrome [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• transferase activity • DNA binding • transcription factor binding • зв'язування з іоном металу • histone acetyltransferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • acetyltransferase activity • acyltransferase activity • GO:0032403 protein-containing complex binding • H4 histone acetyltransferase activity • GO:0031493 histone binding
Клітинна компонента
• нуклеоплазма • Нуклеосома • MOZ/MORF histone acetyltransferase complex • клітинне ядро • histone acetyltransferase complex
Біологічний процес
• nucleosome assembly • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • histone acetylation • histone H3 acetylation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to leukemia inhibitory factor • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • histone H4 acetylation
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 10: 74.82 – 75.03 Mb
н/д
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
KAT6B (англ. Lysine acetyltransferase 6B ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 073 амінокислот , а молекулярна маса — 231 378[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MVKLANPLYT EWILEAIQKI KKQKQRPSEE RICHAVSTSH GLDKKTVSEQ
LELSVQDGSV LKVTNKGLAS YKDPDNPGRF SSVKPGTFPK SAKGSRGSCN
DLRNVDWNKL LRRAIEGLEE PNGSSLKNIE KYLRSQSDLT STTNNPAFQQ
RLRLGAKRAV NNGRLLKDGP QYRVNYGSLD GKGAPQYPSA FPSSLPPVSL
LPHEKDQPRA DPIPICSFCL GTKESNREKK PEELLSCADC GSSGHPSCLK
FCPELTTNVK ALRWQCIECK TCSACRVQGR NADNMLFCDS CDRGFHMECC
DPPLSRMPKG MWICQVCRPK KKGRKLLHEK AAQIKRRYAK PIGRPKNKLK
QRLLSVTSDE GSMNAFTGRG SPGRGQKTKV CTTPSSGHAA SGKDSSSRLA
VTDPTRPGAT TKITTTSTYI SASTLKVNKK TKGLIDGLTK FFTPSPDGRR
SRGEIIDFSK HYRPRKKVSQ KQSCTSHVLA TGTTQKLKPP PSSLPPPTPI
SGQSPSSQKS STATSSPSPQ SSSSQCSVPS LSSLTTNSQL KALFDGLSHI
YTTQGQSRKK GHPSYAPPKR MRRKTELSST AKSKAHFFGK RDIRSRFISH
SSSSSWGMAR GSIFKAIAHF KRTTFLKKHR MLGRLKYKVT PQMGTPSPGK
GSLTDGRIKP DQDDDTEIKI NIKQESADVN VIGNKDVVTE EDLDVFKQAQ
ELSWEKIECE SGVEDCGRYP SVIEFGKYEI QTWYSSPYPQ EYARLPKLYL
CEFCLKYMKS KNILLRHSKK CGWFHPPANE IYRRKDLSVF EVDGNMSKIY
CQNLCLLAKL FLDHKTLYYD VEPFLFYVLT KNDEKGCHLV GYFSKEKLCQ
QKYNVSCIMI MPQHQRQGFG RFLIDFSYLL SRREGQAGSP EKPLSDLGRL
SYLAYWKSVI LEYLYHHHER HISIKAISRA TGMCPHDIAT TLQHLHMIDK
RDGRFVIIRR EKLILSHMEK LKTCSRANEL DPDSLRWTPI LISNAAVSEE
EREAEKEAER LMEQASCWEK EEQEILSTRA NSRQSPAKVQ SKNKYLHSPE
SRPVTGERGQ LLELSKESSE EEEEEEDEEE EEEEEEEEED EEEEEEEEEE
EEEENIQSSP PRLTKPQSVA IKRKRPFVLK KKRGRKRRRI NSSVTTETIS
ETTEVLNEPF DNSDEERPMP QLEPTCEIEV EEDGRKPVLR KAFQHQPGKK
RQTEEEEGKD NHCFKNADPC RNNMNDDSSN LKEGSKDNPE PLKCKQVWPK
GTKRGLSKWR QNKERKTGFK LNLYTPPETP MEPDEQVTVE EQKETSEGKT
SPSPIRIEEE VKETGEALLP QEENRREETC APVSPNTSPG EKPEDDLIKP
EEEEEEEEEE EEEEEEEEGE EEEGGGNVEK DPDGAKSQEK EEPEISTEKE
DSARLDDHEE EEEEDEEPSH NEDHDADDED DSHMESAEVE KEELPRESFK
EVLENQETFL DLNVQPGHSN PEVLMDCGVD LTASCNSEPK ELAGDPEAVP
ESDEEPPPGE QAQKQDQKNS KEVDTEFKEG NPATMEIDSE TVQAVQSLTQ
ESSEQDDTFQ DCAETQEACR SLQNYTRADQ SPQIATTLDD CQQSDHSSPV
SSVHSHPGQS VRSVNSPSVP ALENSYAQIS PDQSAISVPS LQNMETSPMM
DVPSVSDHSQ QVVDSGFSDL GSIESTTENY ENPSSYDSTM GGSICGNGSS
QNSCSYSNLT SSSLTQSSCA VTQQMSNISG SCSMLQQTSI SSPPTCSVKS
PQGCVVERPP SSSQQLAQCS MAANFTPPMQ LAEIPETSNA NIGLYERMGQ
SDFGAGHYPQ PSATFSLAKL QQLTNTLIDH SLPYSHSAAV TSYANSASLS
TPLSNTGLVQ LSQSPHSVPG GPQAQATMTP PPNLTPPPMN LPPPLLQRNM
AASNIGISHS QRLQTQIASK GHISMRTKSA SLSPAAATHQ SQIYGRSQTV
AMQGPARTLT MQRGMNMSVN LMPAPAYNVN SVNMNMNTLN AMNGYSMSQP
MMNSGYHSNH GYMNQTPQYP MQMQMGMMGT QPYAQQPMQT PPHGNMMYTA
PGHHGYMNTG MSKQSLNGSY MRR
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз , репресорів , активаторів , ацилтрансфераз , регуляторів хроматину , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , ацетилювання, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку .
Локалізований у ядрі .
Література
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Pelletier N., Champagne N., Stifani S., Yang X.-J. (2002). MOZ and MORF histone acetyltransferases interact with the Runt-domain transcription factor Runx2. Oncogene . 21 : 2729—2740. PMID 11965546 DOI :10.1038/sj.onc.1205367
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep . 10 : 1778—1791. PMID 25772364 DOI :10.1016/j.celrep.2015.02.033
Примітки
Див. також