uk EIF5A

EIF5A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: I3L397 PDBe I3L397 RCSB
Список кодів PDB
	3CPF, 5DLQ
Ідентифікатори
Символи	EIF5A, EIF-5A, EIF5A1, eIF5AI, eukaryotic translation initiation factor 5A, eIF-4D, FABAS
Зовнішні ІД	OMIM: 600187 MGI: 106248 HomoloGene: 133803 GeneCards: EIF5A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein N-terminus binding; • ribosome binding; • translation elongation factor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • U6 snRNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • ядерна пора; • lamellae anulatae; • ендоплазматичний ретикулум; • екзосома; • клітинне ядро; • дендрит (нейробіологія); • soma;
Біологічний процес	• mRNA transport; • Біосинтез білків; • positive regulation of translational elongation; • translational elongation; • mRNA export from nucleus; • peptidyl-lysine modification to peptidyl-hypusine; • nucleocytoplasmic transport; • protein export from nucleus; • positive regulation of cell population proliferation; • protein transport; • translational frameshifting; • positive regulation of translational termination; • GO:0097285 апоптоз; • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration; • GO:0010260 старіння людини; • positive regulation of cardiac muscle cell apoptotic process; • positive regulation of apoptotic process; • negative regulation of apoptotic process; • positive regulation of muscle cell differentiation; • cellular response to thyroid hormone stimulus; • positive regulation of reactive oxygen species metabolic process; • GO:0015915 транспорт;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	1984
	276770
	ENSG00000132507; ENSG00000288145
	ENSMUSG00000078812
	P63241
	P63242
NM_001143760; NM_001143761; NM_001143762; NM_001970; NM_001370420;
	NM_001370421
NM_001166589; NM_001166590; NM_001166591; NM_001166592; NM_001166593;
	NM_001166594; NM_001166595; NM_001166596; NM_181582
NP_001137232; NP_001137233; NP_001137234; NP_001961; NP_001357349;
	NP_001357350
NP_001160061; NP_001160062; NP_001160063; NP_001160064; NP_001160065;
	NP_001160066; NP_001160067; NP_001160068; NP_853613
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EIF5A (англ. Eukaryotic translation initiation factor 5A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 154 амінокислот, а молекулярна маса — 16 832^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADDLDFETG	DAGASATFPM	QCSALRKNGF	VVLKGRPCKI	VEMSTSKTGK
HGHAKVHLVG	IDIFTGKKYE	DICPSTHNMD	VPNIKRNDFQ	LIGIQDGYLS
LLQDSGEVRE	DLRLPEGDLG	KEIEQKYDCG	EEILITVLSA	MTEEAAVAIK
AMAK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до факторів елонгації. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, біосинтез білка, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, комплексі ядерної пори.

Література

Koettnitz K., Kappel B., Baumruker T., Hauber J., Bevec D. (1994). The genomic structure encoding human initiation factor eIF-5A. Gene. 144: 249—252. PMID 7545941 DOI:10.1016/0378-1119(94)90385-9
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lee Y.B., Joe Y.A., Wolff E.C., Dimitriadis E.K., Park M.H. (1999). Complex formation between deoxyhypusine synthase and its protein substrate, the eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF5A) precursor. Biochem. J. 340: 273—281. PMID 10229683 DOI:10.1042/bj3400273
Shi X.-P., Yin K.-C., Zimolo Z.A., Stern A.M., Waxman L. (1996). The subcellular distribution of eukaryotic translation initiation factor, eIF-5A, in cultured cells. Exp. Cell Res. 225: 348—356. PMID 8660923 DOI:10.1006/excr.1996.0185
Xu A., Jao D.L., Chen K.Y. (2004). Identification of mRNA that binds to eukaryotic initiation factor 5A by affinity co-purification and differential display. Biochem. J. 384: 585—590. PMID 15303967 DOI:10.1042/BJ20041232
Clement P.M.J., Johansson H.E., Wolff E.C., Park M.H. (2006). Differential expression of eIF5A-1 and eIF5A-2 in human cancer cells. FEBS J. 273: 1102—1114. PMID 16519677 DOI:10.1111/j.1742-4658.2006.05135.x

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3300 (англ.) . Архів оригіналу за 7 квітня 2016. Процитовано 6 лютого 2017. [Архівовано 2016-04-07 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P63241 (англ.) . Архів оригіналу за 2 лютого 2017. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 17

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3300 (англ.) . Архів оригіналу за 7 квітня 2016. Процитовано 6 лютого 2017. [Архівовано 2016-04-07 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P63241 (англ.) . Архів оригіналу за 2 лютого 2017. Процитовано 6 лютого 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]