AICDA

AICDA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5JJ4
Ідентифікатори
Символи	AICDA, AID, ARP2, CDA2, HEL-S-284, HIGM2, activation-induced cytidine deaminase, activation induced cytidine deaminase
Зовнішні ІД	OMIM: 605257 MGI: 1342279 HomoloGene: 7623 GeneCards: AICDA
Пов'язані генетичні захворювання
hyper-IgM syndrome type 2[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • каталітична активність • hydrolase activity • ubiquitin protein ligase binding • зв'язування з іоном металу • cytidine deaminase activity • identical protein binding • RNA binding Клітинна компонента • Екзосома • клітинне ядро • цитоплазма • P-body • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • somatic hypermutation of immunoglobulin genes • DNA demethylation • mRNA processing • B cell differentiation • somatic diversification of immunoglobulins • negative regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly • cytidine deamination • cellular response to lipopolysaccharide • Перемикання класу імуноглобулінів • defense response to bacterium • regulation of DNA stability • negative regulation of transposition • cytidine to uridine editing • regulation of nuclear cell cycle DNA replication • negative regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate • defense response to virus • DNA cytosine deamination Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57379	11628
Ensembl	ENSG00000111732	ENSMUSG00000040627
UniProt	Q9GZX7	Q9WVE0
RefSeq (мРНК)	NM_020661 NM_001330343	NM_009645
RefSeq (білок)	NP_001317272 NP_065712	NP_033775
Локус (UCSC)	Хр. 12: 8.6 – 8.61 Mb	Хр. 6: 122.53 – 122.54 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

AICDA (англ. Activation induced cytidine deaminase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 198 амінокислот, а молекулярна маса — 23 954[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDSLLMNRRK		FLYQFKNVRW		AKGRRETYLC		YVVKRRDSAT		SFSLDFGYLR
NKNGCHVELL		FLRYISDWDL		DPGRCYRVTW		FTSWSPCYDC		ARHVADFLRG
NPNLSLRIFT		ARLYFCEDRK		AEPEGLRRLH		RAGVQIAIMT		FKDYFYCWNT
FVENHERTFK		AWEGLHENSV		RLSRQLRRIL		LPLYEVDDLR		DAFRTLGL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі як процесінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Muto T., Muramatsu M., Taniwaki M., Kinoshita K., Honjo T. (2000). Isolation, tissue distribution, and chromosomal localization of the human activation-induced cytidine deaminase (hAID) gene. Genomics. 68: 85—88. PMID 10950930 DOI:10.1006/geno.2000.6268
• Martin A., Scharff M.D. (2002). Somatic hypermutation of the AID transgene in B and non-B cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 12304—12308. PMID 12202747 DOI:10.1073/pnas.192442899
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Pasqualucci L., Kitaura Y., Gu H., Dalla-Favera R. (2006). PKA-mediated phosphorylation regulates the function of activation-induced deaminase (AID) in B cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 395—400. PMID 16387847 DOI:10.1073/pnas.0509969103
• Guo J.U., Su Y., Zhong C., Ming G.L., Song H. (2011). Hydroxylation of 5-methylcytosine by TET1 promotes active DNA demethylation in the adult brain. Cell. 145: 423—434. PMID 21496894 DOI:10.1016/j.cell.2011.03.022
• Demorest Z.L., Li M., Harris R.S. (2011). Phosphorylation directly regulates the intrinsic DNA cytidine deaminase activity of activation-induced deaminase and APOBEC3G protein. J. Biol. Chem. 286: 26568—26575. PMID 21659520 DOI:10.1074/jbc.M111.235721

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з AICDA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13203 (англ.) . Архів оригіналу за 4 квітня 2016. Процитовано 21 серпня 2017. [Архівовано 2016-04-04 у Wayback Machine.]
5. UniProt, Q9GZX7 (англ.) . Архів оригіналу за 8 жовтня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 12

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»