HLA-DOA

HLA-DOA
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 4I0P
Ідентифікатори
Символи	HLA-DOA, HLA-DNA, HLA-DZA, HLADZ, major histocompatibility complex, class II, DO alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 142930 MGI: 95924 HomoloGene: 1601 GeneCards: HLA-DOA
Пов'язані генетичні захворювання
періодонтит[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • MHC class II receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • MHC class II protein complex binding Клітинна компонента • integral component of membrane • lysosomal membrane • ендосома • клітинна мембрана • лізосома • MHC class II protein complex • endosome membrane • мембрана Біологічний процес • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II • antigen processing and presentation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • negative regulation of antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class II • regulation of T cell differentiation • процес імунної системи • GO:0072468 сигнальна трансдукція • адаптивна імунна відповідь Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3111	15001
Ensembl	ENSG00000204252 ENSG00000230141 ENSG00000232962 ENSG00000235744 ENSG00000231558 ENSG00000206292 ENSG00000232957	ENSMUSG00000024334
UniProt	P06340	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_002119 NM_015851	NM_008206
RefSeq (білок)	NP_002110	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 6: 33 – 33.01 Mb	Хр. 17: 34.31 – 34.31 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HLA-DOA (англ. Major histocompatibility complex, class II, DO alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 250 амінокислот, а молекулярна маса — 27 599[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALRAGLVLG		FHTLMTLLSP		QEAGATKADH		MGSYGPAFYQ		SYGASGQFTH
EFDEEQLFSV		DLKKSEAVWR		LPEFGDFARF		DPQGGLAGIA		AIKAHLDILV
ERSNRSRAIN		VPPRVTVLPK		SRVELGQPNI		LICIVDNIFP		PVINITWLRN
GQTVTEGVAQ		TSFYSQPDHL		FRKFHYLPFV		PSAEDVYDCQ		VEHWGLDAPL
LRHWELQVPI		PPPDAMETLV		CALGLAIGLV		GFLVGTVLII		MGTYVSSVPR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у мембрані, лізосомі, ендосомах.

Література

• Jonsson A.-K., Rask L. (1989). Human class II DNA and DOB genes display low sequence variability. Immunogenetics. 29: 411—413.  PMID 2499532 DOI:10.1007/BF00375872
• Young J.A., Trowsdale J. (1990). The HLA-DNA (DZA) gene is correctly expressed as a 1.1 kb mature mRNA transcript. Immunogenetics. 31: 386—388.  PMID 2370084 DOI:10.1007/BF02115015
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004.  PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Alfonso C., Karlsson L. (2000). Nonclassical MHC class II molecules. Annu. Rev. Immunol. 18: 113—142.  PMID 10837054 DOI:10.1146/annurev.immunol.18.1.113
• Trowsdale J., Kelly A. (1985). The human HLA class II alpha chain gene DZ alpha is distinct from genes in the DP, DQ and DR subregions. EMBO J. 4: 2231—2237.  PMID 3000765

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з HLA-DOA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних. 
2. Human PubMed Reference:. 
3. Mouse PubMed Reference:. 
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4936 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.  [Архівовано 2015-10-17 у Wayback Machine.]
5. UniProt, P06340 (англ.) . Архів оригіналу за 20 грудня 2016. Процитовано 6 вересня 2017. 

Див. також

• Хромосома 6

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»