IFIH1

IFIH1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи IFIH1, AGS7, Hlcd, IDDM19, MDA-5, MDA5, RLR-2, SGMRT1, interferon induced with helicase C domain 1, IMD95
Зовнішні ІД OMIM: 606951 MGI: 1918836 HomoloGene: 32535 GeneCards: IFIH1
Пов'язані генетичні захворювання
цукровий діабет 1-го типу, type 1 diabetes mellitus 19, Singleton-Merten syndrome 1, Singleton Merten syndrome, Aicardi-Goutieres syndrome[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_022168
NM_001164477
NM_027835
RefSeq (білок)
NP_071451
NP_001157949
NP_082111
Локус (UCSC) Хр. 2: 162.27 – 162.32 Mb Хр. 2: 62.43 – 62.48 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

IFIH1 (англ. Interferon induced with helicase C domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 025 амінокислот, а молекулярна маса — 116 689[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSNGYSTDENFRYLISCFRARVKMYIQVEPVLDYLTFLPAEVKEQIQRTV
ATSGNMQAVELLLSTLEKGVWHLGWTREFVEALRRTGSPLAARYMNPELT
DLPSPSFENAHDEYLQLLNLLQPTLVDKLLVRDVLDKCMEEELLTIEDRN
RIAAAENNGNESGVRELLKRIVQKENWFSAFLNVLRQTGNNELVQELTGS
DCSESNAEIENLSQVDGPQVEEQLLSTTVQPNLEKEVWGMENNSSESSFA
DSSVVSESDTSLAEGSVSCLDESLGHNSNMGSDSGTMGSDSDEENVAARA
SPEPELQLRPYQMEVAQPALEGKNIIICLPTGSGKTRVAVYIAKDHLDKK
KKASEPGKVIVLVNKVLLVEQLFRKEFQPFLKKWYRVIGLSGDTQLKISF
PEVVKSCDIIISTAQILENSLLNLENGEDAGVQLSDFSLIIIDECHHTNK
EAVYNNIMRHYLMQKLKNNRLKKENKPVIPLPQILGLTASPGVGGATKQA
KAEEHILKLCANLDAFTIKTVKENLDQLKNQIQEPCKKFAIADATREDPF
KEKLLEIMTRIQTYCQMSPMSDFGTQPYEQWAIQMEKKAAKEGNRKERVC
AEHLRKYNEALQINDTIRMIDAYTHLETFYNEEKDKKFAVIEDDSDEGGD
DEYCDGDEDEDDLKKPLKLDETDRFLMTLFFENNKMLKRLAENPEYENEK
LTKLRNTIMEQYTRTEESARGIIFTKTRQSAYALSQWITENEKFAEVGVK
AHHLIGAGHSSEFKPMTQNEQKEVISKFRTGKINLLIATTVAEEGLDIKE
CNIVIRYGLVTNEIAMVQARGRARADESTYVLVAHSGSGVIEHETVNDFR
EKMMYKAIHCVQNMKPEEYAHKILELQMQSIMEKKMKTKRNIAKHYKNNP
SLITFLCKNCSVLACSGEDIHVIEKMHHVNMTPEFKELYIVRENKALQKK
CADYQINGEIICKCGQAWGTMMVHKGLDLPCLKIRNFVVVFKNNSTKKQY
KKWVELPITFPNLDYSECCLFSDED

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, антивірусний захист, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Bamming D., Horvath C.M. (2009). Regulation of signal transduction by enzymatically inactive antiviral RNA helicase proteins MDA5, RIG-I, and LGP2. J. Biol. Chem. 284: 9700—9712. PMID 19211564 DOI:10.1074/jbc.M807365200
  • Loo Y.M., Gale M. Jr. (2011). Immune signaling by RIG-I-like receptors. Immunity. 34: 680—692. PMID 21616437 DOI:10.1016/j.immuni.2011.05.003
  • Kato H., Takahasi K., Fujita T. (2011). RIG-I-like receptors: cytoplasmic sensors for non-self RNA. Immunol. Rev. 243: 91—98. PMID 21884169 DOI:10.1111/j.1600-065X.2011.01052.x
  • Onoguchi K., Yoneyama M., Fujita T. (2011). Retinoic acid-inducible gene-I-like receptors. J. Interferon Cytokine Res. 31: 27—31. PMID 20950133 DOI:10.1089/jir.2010.0057
  • Miyashita M., Oshiumi H., Matsumoto M., Seya T. (2011). DDX60, a DEXD/H box helicase, is a novel antiviral factor promoting RIG-I-like receptor-mediated signaling. Mol. Cell. Biol. 31: 3802—3819. PMID 21791617 DOI:10.1128/MCB.01368-10

Примітки

Див. також