Тканинний активатор плазміногену

PLAT
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1A5H, 1BDA, 1PK2, 1PML, 1RTF, 1TPG, 1TPK, 1TPM, 1TPN, 5BRR
Ідентифікатори
Символи	PLAT, T-PA, TPA, plasminogen activator, tissue type
Зовнішні ІД	OMIM: 173370 MGI: 97610 HomoloGene: 717 GeneCards: PLAT
Реагує на сполуку
амінокапронова кислота[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • phosphoprotein binding • serine-type peptidase activity • serine-type endopeptidase activity • signaling receptor binding • hydrolase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • GO:0005578 Позаклітинна матриця • apical part of cell • secretory granule • extracellular region • cell surface • екзосома • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix • Schaffer collateral - CA1 synapse • glutamatergic synapse Біологічний процес • negative regulation of proteolysis • response to hypoxia • фібриноліз • зсідання крові • smooth muscle cell migration • протеоліз • platelet-derived growth factor receptor signaling pathway • plasminogen activation • trans-synaptic signaling by BDNF, modulating synaptic transmission Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5327	18791
Ensembl	ENSG00000104368	ENSMUSG00000031538
UniProt	P00750	P11214
RefSeq (мРНК)	NM_033011 NM_000930 NM_000931 NM_001319189	NM_008872
RefSeq (білок)	NP_000921 NP_001306118 NP_127509	NP_032898
Локус (UCSC)	Хр. 8: 42.17 – 42.21 Mb	Хр. 8: 23.25 – 23.27 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PLAT (англ. Plasminogen activator, tissue type) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 562 амінокислот, а молекулярна маса — 62 917[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDAMKRGLCC		VLLLCGAVFV		SPSQEIHARF		RRGARSYQVI		CRDEKTQMIY
QQHQSWLRPV		LRSNRVEYCW		CNSGRAQCHS		VPVKSCSEPR		CFNGGTCQQA
LYFSDFVCQC		PEGFAGKCCE		IDTRATCYED		QGISYRGTWS		TAESGAECTN
WNSSALAQKP		YSGRRPDAIR		LGLGNHNYCR		NPDRDSKPWC		YVFKAGKYSS
EFCSTPACSE		GNSDCYFGNG		SAYRGTHSLT		ESGASCLPWN		SMILIGKVYT
AQNPSAQALG		LGKHNYCRNP		DGDAKPWCHV		LKNRRLTWEY		CDVPSCSTCG
LRQYSQPQFR		IKGGLFADIA		SHPWQAAIFA		KHRRSPGERF		LCGGILISSC
WILSAAHCFQ		ERFPPHHLTV		ILGRTYRVVP		GEEEQKFEVE		KYIVHKEFDD
DTYDNDIALL		QLKSDSSRCA		QESSVVRTVC		LPPADLQLPD		WTECELSGYG
KHEALSPFYS		ERLKEAHVRL		YPSSRCTSQH		LLNRTVTDNM		LCAGDTRSGG
PQANLHDACQ		GDSGGPLVCL		NDGRMTLVGI		ISWGLGCGQK		DVPGVYTKVT
NYLDWIRDNM		RP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як активація плазміногену, альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Див. також

• Хромосома 8

Примітки

1. Сполуки, які фізично взаємодіють з тканинний активатор плазміногену переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9051 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
5. UniProt, P00750 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.

Література

• РОЛЬ ТКАНИННОГО АКТИВАТОРА ПЛАЗМІНОГЕНУ ТА... 2004
• Ny T., Elgh F., Lund B. (1984). The structure of the human tissue-type plasminogen activator gene: correlation of intron and exon structures to functional and structural domains. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 81: 5355—5359. PMID 6089198 DOI:10.1073/pnas.81.17.5355
• Sasaki H., Saito Y., Hayashi M., Otsuka K., Niwa M. (1988). Nucleotide sequence of the tissue-type plasminogen activator cDNA from human fetal lung cells. Nucleic Acids Res. 16: 5695—5695. PMID 3133640 DOI:10.1093/nar/16.12.5695
• Siebert P.D., Fong K. (1990). Variant tissue-type plasminogen activator (PLAT) cDNA obtained from human endothelial cells. Nucleic Acids Res. 18: 1086—1086. PMID 2107528 DOI:10.1093/nar/18.4.1086
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Itagaki Y., Yasuda H., Morinaga T., Mitsuda S., Higashio K. (1991). Purification and characterization of tissue plasminogen activator secreted by human embryonic lung diploid fibroblasts, IMR-90 cells. Agric. Biol. Chem. 55: 1225—1232. PMID 1368681 DOI:10.1271/bbb1961.55.1225
• Pohl G., Kaellstroem M., Bergsdorf N., Wallen P., Joernvall H. (1984). Tissue plasminogen activator: peptide analyses confirm an indirectly derived amino acid sequence, identify the active site serine residue, establish glycosylation sites, and localize variant differences. Biochemistry. 23: 3701—3707. PMID 6433976 DOI:10.1021/bi00311a020

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»