5 січня, Ліневич Микола Петрович (1839—1908) — російський державний діяч, військовик українського походження. Генерал-ад'ютант російської армії (з 1905 року). Командувач російськими військами на Далекому Сході під час російсько-японської війни.
11 січня, Томара Лев Павлович (1839 — після 1917) — український державний діяч в Російській імперії. Губернатор Волинської, Смоленської і Київської губерній, сенатор.
27 січня, Чубинський Павло Платонович (1839—1884) — український етнолог, фольклорист, поет, громадський діяч, автор слів Гімну України.
12 лютого, Василенко Віктор Іванович (1839—1914) — український вчений-народознавець, етнограф, статистик, дослідник народних художніх промислів Полтавщини, дійсний член Полтавського сільськогосподарського товариства й Полтавської вченої архівної комісії.
7 вересня, Капніст Петро Олексійович (1839—1904) — російський дипломат, дійсний таємний радник у званні камергера, сенатор.
22 вересня, Устиянович Корнило Миколайович (1839—1903) — український маляр, представник класицизму й академізму в Галичині, письменник і публіцист, народовець.
23 вересня, Димитрій (Ковальницький) (1839—1913) — український релігійний діяч, духовний письменник та церковно-громадський діяч, архієпископ Херсонський та Одеський.
24 вересня, Милорадович Григорій Олександрович (1839—1905) — український громадський діяч, історик і генеалог, генерал-лейтенант Російської імператорської армії.
2 жовтня, Левицький Остап Михайлович (1839—1903) — український педагог, письменник, перекладач, громадсько-культурний діяч.
8 жовтня, Врецьона Григорій Захарович (1839—1902) — педагог і освітній діяч, редактор, видавець педагогічного журналу та автор підручників і популярних видань.
5 листопада, Раєвський Микола Миколайович (1839—1876) — полковник, учасник Середньоазіатських походів і сербсько-турецької війни.
25 листопада, Тілло Олексій Андрійович (1839—1900) — російський географ, картограф і геодезист, генерал-лейтенант, член-кореспондент Петербурзької академії наук.
9 грудня, Закревський Гнат Платонович (1839—1906) — правознавець, дипломат, правник, сенатор Російської імперії.
24 грудня, Клименко Юхим Филимонович (1839—1922) — український хімік. Здійснив перші в Російській імперії експериментальні праці з стереохімії, вивчав також органічні оксикислоти.
Давид Абрагамович (1839—1926) — громадсько-політичний діяч, «подоляк».
Дністрянський Северин (1839—1899) — український педагог, доктор філософії. Перший директор Тернопільської чоловічої учительської семінарії.
Зелений Павло Олександрович (1839—1912) — український політик часів Російської імперії, громадський діяч, письменник, статський радник, одеський міський голова у період 1897—1905 років.
Лівчак Йосип Миколайович (1839—1914) — галицький публіцист, громадський діяч і винахідник; москвофіл.
Юр'євич Антон (1839—1868) — польський діяч в Україні, учасник польського повстання 1863—1864.
Померли
22 січня, Писаревський Степан (1780-ті — 1839) — український драматург, поет.
19 квітня, Кир'яков Михайло Михайлович (1810—1839) — історик-аматор, публіцист, один із засновників Імператорського Одеського товариства історії і старожитностей.
1 жовтня, Йозеф Перль (1773—1839) — єврейський письменник, просвітитель, теолог, громадський діяч, почесний член Берлінського товариства єврейської культури.